【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及乳腺癌预后相 关基因mRNA表达水平检测液相芯片。
技术介绍
目前，乳腺癌的治疗方法主要有内分泌治疗和化学治疗，内分泌治疗指通过药物 或内分泌腺体的切除调整乳腺癌患者体内的雌激素水平，抑制癌细胞的分裂，使肿瘤的发 展减慢，其作用速度较化学治疗慢。采用化学抗癌药物治疗癌症，简称“化疗”，在乳腺癌的 治疗过程中包括手术前、中和后的化疗，尤以术后的辅助化疗最为常用，其目的是消灭手术 后残留的微小癌病灶。乳腺是性激素依赖性器官，其生长、发育和细胞的增殖均受雌激素和孕激素的影 响，雌激素受体(ESRl)、孕激素受体(PGR)是与乳腺癌密切相关的二种激素受体，ESRl和 PGR在乳腺癌的形成、发展和对激素反应中起关键的作用。PGR是雌激素作用的最终产物， PGR的合成必须有雌激素启动，PGR的存在说明ESRl酶活正常，两者均位于细胞核内。单独 ESRl阳性对内分泌治疗有阳性反应的占55%，ESR1和PGR同时阳性时，对内分泌治疗有阳 性反应的可达75% 80%。研究表明，乳腺癌细胞分化程度高，恶性程度低，其ESR...
【技术保护点】
一种乳腺癌预后相关基因ｍＲＮＡ表达水平检测液相芯片，其特征是，主要包括有： （１）针对不同目标基因的、与胺基修饰的支持探针偶联的微球，每条支持探针主要包括５’端的间隔臂序列和３’端的与支持延伸探针互补配对的特异性序列Ｐ１，所述支持探针包括有针对ＥＳＲ１基因的ＳＥＱ．ＩＤ ＮＯ．１和针对ＰＧＲ基因的ＳＥＱ．ＩＤ ＮＯ．２，每种微球具有不同的荧光编码； （２）连接支持探针与目标基因ｍＲＮＡ的支持延伸探针，每条支持延伸探针主要包括５’端能与对应的目标基因ｍＲＮＡ结合的特异性序列Ｐ２、间隔臂序列、３’端能与对应的支持探针的特异性序列Ｐ１互补配对的Ｐ３序列，所述支持延伸探针的特异...
【技术特征摘要】
一种乳腺癌预后相关基因mRNA表达水平检测液相芯片，其特征是，主要包括有(1)针对不同目标基因的、与胺基修饰的支持探针偶联的微球，每条支持探针主要包括5’端的间隔臂序列和3’端的与支持延伸探针互补配对的特异性序列P1，所述支持探针包括有针对ESR1基因的SEQ.ID NO.1和针对PGR基因的SEQ.ID NO.2，每种微球具有不同的荧光编码；(2)连接支持探针与目标基因mRNA的支持延伸探针，每条支持延伸探针主要包括5’端能与对应的目标基因mRNA结合的特异性序列P2、间隔臂序列、3’端能与对应的支持探针的特异性序列P1互补配对的P3序列，所述支持延伸探针的特异性序列P2包括有针对ESR1基因的选自SEQ.ID NO.24 SEQ.ID NO.28中的2条以上、和针对PGR基因的选自SEQ.ID NO.29 SEQ.ID NO.33中的2条以上；(3)扩增延伸探针，每条扩增延伸探针包括有5’端能与目标基因mRNA结合的特异性序列P4、间隔臂序列、3’端序列P5，3’端还修饰有生物素；所述扩增延伸探针的特异性序列P4包括有针对ESR1基因的选自SEQ.ID NO.166 SEQ.ID NO.175中的5条以上，和针对PGR基因的选自SEQ.ID NO.176 SEQ.ID NO.185中的5条以上；所述P5为不存在发夹结构，探针内部和探针间不形成二聚体、与P1、P2、P3、P4和总mRNA之间均不存在非特异性结合的序列。2.根据权利要求1所述的液相芯片，其特征是，所述支持探针还包括有以下5种基因中 的1种以上针对RPLPO基因的SEQ ID NO. 3、针对GAPDH基因的SEQ ID NO. 4、针对⑶SB 基因的SEQ ID NO. 5、针对ACTB基因的SEQ ID NO. 6和针对TFRC基因的SEQ ID NO. 7 ；相应地，所述支持延伸探针的特异性序列P2还包括有以下5种基因中的1种以上针 对RPLPO基因的选自SEQ. ID NO. 34-SEQ. ID NO. 38中的2条以上、针对GAPDH基因的选自 SEQ. ID NO. 39-SEQ. ID NO. 44 中的 2 条以上、针对GUSB基因的 SSEQ. ID NO. 45-SEQ. IDNO. 49 