苹果转录因子ERF17中丝氨酸残基数目的应用制造技术

本发明专利技术公开了苹果转录因子ERF17中丝氨酸残基数目的应用。苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为8个和/或苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为6个的待测苹果的果皮叶绿素降解速率大于苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为3个的待测苹果。实验证明，苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目可以作为检测对象，预测待测苹果果皮叶绿素降解速率。本发明专利技术具有重大的应用价值。

Application of Serine Residues Number in Apple Transcription Factor ERF17

The invention discloses the application of serine residue number in Apple transcription factor ERF17. The number of consecutive serine residues in Apple transcription factor ERF17 from the 12th amino acid residue of N-terminal was 8 and/or the number of consecutive serine residues in Apple transcription factor ERF17 from the 12th amino acid residue of N-terminal was 6. The chlorophyll degradation rate of apple peel was higher than that of Apple transcription factor ERF17 from the 12th amino acid residue of N-terminal. There are three apples to be tested. The results showed that the number of consecutive serine residues of ERF17 from the 12th amino acid residue of N-terminal could be used as the detection object to predict the chlorophyll degradation rate of apple peel. The invention has great application value.

【技术实现步骤摘要】
苹果转录因子ERF17中丝氨酸残基数目的应用
本专利技术属于生物
，具体涉及苹果转录因子ERF17中丝氨酸残基数目的应用，尤其涉及苹果转录因子ERF17中自N末端起第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目的应用。
技术介绍
苹果果皮色泽是果实重要的外观品质之一，而开展在果皮着色前叶绿素降解的相关研究尤为重要。叶绿素的降解常发生在衰老的植物细胞中，并且受到强光照射、低温等环境和内源激素乙烯诱导(Oelleretal.，1991；Hortensteiner，2006；Pinoetal.，2008)。在高等植物中叶绿素降解途径的相关研究已较清楚(Takamiyaetal.，2000；Hortensteiner，2006)：在叶绿体类囊体上，NYC(Non-YellowColouring)催化叶绿素b转换为叶绿素a，叶绿素a被转运至叶绿体基质中，在叶绿素酶(Chlorophyllase，CLH)作用下形成叶绿素，随后由镁离子螯合剂(MetalChelatingSubstance，MCS)去除镁离子后的脱镁叶绿酸在PAO(PheideaOxygenase)和RCCR(RedChlCataboliteReductase)共同作用下形成了pFCC(blue-fluorescingintermediate)。参与果实叶绿素降解的基因可以被分为两类：一类是结构基因，其编码的蛋白质可以直接参与叶绿素的降解代谢，如NYC、CLH、PAO；另一类是调控基因，其编码的蛋白可以调控结构基因的转录水平，如乙烯响应因子(EthyleneResponsibleFactors，ERF/AP2)。乙烯响应因子是植物中家族成员最多的转录因子之一，其含有ERF/AP2氨基酸保守结构域，并具有与DNA结合、转录激活、蛋白互作、核定位等结构域功能(Fukaoetal.，2006)。现有研究表明，乙烯响应因子CitERF5、CitERF6、CitERF7和CitERF13在柑橘属果实褪绿过程中起到重要作用(Xieetal.，2014)；乙烯响应因子CitERF13与CitPPH基因(叶绿素降解关键基因)的启动子结合，可增强CitPPH基因的转录水平，促使叶绿素降解(Yinetal.，2016)。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是如何预测待测苹果果皮叶绿素降解速率。苹果果皮中叶绿素含量降低，则果皮颜色越红。为解决上述技术问题，本专利技术提供了预测待测苹果果皮叶绿素降解速率的方法。