一种不基于GC夹板策略的特定18S rDNA片段的DGGE/TGGE分析方法技术

本发明专利技术提供了一种不基于GC夹板策略的特定18SrDNA片段的DGGE/TGGE分析方法，所述特定18SrDNA片段是指包含18SrDNA远离ITS序列的末端区域的片段，以Saccharomycescerevisiae标准菌株NCYC505的18SrDNA序列为参照，所述18SrDNA远离ITS序列的末端区域相当于其起于第1到第30位点范围内任一核苷酸止于第291位点核苷酸的片段。本发明专利技术采用特定18SrDNA片段的DGGE/TGGE分析无需GC夹板，就可以在相同条件下获得同带有GC夹板一致的结果，因此可以节约实验成本、减少实验操作步骤。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及ー种特定18S rDNA片段的DGGE/TGGE分析方法，尤其是指ー种不基于GC夹板策略的特定18S rDNA片段的DGGE/TGGE分析方法。
技术介绍
DGGE (变性梯度凝胶电泳)和TGGE (温度梯度凝胶电泳)是两种基于DNA片段序列差异的电泳技术，早期常用于基因突变的有效检測，目前已经成为微生物菌群多祥性研究的重要手段。采用这两项技术可以分离长度相同但序列不同的DNA片段，片段的分离是依靠双链DNA在含有化学变性剂梯度(DGGE)或者温度梯度(TGGE)的凝胶当中泳动时具有不同的解链行为来实现的。为了尽可能有效地检测序列当中的所有突变，通常在目标片段的 一端加上一段30bp-50bp的高GC片段——由人工合成加在引物的5’端，则经过PCR扩增其产物末端就含有该片段；在进行DGGE或者TGGE分析吋，该高GC区域将使得目标片段在变性梯度环境中不至于完全解链，就可以实现对所有可能的单碱基突变进行检测，此即GC夹板策略。对于菌群结构研究而言，序列各种单碱基差异的有效识别，将有助于菌群多祥性的准确解析。相关研究表明，对于50_1000bp范围内的片段如果采用天然序列本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种不基于GC夹板策略的特定18S?rDNA片段的DGGE/TGGE分析方法，其特征在于：所述特定18S?rDNA片段是指包含18S?rDNA远离ITS序列的末端区域的片段，以Saccharomyces?cerevisiae标准菌株NCYC?505的18S?rDNA序列为参照，所述18S?rDNA远离ITS序列的末端区域相当于其起于第1到第30位点范围内任一核苷酸止于第291位点核苷酸的片段。

【技术特征摘要】
1.一种不基于GC夹板策略的特定18S rDNA片段的DGGE/TGGE分析方法，其特征在于所述特定18S rDNA片段是指包含18S rDNA远离ITS序列的末端区域的片段，以Saccharomyces cereFisiae 标准菌株 NCYC 505 的 18S rDNA 序列为参照,所述 18S rDNA 远离ITS序列的末端区域相当于其起于第I到第30位点范围内任一核苷酸止于第291位点核苷酸的片段。2.根据权利要求I所述的一种不基于GC夹板策略的特定18SrDNA片段的DGGE/TGGE分析方法，其特征在于所述方法包含如下步骤 a、提取所研究样品的基因组DNA；...

【专利技术属性】
技术研发人员：倪莉，黄志清，黄山，靳爽，
申请(专利权)人：福州大学，
类型：发明
国别省市：