中的2条以上、针对ACTB基因的SEQ. ID NO. 50-SEQ. ID NO. 54中的2条以上和针对TFRC 基因的 SEQ. ID NO. 55-SEQ. ID NO. 59 中的 2 条以上;相应地，所述扩增延伸探针的特异性序列P4还包括有以下5种基因中的1种以上针 对RPLPO基因的选自SEQ. ID NO. 186-SEQ. ID NO. 195中的5条以上、针对GAPDH基因的选 自 SEQ. ID NO. 196-SEQ. ID NO. 206 中的 5 条以上、针对 GUSB 基因的 SSEQ. ID NO. 207-SEQ. ID NO. 216中的5条以上、针对ACTB基因的SEQ. ID NO. 217-SEQ. ID NO. 226中的5条以上 和针对TFRC基因的SEQ. ID NO. 227-SEQ. ID NO. 237中的5条以上。3.根据权利要求2所述的液相芯片，其特征是，还包括有填充序列，针对RPLPO基因 的选自 SEQ ID NO. 412-SEQ ID NO. 413 中的 1 条以上、针对 GAPDH 基因的 SEQ ID N0. 414、 针对⑶SB基因的选自SEQ ID N0.415-SEQ ID N0. 417中的1条以上、针对ACTB基因的选 自 SEQID NO. 418-SEQ ID NO. 422 中的 1 条以上。4.根据权利要求1-3任一所述的液相芯片，其特征是，还包括有填充序列，针对 ESRl基因的选自SEQ ID NO. 399-SEQ ID NO. 403中的1条以上，针对PGR基因的选自SEQ IDNO. 406-SEQ ID N0. 408 中的 1 条以上。5.根据权利要求1所述的液相芯片，其特征是，所述P5的碱基组成为SEQID N0. 398 所示。6.根据权利要求1或2所述的液相芯片，其特征是，所述支持探针还包括有以下16种基因中的1种以上针对MKI67基因的SEQ ID NO. 8、针对AURKA基因的SEQ ID NO. 9、针 对MYBL2基因的SEQ ID NO. 10、针对CCNBl基因的SEQ ID NO. 11、针对BIRC5基因的SEQ ID NO. 12、针对 MMPll 基因的 SEQ ID NO. 13、针对 CTSL2 基因的 SEQ ID NO. 14、针对 SCUBE2 基因的 SEQ ID NO. 15、针对 BCL2 基因的 SEQ ID NO. 16、针对 GRB7 基因的 SEQ ID NO. 17、 针对GSTMl基因的SEQ ID NO. 18、针对CD68基因的SEQ ID NO. 19、针对BAGl基因的SEQ IDN0. 20、针对 PARPl 基因的 SEQ ID NO. 21、针对 PTEN 基因的 SEQ ID NO. 22 和针对 VEGFA 基因的 SEQ ID NO. 23 ；相应地，所述支持延伸探针的特异性序列P2还包括有针对以下16种基因中的1种以 上针对MKI67基因的选自SEQ ID NO. 60-SEQ ID NO. 64中的2条以上、针对AURKA基因的 选自SEQ ID NO. 65-SEQ ID NO. 69中的2条以上、针对MYBL2基因的选自SEQ ID NO. 70-SEQ ID NO. 75中的2条以上、针对CCNBl基因的选自SEQ ID NO. 76-SEQ ID NO. 80中的2条以上、 针对BIRC5基因的选自SEQ ID NO. 81-SEQ ID NO. 85中的2条以上、针对MMPll基因的选自 SEQ ID NO. 86-SEQ ID NO. 90 中的 2 条以上、针对 CTSL2 基因的选自 SEQ ID N0. 91-SEQ ID NO. 96中的2条以上、针对SCUBE2基因的选自SEQ ID NO. 97-SEQ ID NO. 101中的2条以上、 针对BCL2基因的选自SEQ ID NO. 102-SEQ ID NO. 106中的2条以上、针对GRB7基因的选自 SEQ ID NO. 107-SEQ ID NO. Ill 中的 2 条以上、针对 GSTMl 基因的选自 SEQ IDN0. 112-SEQ ID N0. 