诊断标志物的估计制造技术

本发明专利技术涉及一种用于估计例如蛋白质的特定生物标志物的浓度或浓度变化的方法。该估计通过为数学模型提供来自对例如其它蛋白质的其它生物标志物的测量的数据来执行。因此取代测量这些特定蛋白质的是，可以使用该模型来估计它们。所估计的蛋白质可以与其它临床数据一起在能够提供对例如患者疾病的信息或估计的另一个模型中使用。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术总体涉及一种用于估计生物标志物的方法，特别是涉及使用模型从测量的 生物标志物来估计生物标志物。
技术介绍
众所周知，在进行诊断时，使用比如血压的测量结果或诸如蛋白质的生物材料 的测量结果的各种生物标志物来帮助临床医师。然而，对若干种蛋白质的测量在技术 上可能是困难的或者甚至是不可能的，这是因为用于测量特定生物标志物的生物测定 (bio-assay)甚至可能是没有的。因此，由于使用若干或昂贵的生物测定的技术性困难或经济考虑，测量若干种生 物标志物是困难的或不切实际的。然而，为了获得可靠的诊断，测量若干种生物标志物可能 是必需的。WO 2006/002240公开了一种用于构造分类器的方法，该分类器使用来自血液样本 的分子标志物数据来区别特性子群(traitsubgroup)。该专利技术进一步包含在多种应用中分 类器的使用和由分类器识别的分子标志物的组合，所述应用包括诊断；预后；疾病、疾病 阶段或疾病危险性的预测。该专利技术进一步提供多种选定的分子标志物和一种用于识别对诊 断感兴趣的特定特性(trait)有用的、选定的分子标志物的组合的装置。因此，WO 2006/002240成功地识别了对诊断有用的特定分子标志物。然而，WO 2006/002240没有成功地简化建议诊断的任务，因为对所有分子标志物进行测量以便进行 诊断的需求可能需要不同的生物测定、可能是耗时的以及可能给患者造成压力。
技术实现思路
因此，本专利技术优选地设法单独地或以任何组合的方式减轻、缓解或消除一个或多 个上述问题。特别地，可以看出，本专利技术的目的是提供一种能够简化建议诊断的任务或提供 对进行诊断或确定患者的其它状况有用的信息的方法和设备(apparatus)。该目的是通过 提供一种用于根据测量的生物标志物确定估计的生物标志物的方法来实现的。在本专利技术的第一方面中，通过提供根据独立权利要求的方法来达到该目的和若干 其它目的。本专利技术特别地但非独占地有利于根据测量的生物标志物估计生物标志物。因此，本专利技术的第一方面的实施例涉及一种用于根据测量的生物标志物确定估计 的生物标志物的方法，其中该方法包括，-接收表示测量的生物标志物的输入数据，-使用生物模型处理该输入数据以便确定估计的生物标志物，-经由输出设备提供估计的标志物。因而，通过仅仅测量一种或多种生物标志物(例如蛋白质)，该方法使得能够基于 测量的标志物来确定其它一种或多种估计的生物标志物。因此，可以有这样的优点，即不必测量所有的生物标志物以提供足够的信息以使得能够确定患者的状况，因为可以根据一种 或多种测量的生物标志物来估计一些所需的生物标志物。例如，测量特定的生物标志物在 技术上可能是困难的，且因此可以期望根据其它测量的标志物估计该特定生物标志物。而 且，可以有这样的优点，即病人不需要遭受众多取样。所测量的生物标志物可以已经从生物样本中获得，S卩，它可以已经从对已经从患 者移除的生物样本的先前分析获得。所测量的生物标志物还可以已经从包含测量的数据的 列表的数据库中获得。可替代地，所测量的数据可以通过使用医学分数(由专业医生给出 的分数，该分数可以基于他/她自己的知识和经验)获得，以便估计特定生物标志物的可 能范围(如果通过识别这些标志物和该分数之间的关联而从先前的研究知道这些范围存 在)。应当理解，经由输出设备提供估计的标志物可以包括生成表示所述一种或多种估 计的标志物的信号或在显示器上例如作为数据列表来提供估计的标志物。 所述生物标志物可以包括选自包含以下的列表的生物标志物蛋白质、代谢物、遗 传多态现象、基因拷贝数变化或任何其它可以与最终蛋白质状态、其亚型或蛋白质复合物 相关的分子实体。