【技术实现步骤摘要】
关于水稻茎秆基部矮化相关的DNA选择标记及其适用系统
[0001]本专利技术属于生物学诊断
,尤其涉及一种关于水稻茎秆基部矮化相关的DNA选择标记及其适用系统。
技术介绍
[0002]人类在大约一万年前开始驯化水稻时,就选择出了一个与高产有关的重要基因。这个基因叫做半矮秆基因SD1,它使水稻长得较矮,从而能结出更多谷粒,并且抗倒伏的能力更强。
[0003]目前在我国杂交稻中,水稻矮源几乎都依赖于SD1,且随着越来越多的籼粳杂交水稻的推广。另外,在水稻实践发现,即使杂交水稻含有纯合的SD1基因,部分杂交稻组合的株高也过高,加上穗部的重量重,导致水稻倒伏和减产,使部分组合的株高过高的矛盾更加突出。
[0004]为了进一步拓宽水稻的矮源利用,挖掘新的矮杆基因资源、并基于此开发新的DNA选择标记,仍然是水稻分子遗传育种研究中的一个重要方向。
技术实现思路
[0005]针对现有技术存在的问题,本专利技术提供了一种关于水稻茎秆基部矮化相关的DNA选择标记及其适用系统。
[0006]本专利技术 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种水稻茎秆基部矮化相关的DNA选择标记,其特征在于,所述DNA选择标记为根据水稻茎秆基部矮化控制基因htd1的InDel位点开发的、与矮杆表型完全连锁的标记。2.根据权利要求1所述的水稻茎秆基部矮化相关的DNA选择标记,其特征在于,所述InDel位点位于水稻第二染色体16361788
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16361876。3.根据权利要求1所述的水稻茎秆基部矮化相关的DNA选择标记,其特征在于,所述DNA选择标记为PARMS标记、InDel标记、KASP标记、CAPS或dCAPS标记。4.根据权利要求1所述的水稻茎秆基部矮化相关的DNA选择标记,其特征在于,所述InDel标记的PCR产物大小为60bp
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10kb,优选60bp
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1000bp,更优选110bp
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200bp。5.根据权利要求1所述的水稻茎秆基部矮化相关的DNA选择标记,其特征在于,所述DNA选择标记的引物组合为:ID3017F:TCTTCCAGGGACTACGTGAA;ID3017R:CTTTGGGATTCCACGAATA。6.一种关于水稻茎秆基部矮化相关的DNA选择标记的适用系统,其特征在于,该系统包括:样本获取模块,用于获取待检测样本,所述样本中含有水稻茎秆基部矮化控制基因htd1;PCR扩增反应模块,与样本获取模块连接,用于利用PCR扩增反应液制备扩增反应体系,进行扩增反应;核苷酸探针制备模块,用于制备核苷酸探针;杂交模块,与PCR扩增反应模块、核苷酸探针制备模块连接,用于将PCR扩增后的PCR产物与所述特...
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