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胃癌发生相关分子标志物lncRNA HOTTIP的检测及应用制造技术

技术编号:12293431 阅读:138 留言:0更新日期:2015-11-08 01:18
本发明专利技术涉及胃癌分子标志物长链非编码 RNA HOTTIP,其可应用于胃癌辅助诊断及胃癌发生预测的试剂盒。根据该长链非编码RNA序列,设计并合成特异性实时荧光定量PCR引物,制备用于胃癌辅助诊断的试剂。通过实时荧光定量PCR发现,HOTTIP在胃癌组织与癌旁正常组织中存在差异性表达,且在胃癌组织中表达下调。可用于胃癌发生的评估与诊断,有助于筛查胃癌的高危个体,指导临床制定合理的监测、随访、处理及治疗方案。

【技术实现步骤摘要】

: 本专利技术属于肿瘤分子生物学领域,具体而言,本专利技术涉及一种与胃癌发生相关的 肿瘤分子标志物IncRNA HOTTIP及其辅助诊断试剂盒。
技术介绍
: 长链非编码RNA(long non-coding RNA, IncRNA)是一类长度大于200bp核苷酸, 缺少特异开放阅读框,不具备蛋白质编码功能的一类RNA分子。近年来研究显示,IncRNA 参与表观遗传修饰,在基因表达调控中起重要作用,目前IncRNA在肿瘤、血液病、心血管疾 病等多种疾病的临床诊断、治疗及预后评价等领域发挥了重要作用。 中国是一个胃癌大国,我国的胃癌具有发病率和病死率尚、早期胃癌比例低、进展 期病例为主要诊治对象等特点。然而现有的肿瘤标志物CEA、CA19-9、CA50、CA125在胃癌 中的敏感度与特异性并不高。因此,寻找可靠的生物标志物作为早期诊断依据和可靠的治 疗靶点成为当务之急。如果能通过新的分子生物标志物对胃癌发生进行有效预测,筛查胃 癌的高危个体,指导临床制定合理的监测、随访、处理及治疗方案,这将极大地提高我国胃 癌的综合防治水平。 最新研究发现,IncRNA与胃癌的关系密切,可以作为致癌或者抑癌分子参与胃 癌发生、发展、转移。同源基因 A末端转录本反义RNA(HOXA transcript at the distal tip,H0TTIP),位于第7号染色体上,与同源基因 A13(H0XA 13)相邻。已有研究发现,HOTTIP 在肝癌及胰腺癌中表达上调,并促进肿瘤的侵袭及增值,可作为肝癌及胰腺癌的新型肿瘤 分子标志物。但是HOTTIP与胃癌关系的研究仍处于空白阶段。研究发现相对于癌旁正常 组织,HOTTIP在胃癌组织中表达显著下调。因此,IncRNA HOTTIP有望成为辅助胃癌诊断 的新型分子标志物。
技术实现思路
: 专利技术目的: 本专利技术提供一种与胃癌发生相关的肿瘤分子标志物IncRNA HOTTIP及其检测试剂 盒,可对胃癌发生进行有效预测以及用于胃癌的辅助诊断。 技术方案: 与胃癌发生相关的肿瘤分子标志物IncRNA Η0ΤΤΙΡ,其特征在于:分子标志物 IncRNA HOTTIP 的基因序列为 SEQ ID NO. 1。 上述与胃癌发生相关的肿瘤分子标志物IncRNA HOTTIP的用途,其特征在于:用 于制备胃癌辅助诊断、胃癌发生预测试剂盒中的应用。 上述的与胃癌发生相关的肿瘤分子标志物IncRNA HOTTIP的诊断试剂盒,其特征 在于:该试剂盒包括: ⑴组织中总RNA提取试剂; (2)反转录试剂; (3)实时荧光定量PCR试剂; 其中,实时荧光定量PCR试剂包含与胃癌发生相关的肿瘤分子标志物HOTTIP的特 异性引物: HOTTIP 上游引物:5'-CGTAGAGACACAGGCAGCAG-3'(SEQ ID NO. 2); 下游引物:5'-CAGCCGAACAGAGTCAGAGG-3'(SEQ ID NO. 3); GAPDH 上游引物:5'-CGGATTTGGTCGTATTGGG-3'(SEQ ID NO. 4); 下游引物:5' -CTGGAAGATGGTGATGGGATT-3'(SEQ ID NO. 5)。 优点及效果: 本专利技术提出了一种与胃癌发生相关的肿瘤分子标志物IncRNA HOTTIP及其检测试 剂盒,具有如下优点: 本专利技术提供一种与胃癌发生相关的肿瘤分子标志物IncRNA HOTTIP及应用方法; IncRNA Η0ΤΤΙΡ,位于第7号染色体上,与同源基因 A13(H0XA 13)相邻,可应用于辅助胃癌 诊断的试剂盒中,该IncRNA HOTTIP基因序列详见SEQ NO: 1。 