一种与油菜秸秆半纤维素含量关联的SNP分子标记组合及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一种与油菜秸秆半纤维素含量关联的SNP分子记及其应用，属于植物遗传育种技术领域。本发明专利技术提供的SNP分子标记分别位于油菜的C2、C5和C8染色体上，且Bn

【技术实现步骤摘要】
一种与油菜秸秆半纤维素含量关联的SNP分子标记组合及其应用


[0001]本专利技术属于植物遗传育种

，尤其涉及一种与油菜秸秆半纤维素含量关联的SNP分子标记组合及其应用。

技术介绍

[0002]油菜是我国重要的油料作物，而且具有蜜用、饲用、肥用、观赏以及改良土壤等“一菜多用”的价值。油菜秸秆是一种可用于生物乙醇生产的农业残渣，在欧洲一些发达国家，油菜秸秆用于生产生物燃料。作为农业副产品的秸秆是取之不尽的可再生天然资源。生物质资源不仅具有可再生性，而且具有良好的生物相容性以及可生物降解性。以油菜秸秆为原料，通过发酵，可以使秸秆内的半纤维素转换成生物乙醇。面对石油和天然气燃料需求不断增加、可用土地减少以及粮食与燃料之间的竞争，在有限的土地上利用作物的废料生产替代燃料是一项很有前景的选择。油菜秸秆中富含纤维素和半纤维素等基本多糖分子，收集处理后能生产出生物乙醇，同时作为生物燃料，提高机械动力发热量的产能，作为干净的生物能源必将提供良好的发展前景。
[0003]半纤维素广泛存在于植物中，主要起骨架的作用。半纤维素作为自然界中含量仅次于纤维素的第二大可再生生物质资源，在食品、制药、化学等行业中应用广泛，具有广阔的发展前景。作为油菜秸秆重要的组成部分，对植株的韧性和支撑起了关键作用。纤维素与半纤维素是油菜秸秆的主要物质成分，直接影响油菜秸秆的机械强度。有研究表明，一定秸秆体积内纤维素和半纤维素含量越高，其抗弯折能力越强。抗倒伏植物的外维管束数量显着高于易倒伏植物，厚壁组织比例更高，细胞壁更厚。细胞壁组成分析显示抗倒伏品系中半纤维素、纤维素木质素含量高于易倒伏品系，木质素和木聚糖的显着增加是抗倒伏的化学型特征。
[0004]基于半纤维素对于秸秆生物质利用及作物自身抗倒伏等生理重要性，开发并应用提高半纤维素含量的分子标记，培育高半纤维素含量的品种，有助于提高田间秸秆的利用效率和降低转化成本，也有利于通过提升半纤维素含量提高作物的抗倒伏能力，降低因倒伏带来的减产风险。

技术实现思路

[0005]为了解决上述技术问题，本专利技术提供一种与油菜秸秆半纤维素含量关联的SNP分子标记组合及其应用。本专利技术提供的SNP分子标记分别位于油菜的C2、C5和C8染色体上，且Bn
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p207843A/A基因型、Bn
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p2621761A/A基因型以及Bn
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p235411G/G基因型的秸秆半纤维素含量明显高于其他基因型。通过对该三个SNP位点的基因型鉴定，即可预测油菜秸秆半纤维素水平。因此，利用该标志物可在油菜生育早期鉴定出符合育种目标的油菜种质，对油菜秸秆半纤维素含量的早期预测和筛选具有重要意义，利于提高育种的效率，加快育种进程。
[0006]为达上述目的，本专利技术采用如下的技术方案：
[0007]本专利技术提供了一种与油菜秸秆半纤维素含量关联的SNP分子标记组合，所述SNP分子标记组合由三个SNP分子标记Bn
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p207843、Bn
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p235411和Bn
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p2621761组成，其中Bn
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p207843的核苷酸序列如SEQ ID No.1或SEQ ID No.2所示，Bn
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p235411的核苷酸序列如SEQ ID No.3或SEQ ID No.4所示，Bn
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p2621761的核苷酸序列如SEQ ID No.5或SEQ ID No.6所示。
[0008]本专利技术还提供了一种检测油菜SNP标记来源的转化KASP引物组合，所述Bn
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p207843转化KASP引物组合的核苷酸序列如SEQ ID No.7～SEQ ID No.9所示，所述Bn
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p235411转化KASP引物组合的核苷酸序列如SEQ ID No.10～SEQ ID No.12所示，所述Bn
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p2621761转化KASP引物组合的核苷酸序列如SEQ ID No.13～SEQ ID No.15所示。
[0009]本专利技术还提供了一种检测油菜秸秆半纤维素含量的试剂盒，所述试剂盒中含有核苷酸序列如SEQ ID No.7～SEQ ID No.15所示的所述转化KASP引物组合。
[0010]本专利技术还提供了一种油菜秸秆半纤维素含量的判断方法，具体为利用所述SNP分子标记组合鉴定油菜基因组的基因型，然后根据基因型判断油菜秸秆半纤维素含量水平的高低。
[0011]优选的，所述油菜秸秆半纤维素含量的具体判断方法为：如果Bn
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p207843、Bn
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p235411、Bn
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p2621761的基因型分别为A/A、G/G和A/A，则油菜秸秆半纤维素含量＞17％，为高水平；如果Bn
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p207843、Bn
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p235411、Bn
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p2621761的基因型分别为G/G、A/A和G/G，则油菜秸秆半纤维素含量＜14％，为低水平；如果Bn
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p207843、Bn
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p235411、Bn
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p2621761的基因型为其他A/A、G/G和A/G的混合型，则秸秆半纤维素含量在14％
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17％之间，为中间水平。
[0012]优选的，所述油菜基因组基因型的检测时期为油菜苗期。
[0013]优选的，所述油菜基因组为油菜植株的基因组，具体为油菜根、茎、叶、花、种子及子叶中的任一一种或多种。
[0014]本专利技术还提供了一种所述SNP分子标记组合、所述转化KASP引物组合、所述试剂盒或所述判断方法在油菜育种中的应用。
[0015]优选的，所述应用具体为在油菜秸秆半纤维素含量早本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与油菜秸秆半纤维素含量关联的SNP分子标记组合，其特征在于，所述SNP分子标记组合由三个SNP分子标记Bn
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p207843、Bn
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p235411和Bn
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p2621761组成，其中Bn
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p207843的核苷酸序列如SEQ ID No.1或SEQ ID No.2所示，Bn
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p235411的核苷酸序列如SEQ ID No.3或SEQ ID No.4所示，Bn
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p2621761的核苷酸序列如SEQ ID No.5或SEQ ID No.6所示。2.一种检测油菜SNP标记来源的转化KASP引物组合，其特征在于，所述Bn
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p207843转化KASP引物组合的核苷酸序列如SEQ ID No.7～SEQ ID No.9所示，所述Bn
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p235411转化KASP引物组合的核苷酸序列如SEQ ID No.10～SEQ ID No.12所示，所述Bn
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p2621761转化KASP引物组合的核苷酸序列如SEQ ID No.13～SEQ ID No.15所示。3.一种检测油菜秸秆半纤维素含量的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中含有权利要求2所述的转化KASP引物组合。4.一种油菜秸秆半纤维素含量的判断方法，其特征在于，利用权利要求1所述的SNP分子标记组合鉴定油菜基因组的基因型，然后根据基因型判断油菜秸秆半纤维...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘佳，杨雨婷，胡琼，汪文祥，徐崟海，梅德圣，王会，成洪涛，李超，
申请(专利权)人：中国农业科学院油料作物研究所，
类型：发明
国别省市：