【技术实现步骤摘要】
一种利用高通量基因测序评估肠道菌群健康的方法
本专利技术属于生物治疗及检测领域,特别涉及一种利用高通量基因测序评估肠道菌群健康的方法。
技术介绍
肠道微生物常认为是和消化、营养作用联系在一起的。对人类来说,植物中的纤维素和半纤维素类多糖是无法消化的,而肠道菌群中的拟杆菌等细菌则具有一系列多糖消化的酶,来分解这些多糖,从而为人类提供能量。除此之外,肠道菌群通过发酵还能产生短链脂肪酸和维生素K供人体吸收,同时一些金属离子,如钙、镁、铁等,也可通过肠道菌群被重新吸收。然而随着研究的深入,人们逐渐发现,肠道菌群不只在消化过程发挥作用,它和人体健康有着极为密切的联系。肠道菌群和人体的代谢疾病具有重要关系。肠道菌群失衡可能是造成肥胖、糖尿病等多种多种代谢异常的重要原因之一。例如,若长期进食高脂、高糖食物,可造成肠道菌群中条件致病菌比例增加,而共生菌比例下降,从而使得食物中摄取的能量更容易转化为脂肪累积于皮下,造成肥胖。此外,低度炎症还能促使机体对胰岛素相应程度下降,造成胰岛素抵抗,进而发展为糖尿病,因此,如何精确、快捷地进行测序菌群,进而对治疗有极大的作用。
技术实现思路
为了解 ...
【技术保护点】
1.一种利用高通量基因测序评估肠道菌群健康的方法,其特征在于:具体步骤为:(1)肠道菌群样品采集将采集的待测粪便用棉签涂抹少量,不超过1/2的棉签长度,将棉签放置在采集试剂盒中旋紧盒盖,进行信息标记后,备用检测;(2)样本处理及质量控制步骤(1)中待测样本处理时,采用高通量基因测序进行样本处理,依次经过菌群基因组DNA提取与检测、PCR扩增与检测、产物定量和均一化、产物纯化、二轮PCR加接头、MiSeq上机测序、生物信息学分析,完成样本中菌群的测序,观察测序质量,当覆盖度超过99.9%,判断菌群测序结果可靠,进入后续分析工序;(3)检测结果解读及后处理预估多样性分析获得该样 ...
【技术特征摘要】
1.一种利用高通量基因测序评估肠道菌群健康的方法,其特征在于:具体步骤为:(1)肠道菌群样品采集将采集的待测粪便用棉签涂抹少量,不超过1/2的棉签长度,将棉签放置在采集试剂盒中旋紧盒盖,进行信息标记后,备用检测;(2)样本处理及质量控制步骤(1)中待测样本处理时,采用高通量基因测序进行样本处理,依次经过菌群基因组DNA提取与检测、PCR扩增与检测、产物定量和均一化、产物纯化、二轮PCR加接头、MiSeq上机测序、生物信息学分析,完成样本中菌群的测序,观察测序质量,当覆盖度超过99.9%,判断菌群测序结果可靠,进入后续分析工序;(3)检测结果解读及后处理预估多样性分析获得该样本中测得所有细菌种类、数量和比例,用于确定该样本人体菌群健康等级情况;将获得数据与标准数据库比对,确定该样本与健康人群、疾病人群的相似性,最终评估该样本受检者的健康情况,并进行后处理预估或者就医处理。2.根据权利要求1所述的利用高通量基因测序评估肠道菌群健康的方法,其特征在于:步骤(1)中的信息标记包括采集样品对象的生活作息、用药情况、个人病史、家族病史的数据收集。3.根据权利要求1所述的利用高通量基因测序评估肠道菌群健康的方法,其特征在于:步骤(2)中PCR扩增以基因组DNA为模板,利用特异性引物扩增16srDNA的V4区域,样本扩增后,采用琼脂糖凝胶电泳检测产物的纯度和特异性,应在相应...
【专利技术属性】
技术研发人员:李佩铷,边高瑞,贾长生,
申请(专利权)人:天益健康科学研究院镇江有限公司,
类型:发明
国别省市:江苏,32
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