在对胃癌组织及其配对癌旁正常组织中,通过实时荧光定量分析发现,IncRNA HOTTIP在胃癌组织表达下调。同时HOTTIP在胃癌组织与癌旁正常组织中存在差异性 表达(Ρ〈0·01),且在胃癌组织中表达下调。受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,R0C 曲线)分析后曲线下面积(Area Under Curve,AUC)为 0· 767〇 以上结果表明在组织中的低表达IncRNA HOTTIP可能成为新型胃癌诊断标志物。本专利技术为 胃癌的辅助诊断提供了强有力的分子生物学工具,具有深远的临床意义和重要的推广应用 前景。【附图说明】: 图1为实时荧光定量PCR分析IncRNA HOTTIP在胃癌组织的相对表达量(通 过-Δ Δ Ct值计算)。 图2为实时荧光定量PCR分析IncRNA HOTTIP在胃癌组织与癌旁正常组织中的表 达差异(2 Aet值比较,#Ρ〈0· 01)。 图3为胃癌组织与癌旁正常组织中IncRNA HOTTIP的ROC曲线分析。【具体实施方式】: 以下结合实施例旨在进一步说明本专利技术,而不能理解为对本专利技术的限制。在不脱 离本专利技术的原理和宗旨的情况下可以对这些实施例进行多种变化、修改、替换和变型。 本专利技术提供了一种新的与胃癌相关的IncRNA HOTTIP的应用方法。该方法证实 IncRNA HOTTIP可用于胃癌患者的诊断,IncRNA HOTTIP在胃癌中的表达与正常胃组织相比 显著降低,且此方法准确性高。 本专利技术提供了与胃癌发生相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,IncRNA) HOTTIP肿瘤分子标志物及其试剂盒的应用。IncRNA HOTTIP,位于第7号染色体上,与同源 基因 A13(H0XA 13)相邻,序列详见SEQ ID N0:1。。已有研究发现,HOTTIP在肝癌及胰腺癌 中表达上调,并促进肿瘤的侵袭及增值,可作为肝癌及胰腺癌的新型肿瘤分子标志物。专利技术 人研究发现相对于癌旁正常组织,HOTTIP在胃癌组织中表达显著下调。IncRNA与胃癌的关 系密切,可以作为致癌或者抑癌分子参与胃癌发生、发展、转移。因此,IncRNA HOTTIP有望 成为辅助胃癌诊断的新型分子标志物。 在94对胃癌组织及其配对癌旁正常组织中,通过实时荧光定量分析发现,78对组 织中IncRNA HOTTIP在胃癌组织表达下调(图1)。同时HOTTIP在胃癌组织与癌旁正常组 织中存在差异性表达(P〈〇. 01)(图2),且在胃癌组织中表达下调。受试者工作特征曲线 (receiver operating characteristic curve,R0C 曲线)分析(图 3)后曲线下面积(Area Under Curve,AUC)为0.767。以上结果表明在组织中的低表达IncRNA HOTTIP可能成为新 型胃癌诊断标志物。本专利技术为胃癌的辅助诊断提供了强有力的分子生物学工具,具有深远 的临床意义和重要的推广应用前景。 与胃癌发生相关的肿瘤分子标志物IncRNA Η0ΤΤΙΡ,其特征在于:分子标志物 IncRNA HOTTIP 的基因序列为 SEQ ID NO. 1。 上述与胃癌发生相关的肿瘤分子标志物IncRNA HOTTIP的用途,可用于制备胃癌 辅助诊断、胃癌发生预测试剂盒中的应用。 试剂盒为实时荧光定量PCR检测试剂盒。 上述与胃癌发生相关的肿瘤分子标志物IncRNA HOTTIP的诊断试剂盒本文档来自技高网
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【技术保护点】
与胃癌发生相关的肿瘤分子标志物lncRNA HOTTIP,其特征在于:分子标志物lncRNA HOTTIP的基因序列为SEQ ID NO.1。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:王振宁宋永喜杨宇翀马斌高鹏王嘉俊赵俊华王俊
申请(专利权)人:王振宁
类型:发明
国别省市:辽宁;21

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