结肠直肠癌的微RNA标志物制造技术

公开了对生物样品中的结肠直肠癌细胞进行诊断或提供预后的方法，所述方法包括检测所述生物样品中RNA序列存在的步骤，所述RNA序列在全序列长度上与选自由SEQ.ID.NOS:1-7构成的组的序列至少有约98%相似性，其中所述RNA序列的存在指示所述样品中结肠直肠癌细胞的存在。还公开了用于对结肠直肠癌进行检测和提供预后的探针。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
所公开的主题通常涉及结肠直肠癌的标志物和检测结肠直肠癌的方法。
技术介绍
已知在一些肿瘤中某些微RNA具有改变的表达。以下现有技术出版物是著名的Ahmed, et al. “Diagnostic MicroRNA Markers for Screening SporadicHumanColon Cancer and Active Ulcerative Colitis in Stool and Tissue (幾便和组织中用于筛查偶发性人结肠癌和活动性溃瘍性结肠炎的诊断用微RNA标志物)”Cancer Genomicsand Proteomics 6:281-296(2009)； 2007 年 I 月 3 日提交的 WO 2007/081470MICR0-RNA BASEDMETH0DS ANDCOMPOSITIONS FOR THE DIAGNOSIS ANDTREATMENT OF SOLID CANCERS (用于诊断和治疗实体癌的基于微RNA的方法和组合物)，Croce, et al.。专利技术概述在一个实施方案中，公开了对生物样品中的结肠直肠癌细胞进行诊断或提供预后的方法，所述方法包括检测所述生物样品中RNA序列存在的步骤，所述RNA序列在全序列长度上与选自由SEQ. ID. N0S: 1-7构成的组的序列至少有约98%相似性，其中所述RNA序列的存在指示所述样品中结肠直肠癌细胞的存在。在可选实施方案中，所述方法还可以包括将样品中所述序列的水平与对照中所述序列的水平进行比较。在可选实施方案中，所述在全序列长度上的相似性可以为至少约99%。在可选实施方案中，所述在全序列长度上的相似性可以为约100%。在可选实施方案中，所述方法还可以包括检测至少2个所述序列。在可选实施方案中，所述方法还可以包括检测至少4个所述序列。在可选实施方案中，所述生物样品可以是粪便样品。在可选实施方案中，所述组可以由SEQ. ID. NOS :4-7构成。在可选实施方案中，所述检测可以包括扩增所述序列。在可选实施方案中，公开了对生物样品中的结肠直肠癌进行诊断或提供预后的方法，所述方法包括检测所述样品中在高严紧性条件下与选自由SEQ. ID. N0S: 1-7构成的组的序列杂交的RNA序列，其中所述RNA序列的存在指示所述样品中结肠直肠癌细胞的存在。在可选实施方案中，所述方法可以包括将所述样品中所述序列的水平与对照中所述序列的水平进行比较。在可选实施方案中，所述方法还可以包括检测至少2个序列或可以包括检测至少4个所述序列。在可选实施方案中，所述样品可以是粪便样品。在可选实施方案中，所述组可以由SEQ. ID. NOS :4-7构成。在可选实施方案中，公开了用于对生物样品中的结肠直肠癌细胞进行诊断或提供预后的试剂盒，所述试剂盒包含适于逆转录与SEQ. ID. NOS: 1_7中的任一项在至少15个连续碱基对上具有至少约98%相似性的RNA的引物。在试剂盒的可选实施方案中，在序列全长度上的序列相似性可以为约100%。在试剂盒的可选实施方案中，所述生物样品可以为粪便样品。在试剂盒的可选实施方案中，所述逆转录产生DNA序列，并且所述试剂盒还包含适于扩增所述逆转录的DNA序列的引物对。在可选实施方案中，公开了用于对生物样品中的结肠直肠癌进行诊断或提供预后的探针，所述探针包括选自SEQ. ID. N0S: 1-7的序列，其中所述序列在高严紧性条件下与所述样品中存在的RNA序列杂交，并且其中所述RNA序列的存在指示所述样品中结肠直肠癌 细胞的存在。