斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一种斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物及其应用，包括：（1）斧文蛤基因组DNA的提取（２）根据cDNA数据库中斧文蛤的EST序列，获得含有SSR重复的基因序列；（３）SSR标记引物设计；（４）斧文蛤不同地理居群DNA的PCR扩增及扩增产物的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测；（5）获得斧文蛤EST序列区呈现高度遗传变异的多态图谱，对图谱分析可得到斧文蛤每个个体EST-SSR的基因型。本发明专利技术的检测方法具有快速、方便、准确等优点，能够直观的检测出斧文蛤不同个体的基因型。本发明专利技术可应用于斧文蛤群体遗传变异分析、种质资源保护与管理、系谱认证及遗传连锁图谱构建等领域。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域，具体是属于斧文蛤DNA分子遗传标记领域，特别是斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物，以及利用该特异引物的斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物的快速检测方法。
技术介绍
微卫星DNA (Microsatellite DNA)几乎存在于所有真核生物基因组中，由I一6个核苷酸组成的简单序列重复(Simple Sequence Repeats, SSR),是近几十年发展起来的一种新型分子标记技术。微卫星具有数量多、随机分布、多态性高、重复性强、共显性遗传及操作简单等优点，被广泛地应用于群体遗传多样性分析、种质资源保护与管理、遗传连锁图谱构建及QTL定位等领域中。关于微卫星在水产养殖动物中的开发应用已有很多的报道。如:牛东红等报道了缢蛏的10个多态性微卫星标记；Liu等发现了泥蚶的39个多态性微卫星标记；马洪雨等报道了条斑星鲽的31个多态性微卫星标记和圆斑星鲽的40个多态性微卫星标记；李红蕾等发现了栉孔扇贝EST中的3个多态性微卫星标记；曲妮妮报道了合浦珠母贝的9个多态性微卫星标记；Liao等发现了铜鱼的9个多态性微卫星标记；ElfStr0m等开发了扇贝的16个多本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物，其特征在于包括有：FW?134：F：ACTACTAGGAACTTGCAT；R：GACAGTTTGGTTAAGAAT；退火温度为45℃，核心重复序列为(ATG)8；FW?390：F:?GCCATAGTAGTCAGAGGG?；R:?AGAGATTATAGTGAACAAAGC；退火温度为48℃，核心重复序列为(CATT)6；FW?496：F：TTGATCTAGGCAGTCGTT；R：GGCACTTCGTGTAAACAT；退火温度为46℃，核心重复序列为(TG)17；FW?599：F：CTCAATGAATCGGACTGG；R：ATGAAAACTGGATGTCGC...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：刘博，柴雪良，张炯明，滕爽爽，邵艳卿，方军，肖国强，闫茂仓，庞少华，
申请(专利权)人：浙江省海洋水产养殖研究所，
类型：发明
国别省市：