本专利技术所提供的预测待测苹果果皮叶绿素降解速率的方法，具体可为方法一，可包括如下步骤：检测待测苹果的苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目；“苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为8个(第9个氨基酸残基为非丝氨酸残基)和/或苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为6个(第7个氨基酸残基为非丝氨酸残基)”的待测苹果的果皮叶绿素降解速率大于“苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为3个(第4个氨基酸残基为非丝氨酸残基)”的待测苹果。上述方法一中，所述苹果转录因子ERF17为蛋白质，自N端至C端依次可由区段Ⅰ、区段Ⅱ和区段Ⅲ组成；区段Ⅰ的C末端的氨基酸残基可为T，区段Ⅱ可由3-8个丝氨酸残基组成，区段Ⅲ的N末端的氨基酸残基可为M。所述区段Ⅰ可为如下a1)或a2)或a3)：a1)氨基酸序列是序列表中序列5自N末端起第1至11位所示的多肽；a2)将a1)所示的多肽经过一个或几个氨基酸残基的替换得到的与具有相同功能的多肽。a3)与a1)或a2)所示的多肽具有80％或80％以上同一性，来源于苹果且具有相同功能的蛋白质。上述a3)中，使用的术语“同一性”指与天然氨基酸序列的序列相似性。“同一性”包括与本专利技术的序列表中序列5自N末端起第1至11位所示的氨基酸序列具有80％，或85％或更高，或90％或更高，或95％或更高同一性的氨基酸序列。所述区段Ⅱ可为如下b1)或b2)或b3)：b1)氨基酸序列是序列表中序列5自N末端起第12至19位所示的多肽；b2)氨基酸序列是序列表中序列5自N末端起第12至17位所示的多肽；b3)氨基酸序列是序列表中序列5自N末端起第12至14位所示的多肽。所述区段Ⅲ可为如下c1)或c2)或c3)：c1)氨基酸序列是序列表中序列5自N末端起第20至235位所示的多肽；c2)将c1)所示的多肽经过一个或几个氨基酸残基的替换和/或缺失和/或添加得到的与具有相同功能的多肽；c3)与c1)或c2)所示的多肽具有80％或80％以上同一性，来源于苹果且具有相同功能的蛋白质。上述c3)中，使用的术语“同一性”指与天然氨基酸序列的序列相似性。“同一性”包括与本专利技术的序列表中序列5自N末端起第20至235位所示的氨基酸序列具有80％，或85％或更高，或90％或更高，或95％或更高同一性的氨基酸序列。上述任一所述苹果转录因子ERF17可为如下d1)或d2)或d3)或d4)或d5)：d1)氨基酸序列是序列表中序列5所示的蛋白质；d2)氨基酸序列是序列表中序列6所示的蛋白质；d3)氨基酸序列是序列表中序列8所示的蛋白质；d4)将d1)或d2)或d3)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的替换和/或缺失和/或添加得到的与具有相同功能的蛋白质；d5)与d1)或d2)或d3)或d4)所示的蛋白质具有80％或80％以上同一性，来源于苹果且具有所述苹果转录因子ERF17功能的蛋白质。上述d5)中，使用的术语“同一性”指与天然氨基酸序列的序列相似性。“同一性”包括与编码所述苹果转录因子ERF17的氨基酸序列具有80％，或85％或更高，或90％或更高，或95％或更高同一性的氨基酸序列。上述d4)中，一个或几个氨基酸残基的缺失和/或添加不可在所述区段Ⅱ进行。本专利技术所提供的预测待测苹果果皮叶绿素降解速率的方法，具体可为方法二，可包括如下步骤：检测待测苹果的所述苹果转录因子ERF17为苹果转录因子ERF17-8s、苹果转录因子ERF17-6s还是苹果转录因子ERF17-3s；“所述苹果转录因子ERF17为苹果转录因子ERF17-8s和/或苹果转录因子ERF17-6s”的待测苹果的果皮叶绿素降解速率大于“所述苹果转录因子ERF17为苹果转录因子ERF17-3s”的待测苹果。上述方法二中，所述苹果转录因子ERF17-8s可为如下e1)或e2)或e3)：e1)氨基酸序列是序列表中序列5所示的蛋白质；e2)将e1)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的替换得到的与具有相同功能的蛋白质；e3)与e1)或e2)所示的蛋白质具有80％或80％以上同一性，来源于苹果且具有所述苹果转录因子ERF17-8s功能的蛋白质。上述e3)中，使用的术语“同一性”指与天然氨基酸序列的序列相似性。“同一性”包括与本专利技术的序列表中序列5所示的氨基酸序列具有80％，或85％或更高，或90％或更高，或95％或更高同一性的氨基酸序列。上述方法二中，所述苹果转录因子ERF17-6s可为如下f1)或f2)或f3)：f1)氨基酸序列是序列表中序列6所示的蛋白质；f2)将f1)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种预测待测苹果果皮叶绿素降解速率的方法，包括如下步骤：检测待测苹果的苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目；“苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为8个和/或苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为6个”的待测苹果的果皮叶绿素降解速率大于“苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为3个”的待测苹果。

