3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体及其合成方法和应用技术

3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体及其合成方法和应用，其结构为：??。本发明专利技术的最大优点是作为核酸固相合成的基本原料可以很方便地在寡核苷酸片段中引入一个或者多个硫-磷桥键，合成新型的寡核苷酸序列及其探针。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物
，具体涉及3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体及其合成方法和应用，化学基团修饰的硫代-2’脱氧核糖_3’硝基吡咯亚磷酰胺分子可以用于固相核酸合成的单体原料，其固相合成寡核苷酸产物除了具有传统寡核苷酸的生物学性能外，还具有被化学切割的性能，可以用于核酸、蛋白质等生物大分子的检测。
技术介绍
在分子生物学研究中，DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础，对生命科学至关重要。随着人类基因组计划和各种模式生物基因组计划的开展和完成，使人类步入了后基因时代，分子生物学相关学科得到了迅猛的发展。从基因水平上认识生命的差异，疾病发生、发展的规律，以及药物与生命体的相互作用将成为可能。在基础研究方面，研究疾病基因的遗传规律，克隆致病基因；在应用方面，直接寻找疾病的易感基因突变位点， 可以获得有关与该疾病相关基因型的信息。通过DNA序列信息的分析可以为理解生命的起源、疾病发生、以及个体化医疗等提供有用的相关核酸序列信息。对DNA序列的分析包括位点(如单碱基多态性、甲基化、突变等)，片段序列(如片段重复、缺失等)、全基因组序列分析和DNA蛋白质相互作用。针对这些不同的分析对象，目前已有各种不同的方法相应方法被广泛应用，而这些方法中有许多涉及到核酸需要被切割的手段。如在桥式PCR扩增中需要对一条链进行切除，以获得单链DNA模板用来进行核酸分析；在DNA与蛋白质的序列特异性识别和相互作用检测中，需要借助核酸片段是否能够切割来判断双链DNA是否与蛋白质发生了结合，从而达到非标记检测蛋白的目的；在基于标记荧光的高通量测序过程中，需要将每次测序中的标识荧光分子切除，以便顺利进行下一个位置碱基的序列测定等。要实现这些不同的切割的手段，目前需要针对核酸片段进行特殊的修饰，或者采用特定的酶切或者化学切割方法，这些方法中要么合成难度大，或者难于找到合适的切割试剂而给研究工作带来困难。本专利技术制备的是3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺分子可以作为固相核酸合成的基本原料，通过广泛使用的核酸合成仪在合成的序列片段中很方便的引入硫代-2’脱氧核糖_3’硝基吡咯来实现核酸序列分析中切割方法的实现。由于引入的硫代-2’脱氧核糖_3’硝基吡咯(简写成“M”)具有通用碱基的性能，能很好的和4种碱基配对，在任何位置均能满足与四个碱基的杂交效果，且比其它通用碱基具有更平均的杂交温度(Bergstrom, D. E.，et al. Synthesis, structure, and deoxyribonucleic acid sequencing with a universal nucleoside :1-(2' -Deoxy-β -D-rinbofuranosyl)-3-nit ropyrrole. J. Am. Chem. S0C. 1995，117，1201-1209)，能够在核酸分析中得到广泛的应用。
技术实现思路
解决的技术问题本专利技术的目的是提供3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体及其合成方法和应用，为新的核酸序列分析技术所能利用的试剂，为新核酸序列分析技术的低成本、高速度和高通量奠定基础。技术方案3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体，结构为权利要求1.3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体，其特征在于结构为2.权利要求1所述的3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体的合成方法，其特征在于具有如下结构3.权利要求1所述3’硫代-2’脱氧核糖_3’硝基吡咯亚磷酰胺单体在核酸、蛋白质生物大分子检测中的应用。全文摘要3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体及其合成方法和应用，其结构为 。本专利技术的最大优点是作为核酸固相合成的基本原料可以很方便地在寡核苷酸片段中引入一个或者多个硫-磷桥键，合成新型的寡核苷酸序列及其探针。文档编号C07H19/044GK102516337SQ201110341249公开日2012年6月27日 申请日期2011年11月2日 优先权日2011年11月2日专利技术者王文捷, 肖鹏峰, 谢宏梅, 钱晓婷, 陆祖宏 申请人:东南大学本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：肖鹏峰，钱晓婷，王文捷，谢宏梅，陆祖宏，
申请(专利权)人：东南大学，
类型：发明
国别省市：