【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学及遗传育种，具体涉及一种油菜光合主效qtl位点qpr-a9紧密连锁的snp分子标记及其应用。
技术介绍
1、通过光合作用性状改良来提高农作物的产量对现代农业的绿色与可持续发展有着至关重要的意义。现有技术研究表明，增强农作物的光合效率理论上可以提高其50％的产量潜力。同时由于水稻、小麦、油菜和大豆等c3作物光能利用效率很低，因而研究光合作用进行高光效改良将能从根本上大幅提高农作物的产量。
2、自然遗传变异的发掘在产量等复杂数量性状的遗传解析中发挥了重要作用，而光合性状同样是一个复杂的数量性状，其受到光照、温度和co2浓度等条件的影响，并与环境相互作用。因此，在进化和适应不断变化的环境中光合性状也产生了相当数量的遗传变异。尽管现有技术在水稻、小麦、大麦、大豆和棉花等作物中，对光合相关性状的数量性状位点(qtl)已经进行了初步的定位和分析，但在十字花科植物中，尤其是针对油菜光合性状遗传变异的研究则相当缺乏。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种油菜光合主效qtl位点qpr-a9、紧密连锁的snp分子标记及其应用，该光合主效qtl位点能用于调控油菜光合性能。
2、为了实现上述目的，本专利技术提供如下技术方案：
3、本专利技术提供了一种油菜光合主效qtl位点qpr-a9，所述光合主效qtl位点qpr-a9位于油菜基因组的第a09染色体第57823218bp～57939094bp碱基位之间；所述油菜基因组的版本为油菜zs11
4、优选的，所述油菜包括甘蓝型油菜。
5、本专利技术提供了与上述技术方案所述光合主效qtl位点qpr-a9紧密连锁的snp分子标记pr-1，所述snp分子标记pr-1位于油菜基因组的第a09染色体第57923389bp～57923760bp碱基位之间；snp位点位于所述油菜基因组的第a09染色体第57923538bp处；所述snp位点的碱基为a或g。
6、优选的，所述snp分子标记pr-1包括如seq id no.1或seq id no.2所示的核苷酸序列。
7、扩增所述snp分子标记pr-1的引物对，所述引物对包括上游引物pr-1f和下游引物pr-1r；所述上游引物pr-1f的核苷酸序列如seq id no.3所示；所述下游引物pr-1r的核苷酸序列如seq id no.4所示。
8、本专利技术提供了一种检测试剂盒，含有上述技术方案所述的引物对。
9、本专利技术提供了所述光合主效qtl位点qpr-a9、所述snp分子标记pr-1、所述引物对或所述检测试剂盒在油菜光合性状筛选和/或育种中的应用。
10、优选的，所述光合性状筛选包括鉴定高光合性能油菜品种；所述育种包括培育高光合性能油菜品种。
11、本专利技术提供了一种油菜高光合性能鉴定的方法，步骤如下：将待测油菜的基因组采用上述技术方案所述引物对进行pcr扩增，检测扩增片段的基因型；若扩增片段中对应snp分子标记的基因型为aa或ag，则将该待油菜为高光合性能油菜；若扩增片段中对应snp分子标记的基因型为gg，则将该待测油菜为低光合性能油菜。
12、优选的，所述高光合性能油菜包括净光合速率为18～25μmol/m2/s的油菜；所述低光合性能油菜包括净光合速率为5～14μmol/m2/s的油菜。
13、有益效果：
14、本专利技术首次提供了一种油菜光合主效qtl位点qpr-a9，所述光合主效qtl位点qpr-a9位于油菜基因组的第a09染色体第57823218bp～57939094bp碱基位之间，即p6674663～p30729719标记之间；所述油菜基因组的版本为油菜zs11基因组v11版本。该位点对油菜的光合效应具有调控作用。
15、基于上述技术优势，本专利技术开发了与光合主效qtl位点qpr-a9紧密连锁的snp分子标记pr-1，所述snp分子标记pr-1位于油菜基因组的第a09染色体第57923389bp～57923760bp碱基位之间；snp位点位于所述油菜基因组的第a09染色体第57923538bp处；所述snp位点的碱基为a或g，并根据snp分子标记设计了相应的引物对。通过本专利技术所设计的引物对，从而能够将与油菜光合主效qtl位点紧密连锁的snp分子标记克隆出来，为鉴定和选育高光合效应油菜提供可靠的基因学方法。实验表明，采用本专利技术提供的技术方案能够对油菜的光合属性进行准确预测和标记辅助选择，不受环境影响，可显著提高育种效率，节约成本。
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1.一种油菜光合主效QTL位点qPR-A9，其特征在于，所述光合主效QTL位点qPR-A9位于油菜基因组的第A09染色体第57823218bp～57939094bp碱基位之间；
2.根据权利要求1所述的光合主效QTL位点qPR-A9，其特征在于，所述油菜包括甘蓝型油菜。
3.与权利要求1所述光合主效QTL位点qPR-A9紧密连锁的SNP分子标记PR-1，其特征在于，所述SNP分子标记PR-1位于油菜基因组的第A09染色体第57923389bp～57923760bp碱基位之间；
4.根据权利要求3所述的SNP分子标记PR-1，其特征在于，所述SNP分子标记PR-1包括如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。
5.扩增权利要3或4所述SNP分子标记PR-1的引物对，其特征在于，所述引物对包括上游引物PR-1F和下游引物PR-1R；
6.一种检测试剂盒，其特征在于，含有权利要求5所述的引物对。
7.权利要求1或2所述的光合主效QTL位点qPR-A9、权利要求3或4所述的SNP分子标记PR-
8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述光合性状筛选包括鉴定高光合性能油菜品种；
9.一种油菜高光合性能鉴定的方法，其特征在于，步骤如下：
10.根据权利要求9所述的方法，其特征在于，所述高光合性能油菜包括净光合速率为18～25μmol/m2/s的油菜；
...【技术特征摘要】
1.一种油菜光合主效qtl位点qpr-a9，其特征在于，所述光合主效qtl位点qpr-a9位于油菜基因组的第a09染色体第57823218bp～57939094bp碱基位之间；
2.根据权利要求1所述的光合主效qtl位点qpr-a9，其特征在于，所述油菜包括甘蓝型油菜。
3.与权利要求1所述光合主效qtl位点qpr-a9紧密连锁的snp分子标记pr-1，其特征在于，所述snp分子标记pr-1位于油菜基因组的第a09染色体第57923389bp～57923760bp碱基位之间；
4.根据权利要求3所述的snp分子标记pr-1，其特征在于，所述snp分子标记pr-1包括如seq id no.1或seq id no.2所示的核苷酸序列。
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【专利技术属性】
技术研发人员：华玮，朱晓义，孙兴超，范世航，
申请(专利权)人：中国农业科学院油料作物研究所，
类型：发明
国别省市：
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