附图简要描述图IA是来自对照和CRC受累个体的粪便中miR-221 (SEQ. ID. NO:2)丰度的图示。图IB是来自CRC患者和对照的粪便样品中miR-221 (SEQ. ID. NO:2)的ROC分析。图2A是来自对照和CRC受累个体的粪便中miR-135b(SEQ. ID. NO:2)丰度的图示。图2B是来自CRC患者和对照的粪便样品中miR-135b (SEQ. ID. NO: I)的ROC分析。图3A是来自对照和CRC受累个体的粪便中miR_18a(SEQ. ID. NO:3)丰度的图示。图3B是来自CRC患者和对照的粪便样品中miR_18a(SEQ. ID. NO:3)的ROC分析。图4A是来自对照和CRC受累个体的粪便中miR_19a(SEQ. ID. NO:4)丰度的图示。图4B是来自CRC患者和对照的粪便样品中miR_19a(SEQ. ID. NO:4)的ROC分析。图5A是来自对照和CRC受累个体的粪便中miR_223(SEQ. ID. NO:5)丰度的图示。图5B是来自CRC患者和对照的粪便样品中miR-223 (SEQ. ID. NO:5)的ROC分析。图6A是来自对照和CRC受累个体的粪便中miR_301a(SEQ. ID. NO:6)丰度的图示。图6B是来自CRC患者和对照的粪便样品中miR_301a(SEQ. ID. NO:6)的ROC分析。图7A是来自对照和CRC受累个体的粪便中miR-592(SEQ. ID. NO:7)丰度的图示。图7B是来自CRC患者和对照的粪便样品中miR-592 (SEQ. ID. NO:7)的ROC分析。图8显示了实施方案的一系列人miRNA序列。图9是实施方案中ROC分析和诊断分析的参数表。实施方案的详细描述术语在本公开中，以下术语具有如下所示的含义在本公开中，术语“或”通常的含义包括“和/或”，除非文中内容指明并非如此。在本公开中，术语“生物标志物”或“标志物”表示与疾病相关的诸如基因的物质或变量测量，所述物质或变量测量可以作为该疾病的指示物或预测物。生物标志物或标志物是参数，从中可以推知疾病的存在或风险，并且在实施方案中可以用于确定疾病的预后或提供疾病的检测。在本公开中，术语“核酸”、“核酸序列”等表示多核苷酸，其可以是gDNA、cDNA或RNA，并且可以是单链的或双链的。该术语还包括肽核酸(PNA)，或任何化学上的DNA样或RNA样物质。“cDNA”是指由细胞中天然存在的mRNA制备而来的拷贝DNA。“gDNA”是指基因组DNA。以上的组合也是可能的(即，部分是gDNA且部分是cDNA的重组核酸)。在本公开中，术语“微RNA”或“miRNA”或等同术语表示短的RNA序列，其长度可以是约15-30个核苷酸(或更长或更短)，并且可以是非编码的。在本公开中，术语“R0C”表示“受试者工作特征(receiveroperatingcharacteristic) ”,并且是指核酸分析的方法。ROC分析可以用于评估测试的诊断性能。ROC图是测试在不同截止值的灵敏性％和特异性％的图。ROC曲线可以用于区分2个样品组，例如具有特定特性的对照或正常样品和测试或实验样品。通常，2个样品中所见的分布会重叠，这使其成为确定它们之间是否存在真实差异的很好的工具。如果将ROC分析的区别阈值或特异性设高，则该测试不太可能产生假阳性，即不太可能错误地鉴定2个样品间的差异。然而，在这些情况下，该测试更可能遗漏样品间存在真实差异的情况，并因此更可能会鉴定不出某些病例。如果测试的灵敏性增加，则特异性会相应地下降。因此，如果使测试更敏感，则该测试更可本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：沈祖尧，于君，吴宗华，
申请(专利权)人：香港中文大学，
类型：
国别省市：