116中的2条以上、针对CD68基因的选自SEQ ID NO. 117-SEQ IDN0. 122中的2条以 上、针对BAGl基因的选自SEQ IDN0. 123-SEQ IDN0. 127中的2条以上、针对PARPl基因的选 自 SEQ ID NO. 128-SEQ ID NO. 132 中的 2条以上、针对PTEN基因的选自 SEQ ID NO. 133-SEQ ID NO. 137中的2条以上和针对VEGFA基因的SEQ ID NO. 138-SEQ ID NO. 142中的2条以 上；相应地，所述扩增延伸探针的特异性序列P4还包括有以下16种基因中的1种以上针 对MKI67基因的选自SEQ ID NO. 238-SEQ ID NO. 247中的5条以上、针对AURKA基因的选自 SEQ ID NO. 248-SEQ ID NO. 256 中的 5 条以上、针对MYBL2 基因的选自 SEQ ID NO. 257-SEQ ID NO. 266中的5条以上、针对CCNBl基因的选自SEQ ID NO. 267-SEQ ID NO. 275中的5 条以上、针对BIRC5基因的选自SEQ ID NO. 276-SEQ ID NO. 285中的5条以上、针对MMPll 基因的选自SEQ ID NO. 286-SEQ ID NO. 295中的5条以上、针对CTSL2基因的选自SEQ ID NO. 296-SEQ ID NO. 306 中的 5 条以上、针对 SCUBE2 基因的选自 SEQ ID NO. 307-SEQ ID NO. 316中的5条以上、针对BCL2基因的选自SEQ ID NO. 317-SEQ ID NO. 326中的5条以上、 针对GRB7基因的选自SEQ ID NO. 327-SEQ ID NO. 336中的5条以上、针对GSTMl基因的选 自 SEQ ID NO. 337-SEQ ID NO. 346 中的 5 条以上、针对CD68 基因的选自 SEQ IDN0. 347-SEQ ID N0. 358中的5条以上、针对BAGl基因的选自SEQ ID NO. 359-SEQ IDN0. 368中的5条以 上、针对PARPl基因的选自SEQ ID NO. 369-SEQ ID NO. 378中的5条以上、针对PTEN基因的 选自 SEQ ID NO. 379-SEQ ID NO. 388 中的 5 条以上和针对 VEGFA 基因的 SEQ ID NO. 389-SEQ ID NO. 397中的5条以上。7.根据权利要求6所述的液相芯片，其特征是，还包括有填充序列，针对SCUBE2基 因的选自SEQ ID NO. 404-SEQ ID NO. 405中的1条以上、针对BCL2基因的选自SEQ ID NO. 409-SEQ ID NO. 411 中的 1 条以上、针对 MKI67 基因的选自 SEQ ID NO. 423-SEQ ID NO. 425中的1条以上、针对CCNBl基因的SEQ ID N0. 426、针对CTSL2基因的SEQ ID N0. 427、针对 GSTMl 基因的 SEQ ID NO. 428、针对 CD68 基因的 SEQ ID NO. 429-SEQ ID NO. 431 中的 1条以上、针对BAGl基因的SEQ ID NO. 432-SEQ ID NO. 434中的1条以上、针对PARPl基因 的 SEQ IDNO. 435-SEQ ID NO. 436 中的 1 条以上、针对 PTEN 基因的 SEQ ID NO. 437-SEQ ID NO. 441中的1条以上、针对CCNBl基因的SEQ ID NO. 442。8.根据权利要求1或2所述的液相芯片，其特征是，所述间隔臂序列为poly(dT)。9.一种乳腺癌预后相关基因mRNA表达水平检测液相芯片，其特征是，主要...
【专利技术属性】
技术研发人员：许嘉森，吴诗杨，杨惠夷，何嘉英，郭元杰，
申请(专利权)人：广州益善生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：81[中国|广州]
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