一种芳姜黄酮对黄曲霉作用机制的研究方法技术

本发明专利技术公开了一种芳姜黄酮对黄曲霉作用机制的研究方法，包括RNA检测、建库测序、上机测序、RNA测序数据的质量控制、转录组数据与参考基因组比对、基因表达定量及差异基因分析、差异表达基因功能注释和富集分析。本发明专利技术利用测序技术及通过其相关生物学信息的分析，首次公开了芳姜黄酮对黄曲霉的作用机制，为防治黄曲霉污染提供了新的路径及思路，对黄曲霉污染的防治有重要意义。的防治有重要意义。的防治有重要意义。

【技术实现步骤摘要】
一种芳姜黄酮对黄曲霉作用机制的研究方法


[0001]本专利技术涉及生物检测
，尤其是涉及一种芳姜黄酮对黄曲霉作用机制的研究方法。

技术介绍

[0002]黄曲霉(Aspergillus flavus)是广泛分布于自然界的腐生好氧真菌，生长和扩散能力极强。黄曲霉可以寄生于粮食、食品及饲料中进行生长繁殖，并产生黄曲霉毒素。黄曲霉毒素(aflatoxin，AFT)是一组化学结构类似于二呋喃香豆素的衍生化合物。目前已发现的黄曲霉毒素及其衍生物约有20种，包括B1、B2、G1、G2、M1、M2等，前四种由霉菌污染后直接产生，并存在于植物性食物和饲料中，后两种则是哺乳动物食用了黄曲霉毒素污染的饲料所产生的耐热性羟化代谢产物，其中B1的危害最大，具有显著的导致癌变、畸形、诱导突变和造成免疫力抑制等作用，同时摄入或吸入大量该毒素可引起人和动物肝功能损伤等。黄曲霉毒素通常在全世界温暖的气候中感染粮食作物，包括玉米、花生、树坚果、椰干、香料、棉籽等。目前全球每年有25％农作物被霉菌毒素污染，我国花生和玉米被黄曲霉污染的情况比较普遍，畜禽饲料和水产饲料的黄曲霉污本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种芳姜黄酮对黄曲霉作用机制的研究方法，包括下列步骤：S1、RNA检测：取经芳姜黄酮处理的黄曲霉菌丝为测试组样品，未经芳姜黄酮处理的黄曲霉菌丝为对照组样品，进行RNA检测；S2、建库测序；S3、上机测序：将单链环状DNA分子通过滚环复制形成DNA纳米球，将得到的DNA纳米球加到芯片上的网状小孔内进行测序；S4、RNA测序数据的质量控制；S4、转录组数据与参考基因组比对；S5、基因表达定量及差异基因分析：对样品中的Mapped Reads的数目和转录本长度进行计算处理，用于不同样本间及组间的横向比较，以及进行样本组之间的差异表达基因分析；S6、差异表达基因功能注释和富集分析。2.根据权利要求1所述的研究方法，其特征在于，步骤S2所述建库测序的方法为：打开消化RNA样品的二级结构，将所述二级结构片段化，使用PCR合成一链和二链cDNA，修复末端、连接接头，进行PCR扩增，将PCR产物变性为单链后，采用环化反应体系反应得到单链环形产物，消化掉未被环化的线性DNA分子，得到最终文库。3.根据权利要求1所述的研究方法，其特征在于，步骤S1所述RNA检测包括检测样本浓度、RIN/RQN值、28S/18S。4.根据权利要求1所述的研究方法，其特征在于，步骤S2所述建库...

【专利技术属性】
技术研发人员：马文博，孙雅楠，李喆宇，辜玲慧，周云浩，李波，郑涛，徐越，
申请(专利权)人：成都大学，
类型：发明
国别省市：