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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物检测领域,具体涉及一种基于双重lamp-lfd检测猪链球菌和副猪格拉瑟菌的方法。
技术介绍
1、猪链球菌(streptococcus suis,ss)和副猪格拉瑟菌(glaesserella parasuis,gps)是感染猪群中常见重要致病菌,其临床症状和病理变化相似,均可引起败血症、多发性浆膜炎、脑膜炎、关节炎和肺炎等。根据荚膜多糖的不同,将猪链球菌分为35个血清型(1~34型和1/2型),其中1、2、1/2、7、9、14型为猪群中的主要致病血清型,尤以血清2型流行最广,危害最为严重。临床上副猪格拉瑟菌有15个血清型,各地流行菌株血清型不一。近年来,从临床典型病例中可分离出1、2、4、5、6、7、9、12、14型等血清型,但以4、5、12型最为常见,各血清型之间缺乏免疫交叉保护能力。猪链球菌和副猪格拉瑟菌易混合感染,且症状相似临床难以区分,因此,开发灵敏特异的诊断技术,对于疫病防控意义重大。
2、当前针对猪链球菌和副猪格拉瑟菌诊断方法主要包括流行病学、病原分离与鉴定、分子生物学和血清学检测方法。其中病原分离与鉴定操作繁杂,周期长,临床应用少;常规pcr、荧光定量pcr等分子生物学检测方法虽然具有特异性强、灵敏度高等优点,但是所需仪器较为昂贵、需要专业操作人员,也不利于临床现场使用。凝集试验、elisa等血清学检测也存在对实验材料要求高、且无法实现同时检测此两种病原等缺点。
3、环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,lam
技术实现思路
1、本专利技术所要解决的技术问题为:如何提供一种快速检测猪链球菌和副猪格拉瑟菌的双重lamp-lfd试剂盒及其检测方法,从而实现快速诊断猪链球菌和副猪格拉瑟菌病原,达到及时防控。
2、本专利技术的技术方案为:基于双重lamp-lfd检测猪链球菌和副猪格拉瑟菌的引物组合,包括两组lamp引物,用于扩增猪链球菌的lamp引物为:ss-f3的核苷酸序列如seqidno.1所示;ss-b3的核苷酸序列如seq id no.2所示;ss-fip的核苷酸序列如seq id no.3所示;ss-bip的核苷酸序列如seq id no.4所示;用于扩增副猪格拉瑟菌的lamp引物为:gps-f3的核苷酸序列如seq id no.5所示;gps-b3的核苷酸序列如seq id no.6所示;gps-fip的核苷酸序列如seq id no.7所示;gps-bip的核苷酸序列如seq idno.8所示。
3、进一步地,所述引物ss-fip的5’端标记有biotin,所述引物ss-bip的5’端标记有6-fa m;所述引物gps-fip的5’端标记有biotin,所述引物gps-bip的5’端标记有digoxigenin。
4、基于双重lamp-lfd检测猪链球菌和副猪格拉瑟菌的试剂盒,所述试剂盒含有上述所述的引物组合。
5、进一步地,所述试剂盒还包括lamp反应预混液、bst iidna聚合酶、扩增产物稀释液、横向流动试纸条、阴性对照或阳性对照中的一种或多种。
6、非疾病诊断目的基于双重lamp-lfd检测猪链球菌和副猪格拉瑟菌的方法,包括如下步骤:
7、(1)提取待检测样本的基因组dna;
8、(2)以步骤(1)提取的dna为模板,以上述所述的引物组合进行lamp扩增;
9、(3)将扩增产物加入横向流动试纸条,根据横向流动试纸条信息判断待检测样本是否含有猪链球菌或/和副猪格拉瑟菌。
10、进一步地,所述lamp扩增的反应体系为:模板dna 2μl,权利要求1或2所述的引物组合共1.6μl,2×lamp反应预混液5μl,bst iidna聚合酶2μl、ddh2o 14.4μl;所述lamp扩增的反应程序为:62℃40min。
11、进一步地,所述引物组合的组成为:ss-f30.1μl、ss-b30.1μl、ss-fip 0.2μl、ss-bip 0.2μl、gps-f30.1μl、gps-b30.1μl、gps-fip 0.4μl、gps-bip 0.4μl。
12、与现有技术相比,本专利技术具有以下有益效果:
13、本专利技术主要针对猪链球菌特异性gdh基因和副猪格拉瑟菌特异性infb基因,成功开发双重lamp-lfd试剂盒及其检测方法,从而实现猪链球菌病和副猪格拉瑟病病原核酸快速鉴别诊断,为猪链球菌病和副猪格拉瑟病防控提供有效技术支撑。
