【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子诊断领域，特别是涉及用于高灵敏度甲状腺结节良恶性辅助诊断的ngs检测方法。
技术介绍
1、甲状腺癌是内分泌系统常见的恶性肿瘤之一，主要特征为无痛性甲状腺结节，表现为甲状腺组织局部生长或含有液体的囊肿而形成肿块。甲状腺癌按病理类型分为四大类，包括乳头状癌(ptc)、滤泡状癌(ftc)、未分化癌(atc)和髓样癌(mtc)，其中乳头状癌和滤泡状癌合称为分化型甲状腺癌(dtc)，占全部甲状腺癌的90％以上。细针穿刺(fna)细胞学检测是甲状腺结节术前良恶性诊断的传统金标准，但由于良性和恶性结节的细胞学特征经常有重叠，仍有15％～25％的甲状腺结节通过fna检查不能确定性质，这类患者在临床处理上相对盲目，易导致过度诊断和后续的过度治疗。
2、对于不能确诊的甲状腺结节，nccn、ata、ace等指南中都建议辅助进行分子标志物检测。我国的相关指南和专家共识中也提出，建议fna联合分子标志物检测来进一步提高术前诊断的准确率。基因检测在甲状腺癌辅助诊断中发挥着越来越重要的作用，不仅可以提高术前诊断准确性，还有助于确定最佳的治疗与随访方案，避免过度诊疗带来的多方面不良影响。因此，基因检测对于辅助甲状腺结节的良恶性诊断和甲状腺癌不同病理分型具有重要意义，同时也为预后判断和靶向治疗提供了全新的方向。
3、为进一步提高诊断性能，需要纳入更多的新进发现的甲癌分子标志物，并提供持续评估预示新标志物的方法的可能，包括诸如基因组驱动突变或基因融合事件等。
技术实现思路
1
2、为实现上述目的及其他相关目的，本申请第一方面提供用于甲状腺结节良恶性辅助诊断的基因群组，包括以下单基因：
3、akt1、alk、apc、atm、banp、braf、cdk12、cdkn2a、chek2、ctnnb1、dicer1、egfr、eif1ax、ep300、erbb4、ezh1、fam193a、farsb、fgfr1、fgfr2、fgfr3、fgfr4、flt3、glis3、gnaq、gnas、hras、idh1、idh2、kit、klk1、kmt2c、kmt2d、kras、lrp1b、men1、met、mtor、ncor2、nf1、nf2、notch1、nras、ntrk1、ntrk3、pik3ca、plekhs1、por、pparg、pten、pth、rb1、rbm10、ret、ros1、smad4、spop、stk11、sugct(c7orf10)、tp53、trim61、tsc2、tshr、vhl、znf148和tert。
4、本申请第二方面提供一种试剂盒，所述试剂盒中包括检测如前述的基因群组的物质。
5、本申请第三方面提供前述的基因群组或前述的试剂盒在制备甲状腺结节良恶性辅助诊断产品中的用途。
6、本申请第四方面提供一种非疾病诊断目的的用于甲状腺结节良恶性辅助诊断的方法，包括以下步骤：
7、1)从样本中提取dna和rna；
8、2)对步骤1)的dna进行分管叠瓦式多重扩增构建测序文库；
9、3)对步骤1)的rna进行逆转录后多重扩增构建测序文库；
10、4)将步骤2)和步骤3)的测序文库进行生物信息分析，根据前述的基因群组的信息判断甲状腺结节良恶性。
11、本申请第五方面提供一种测序文库，采用前述的方法中的步骤1)至3)构建获得。
12、本申请第六方面提供前述的测序文库在甲状腺结节良恶性辅助诊断高通量测序中的应用。
13、本申请第七方面提供一种用于甲状腺结节良恶性辅助诊断的系统，包括：
14、数据模块，用于获取样本dna测序文库和rna测序文库的信息，所述信息包括前述的基因群组的信息；
15、数据分析模块，用于根据前述的基因群组的信息判断甲状腺结节良恶性。
16、本申请第八方面提供一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现前述的方法中的步骤4)的分析步骤。
17、本申请第九方面提供一种终端，包括：处理器及存储器；
18、所述存储器用于存储计算机程序；
19、所述处理器用于执行所述存储器存储的计算机程序，以使所述终端执行前述的方法中的步骤4)的分析步骤。
20、与现有技术相比，本申请具有以下有益效果：
21、本专利技术通过提出特定的panel组合范围，围绕其设计特定的扩增建库流程，结合指南，比传统方法检测甲状腺癌的灵敏度更高，本申请与现有技术相比，检测时间相似的情况下，可达到85％以上的灵敏度。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.用于甲状腺结节良恶性辅助诊断的基因群组，包括以下单基因；
2.如权利要求1所述的基因群组，其特征在于，还包括融合基因，所述融合基因为第一基因断点的上游区段和第二基因断点的下游区段融合形成；
3.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中包括检测如权利要求1～2任一所述的基因群组的物质。
4.如权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，检测基因群组的物质包括结合基因群组的核酸分子、蛋白质、多肽或抗体；优选地，所述结合基因群组的核酸分子为引物。
5.如权利要求1～2任一所述的基因群组或如权利要求3～4任一所述的试剂盒在制备甲状腺结节良恶性辅助诊断产品中的用途。
6.一种非疾病诊断目的的用于甲状腺结节良恶性辅助诊断的方法，包括以下步骤：
7.如权利要求6所述的方法，其特征在于，步骤1)中，所述样本选自甲状腺结节新鲜组织样本、穿刺活检细胞样本或石蜡包埋的固定组织样本；
8.如权利要求7所述的方法，其特征在于，步骤2)中，当DNA检测对象为TERT基因时，分管叠瓦式多重扩增的覆盖范围还包含其启动子区域。
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。