用于评价乳腺癌预后的方法和组合物技术

提供了用于评价乳腺癌患者，特别是早期阶段乳腺癌患者预后的方法和组合物。本发明专利技术的方法包括检测身体样品中至少一种，更特别的是至少两种生物标记的表达，其中生物标记或生物标记的组合的超表达预示乳腺癌预后。在某些实施方案中，所述的身体样品为乳腺组织样品，特别是原发性乳腺肿瘤样品。本发明专利技术的生物标记为蛋白质和／或基因，其超表达预示良好或差的癌症预后。所关注的生物标记包括参与细胞周期调节、ＤＮＡ复制、转录、信号传导、细胞增殖、侵入、蛋白水解或转移的蛋白质和基因。在本发明专利技术的某些方面中，使用生物标记－特异性抗体在蛋白质水平上或使用核酸杂交技术在核酸水平上检测所关注的生物标记的超表达。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及用于评价患有乳腺癌，特别是早期阶段乳腺癌的患者预后的方法和组合物。
技术介绍
乳腺癌在美国女性中是第二最常见的癌症，通常仅低于皮肤癌。美国女性在其一生中发生乳腺癌的机会有八分之一，并且美国癌症协会估计今年在美国会报道250,000个以上的新乳腺癌病例。乳腺癌是女性中第二位的癌症死亡的主要原因，在2004年预计有40,000个以上的美国人死于该病。最近十年内改进的检测方法、群体筛选检查和治疗上的进展已经显著改善了诊断为乳腺癌的女性的前景。目前，约80％的乳腺癌病例在该病的早期阶段得到诊断，此时其存活率最高。作为结果，约85％百分比的乳腺癌患者在诊断后至少存活5年。尽管有了这些进展，但是约20％诊断为早期阶段乳腺癌的女性10年的效果差并且经历疾病的复发、转移或在该时间期限内死亡。然而，剩余80％的在早期诊断的乳腺癌患者具有良好的10年预后并且不太可能需要或得益于额外的攻击性辅助疗法(例如化疗)。当前的临床共识在于至少某些早期的瘤阴性乳腺癌患者应接受辅助化疗，但目前没有对患者分级以进行更具攻击性的治疗的广泛使用的检测法。由于大部分这些早期癌症患者在手术和/或放疗后，无需进一步治疗就可以享有长期存活，所以可能不适合于对所有这些患者推荐具有攻击性的辅助疗法，特别是考虑到与癌症化疗剂相关的显著副作用。能够在最初诊断时将这些早期阶段乳腺癌患者群体区分成良好和不良预后组的组合物和方法可以有助于临床医师选择合适的疗程。因此，需要用于评价乳腺癌患者，特别是早期阶段乳腺癌患者预后的方法。重要的研究集中于鉴定用于评价乳腺癌预后和预测治疗反应的方法和因素(一般参见Ross和Hortobagyi，eds.(印刷中)MolecularOncology of Breast Cancer(Jones和Bartlett Publishers，Boston，MA)及其中引述的参考文献，将所有这些文献完整地引入本文作为参考)。预后指示物包括更多常规因素，诸如肿瘤大小、瘤的状态和组织学等级以及提供某些有关预后的信息和对具体治疗可能的反应的分子标记。例如，测定雌激素(ER)和孕酮(PR)类固醇激素受体状态已经成为评价乳腺癌患者中常规的程序。例如，参见Fitzgibbons等(2000)Arch.Pathol.Lab.Med.124966-978。激素受体阳性的肿瘤更有可能对激素疗法起反应并且一般还以攻击性较低的方式生长，由此导致具有ER+/PR+肿瘤的患者良好的预后。人表皮生长因子受体2(HER-2/neu)，即跨膜酪氨酸激酶受体蛋白的超表达与乳腺癌预后差相关。Ross等(2003)TheOncologist307-325。乳腺肿瘤中的Her2/neu表达水平目前用于预测对抗-Her-2/neu抗体治疗剂曲妥单抗(Herceptin；Genentech)的反应。例如，参见文献同前，和Ross等，文献同上。此外，约三分之一的乳腺癌在肿瘤抑制基因p53中存在突变并且这些突变与疾病的侵害性增加和预后效果差相关。Fitzgibbons等，文献同上。Ki-67为在细胞周期的G1-M期过程中表达的非组蛋白核蛋白。研究已经证实细胞增殖标记Ki-67的超表达也与乳腺癌预后差相关，文献同前。尽管目前的预后标准和分子标记在预测患者结果和选择合适的疗程方面提供了一定的指导，但是仍然存在对用于评价乳腺癌预后，特别是早期淋巴结阴性患者的特异性和灵敏性方法的显著需求。这类方法应将预后差的乳腺癌患者与那些预后良好的乳腺癌患者特异性区分开并且能够鉴定可能需要攻击性辅助疗法的高危早期阶段乳腺癌患者。