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1.基于双重LAMP-LFD检测猪链球菌和副猪格拉瑟菌的引物组合,其特征在于,包括两组LAMP引物,用于扩增猪链球菌的LAMP引物为:SS-F3的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;SS-B3的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;SS-FIP的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示;SS-BIP的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示;用于扩增副猪格拉瑟菌的LAMP引物为:GPS-F3的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示;GPS-B3的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示;GPS-FIP的核苷酸序列如SEQ ID No.7所示;GPS-BIP的核苷酸序列如SEQ ID No.8所示。
2.根据权利要求1所述的引物组合,其特征在于,所述引物SS-FIP的5’端标记有Biotin,所述引物SS-BIP的5’端标记有6-FAM;所述引物GPS-FIP的5’端标记有Biotin,所述引物GPS-BIP的5’端标记有Digoxigenin。
3.基于双重LAMP-LFD检测猪链球菌和副猪格拉瑟菌的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有权利要求1或2所述的引
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括LAMP反应预混液、BstIIDNA聚合酶、扩增产物稀释液、横向流动试纸条、阴性对照或阳性对照中的一种或多种。
5.非疾病诊断目的基于双重LAMP-LFD检测猪链球菌和副猪格拉瑟菌的方法,其特征在于,包括如下步骤:
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述LAMP扩增的反应体系为:模板DNA 2μL,权利要求1或2所述的引物组合共1.6μL,2×LAMP反应预混液5μL,Bst IIDNA聚合酶2μL、ddH2O 14.4μL;所述LAMP扩增的反应程序为:62℃40min。
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述引物组合的组成为:SS-F30.1μL、SS-B30.1μL、SS-FIP 0.2μL、SS-BIP 0.2μL、GPS-F30.1μL、GPS-B30.1μL、GPS-FI P 0.4μL、GPS-BIP 0.4μL。
...【技术特征摘要】
1.基于双重lamp-lfd检测猪链球菌和副猪格拉瑟菌的引物组合,其特征在于,包括两组lamp引物,用于扩增猪链球菌的lamp引物为:ss-f3的核苷酸序列如seq id no.1所示;ss-b3的核苷酸序列如seq id no.2所示;ss-fip的核苷酸序列如seq id no.3所示;ss-bip的核苷酸序列如seq id no.4所示;用于扩增副猪格拉瑟菌的lamp引物为:gps-f3的核苷酸序列如seq id no.5所示;gps-b3的核苷酸序列如seq id no.6所示;gps-fip的核苷酸序列如seq id no.7所示;gps-bip的核苷酸序列如seq id no.8所示。
2.根据权利要求1所述的引物组合,其特征在于,所述引物ss-fip的5’端标记有biotin,所述引物ss-bip的5’端标记有6-fam;所述引物gps-fip的5’端标记有biotin,所述引物gps-bip的5’端标记有digoxigenin。
3.基于双重lamp-lfd检测猪链球菌和副猪格拉瑟...
【专利技术属性】
技术研发人员:朱良全,王豪杰,辛凌翔,刘燕,胡云皓,张存帅,李建,姚文生,刘元杰,马欣,赵浩然,王雅茜,
申请(专利权)人:中国兽医药品监察所,
类型:发明
国别省市:
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