在一实施例中，所述生物模型可以是能够对不同生物标志物之间的动态相互作用 进行建模的模型。例如，所述生物模型可以能够描述一种蛋白质的浓度在另一种蛋白质的 浓度变化时的变化之间的关系。在一实施例中，所述输入数据进一步包括选自包含但不限于下述的列表的临床数 据年龄、性别、当前或先前的疾病、当前或先前的治疗方法、治疗药物的剂量和测量的生物 因素。有利地是，所述方法能够接收并处理除了仅仅生物标志物以外的其它输入数据。因 此，通过接收并处理例如测量的血压的其它临床数据，所述生物模型可以能够以更高的准 确性估计生物标志物，或一些估计的生物标志物可以使用临床数据的知识来排除(例如如 果所估计的生物标志物不在附加的临床数据的约束的范围内的话)。因此，附加的临床数据 可以用于通过排除错误的估计来约束多个估计。在一实施例中，接收输入数据的方法包括接收第一输入数据和接收第二输入数 据，其中第一输入数据和第二输入数据是在不同的时间点接收的。因此通过连续地接收输 入数据，即，通过最初接收第一输入数据，随后在一段时间之后接收第二数据，并以此类推， 获得一系列输入数据或输入数据的历史。输入数据的这种历史可以改善生物模型的能力从 而以更高的准确性估计生物标志物，这是因为该模型逐渐地适于特定的患者。因为输入数 据可以在每当提供新输入数据时被处理，所以输入数据的完整历史或历史片段可以在新输 入数据到达时被处理，或当新输入数据到达时仅最近的输入数据被处理。在一实施例中，测量的生物标志物是生物标志物的浓度，可替代地是该生物标志 物的浓度变化。类似地，在一实施例中，估计的生物标志物是该生物标志物的浓度，可替代地是该 生物标志物的浓度变化。在一实施例中，所述方法进一步包括以下步骤使用包括测量的生物标志物、估计 的生物标志物和临床数据中的一个或多个来估计患者状况，其中对患者状况的估计包括使 用将所述患者数据关联到患者状况的患者状况模型来处理所述患者数据。因此，当估计的生物标志物已经被确定时，患者状况可以被估计出或以其它方式从患者数据推知。在第二方面，本专利技术涉及一种根据独立权利要求的医疗设备。在第三方面，本专利技术涉及一种包括根据第二方面的医疗设备和患者状况设备的临 床系统，该患者状况设备包括用于使用患者数据估计患者状况的处理装置。该患者状况设 备还可以包括用于在显示器上提供作为信号或信息的患者状况。在一实施例中，该临床系 统可以进一步包括分析设备，其用于接收生物样本、处理该样本并提供测量的生物标志物。在第四方面，本专利技术涉及一种计算机程序产品，其适于使得包括具有与该程序产 品相关联的数据存储装置的至少一个计算机的计算机系统能够执行根据本专利技术的第一方 面的方法。本专利技术的这个方面是特别地但非独占地有利之处在于，因为本专利技术可以由使得计 算机系统能够执行本专利技术的第二方面的操作的计算机程序产品来实现。这种计算机程序产 品可以在任何类型的计算机可读介质(例如，基于磁性或光学的介质)上或通过基于计算 机的网络(例如，国际互联网)来提供。本专利技术的第一、第二、第三和第四方面中的每一个方面可以与任何其它方面组合。 通过参照下面描述的实施例，本专利技术的这些和其它方面将变得显然并被阐明。总之，本专利技术涉及一种用于估计特定生物标志物(比如蛋白质)的浓度或浓度变 化的方法。因此，该方法使得能够作出关于例如诊断的血液标志物(例如它们的浓度和属 性)的声明(statement)而无需直接测量它们。所述估计通过为数学模型提供来自对例如 其它蛋白质的其它生物标志物的测量数据来执行。因此，取代测量本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于根据测量的生物标志物确定估计的生物标志物的方法，该方法包括，－接收表示所测量的生物标志物的输入数据，－使用生物模型处理所述输入数据以用于确定所估计的生物标志物，－经由输出设备提供所估计的标志物。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：S库尔金，BJ巴克，R范登哈姆，
申请(专利权)人：皇家飞利浦电子股份有限公司，
类型：发明
国别省市：NL[荷兰]