专利技术概述提供了用于评价癌症患者，特别是乳腺癌患者预后的方法和组合物。这些方法包括检测身体样品中至少一种，更特别的是至少两种生物标记的表达，其中生物标记或生物标记的组合的超表达预示癌症预后。本专利技术生物标记或生物标记的组合的超表达预示预后良好(即无疾病生存)或预后差(即，癌症复发、转移或死于潜在的癌症)。因此，本专利技术的方法能够将预后良好的乳腺癌患者与预后差的那些患者区分开来。本文披露的方法可以与常规临床因素(例如肿瘤大小、肿瘤等级、淋巴结状态和家族史)和/或分析分子标记，诸如Her2/neu、Ki67、p53和雌激素和孕酮激素受体的表达水平的评价联用。按照这种方式，本专利技术的方法能够更准确地评价乳腺癌预后。本专利技术的生物标记为蛋白质和/或基因，其超表达预示癌症预后，包括那些参与细胞周期调节、DNA复制、转录、信号传导、细胞增殖、侵入或转移的生物标记。对本专利技术生物标记基因或蛋白质超表达的检测能够评价癌症预后并且有利于将乳腺癌患者分成良好和不良预后的风险组，例如目的在于治疗选择。可以在蛋白质或核酸水平上评价生物标记表达。在某些实施方案中，提供了免疫组织化学技术，其使用抗体检测乳腺肿瘤样品中的生物标记表达。在本专利技术的该方面中，使用针对所关注的特异性生物标记的至少一种抗体。还可以通过基于核酸的技术，包括，例如杂交和RT-PCR检测表达。组合物包括能够结合本专利技术生物标记的单克隆抗体。本文还包括这些单克隆抗体的抗原结合片段和变体、产生这些抗体的杂交瘤细胞系和编码这些单克隆抗体的氨基酸序列的分离的核酸分子。进一步提供了包含用于实施本专利技术方法的试剂的试剂盒。附图简述附图说明图1表示作为实际乳腺癌结果的函数的具有强度2的染色的细胞百分比分布。实施例4中提供了实验的详细描述。图2提供了使用基于序列的用于SLPI/p21ras/E2F1/PSMB9/src/磷酸-p27组合的解读手段获得的ROC曲线。实施例5中提供了实验的详细描述。图3提供了SLPI、src、PSMB9、p21ras和E2F1生物标记组的预后表现的卡普兰-迈耶曲线图。实施例8中提供了实验的详细描述。图4提供了一般乳腺癌患者群体的长期存活数据的图示，其不依赖于对生物标记超表达的分析。实施例8中提供了实验的详细描述。图5提供了SLPI、src、PSMB9、p21ras、E2F1和MUC-1生物标记组的预后表现的卡普兰-迈耶曲线图。实施例9中提供了实验的详细描述。专利技术详述本专利技术提供了用于评价癌症患者，特别是乳腺癌患者，更具体地说为早期阶段乳腺癌患者预后的方法和组合物。这些方法包括检测患者组织或体液样品中生物标记的表达并且测定所述生物标记是否超表达。用于实施本专利技术的生物标记或生物标记的组合的超表达预示乳腺癌预后(即差或良好预后)。因此，所关注的特定生物标记或生物标记的组合的超表达能够将可能经历疾病复发(即预后差)的乳腺癌患者与那些更可能保持无癌症(即预后良好)的患者区分开来。在本专利技术的某些方面中。这些方法包括检测乳腺肿瘤样品中至少一种生物标记的超表达，其预示乳腺癌预后差且由此鉴定更可能经历潜在癌症复发的患者。本专利技术的方法还可以用于辅助选择合适的疗程并且鉴定可以得益于更具攻击性疗法的患者。在具体的实施方案中，抗体和免疫组织化学技术用于检测所关注的生物标记的表达并且评价乳腺癌患者的预后。进一步提供了对于所关注的生物标记具有特异性的单克隆抗体和用于实施本专利技术方法的试剂盒。所谓″乳腺癌″意指例如那些通过活组织检查分类为恶性病理情况的疾病。乳腺癌诊断的临床描述为医学领域众所周知的。本领域技术人员可以理解乳腺癌意指乳腺组织的任何恶性肿本文档来自技高网...

【技术保护点】
评价乳腺癌患者预后的方法，所述的方法包括检测来自所述患者的样品中的至少一种生物标记的超表达，其中所述的生物标记选自由ＳＬＰＩ、ｐ２１ｒａｓ、ＭＵＣ－１、ＤＡＲＰＰ－３２、磷酸－ｐ２７、ｓｒｃ、ＭＧＣ１４８３２、ｍｙｃ、ＴＧＦβ－３、ＳＥＲＨＬ、Ｅ２Ｆ１、ＰＤＧＦＲα、ＮＤＲＧ－１、ＭＣＭ２、ＰＳＭＢ９和ＭＣＭ６组成的组，其中所述生物标记的超表达预示预后，并且由此评价所述乳腺癌患者的预后。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：TJ费希尔，CM怀特黑德，DP马利诺斯基，R马塞尔普瓦尔，D莫雷尔，
申请(专利权)人：三路影像公司，
类型：发明
国别省市：US[美国]