【技术特征摘要】
1.一种预测待测苹果果皮叶绿素降解速率的方法，包括如下步骤：检测待测苹果的苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目；“苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为8个和/或苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为6个”的待测苹果的果皮叶绿素降解速率大于“苹果转录因子ERF17自N末端第12位氨基酸残基开始连续丝氨酸残基的数目为3个”的待测苹果。2.一种预测待测苹果果皮叶绿素降解速率的方法，包括如下步骤：检测待测苹果的苹果转录因子ERF17为苹果转录因子ERF17-8s、苹果转录因子ERF17-6s还是苹果转录因子ERF17-3s；“苹果转录因子ERF17为苹果转录因子ERF17-8s和/或苹果转录因子ERF17-6s”的待测苹果的果皮叶绿素降解速率大于“苹果转录因子ERF17为苹果转录因子ERF17-3s”的待测苹果；苹果转录因子ERF17-8s为如下e1)或e2)或e3)：e1)氨基酸序列是序列表中序列5所示的蛋白质；e2)将e1)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的替换得到的与具有相同功能的蛋白质；e3)与e1)或e2)所示的蛋白质具有80％或80％以上同一性，来源于苹果且具有所述苹果转录因子ERF17-8s功能的蛋白质；苹果转录因子ERF17-6s为如下f1)或f2)或f3)：f1)氨基酸序列是序列表中序列6所示的蛋白质；f2)将f1)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的替换得到的与具有相同功能的蛋白质；f3)与f1)或f2)所示的蛋白质具有80％或80％以上同一性，来源于苹果且具有所述苹果转录因子ERF17-6s功能的蛋白质；苹果转录因子ERF17-3s为如下g1)或g2)或g3)：g1)氨基酸序列是序列表中序列8所示的蛋白质；g2)将g1)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的替换得到的与具有相同功能的蛋白质；g3)与g1)或g2)所示的蛋白质具有80％或80％以上同一性，来源于苹果且具有所述苹果转录因子ERF17-3s功能的蛋白质。3.一种预测待测苹果果皮叶绿素降解速率的方法，包括如下步骤：检测待测苹果总RNA的特定转录本中第12个密码子开始连续编码丝氨酸的密码子的数目；所述特定转录本为苹果转录因子ERF17的编码基因转录得到的RNA，其第1个密码子为起始密码子；“特定转录本中第12个密码子开始连续编码丝氨酸的密码子为8个和/或特定转录本中第12个密码子开始连续编码丝氨酸的密码子为6个”的待测苹果的果皮叶绿素降解速率大于“特定转录本中第12个密码子开始连续编码丝氨酸的密码子为3个”的待测苹果。4.一种预测待测苹果果皮叶绿素降解速率的方法，包括如下步骤：检测待测苹果总DNA中苹果转录因子ERF17的编码基因的第12个密码子开始连续编码丝氨酸的密码子的数目；“总DNA中苹果转录因子ERF17的编码基因的第12个密码子开始连续编码丝氨酸的密码子为8个和/或总DNA中苹果转录因子ERF17的编码基因的第12个密码子开始连续编码丝氨酸的密码子为6个”的待测苹果的果皮叶绿素降解速率大于“总DNA中苹果转录因子ERF17的编码基因的第12个密码子开始连续编码丝氨酸的密码子为3个”的待测苹果。5.一种预测待测苹果果皮叶绿素降解速率的方法，包括如下步骤：提取待测苹果的总RNA并反转录为cDNA，然后采用特异引物对进行PCR扩增，检测PCR扩增产物；“PCR扩增产物中具有序列3所示的DNA分子且具有序列4所示的DNA分子”的待测苹果的果皮叶绿素降解速率大于“PCR扩增产物中不具有序列3所示的DNA分子、不具有序列4所示...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴婷，韩振云，张美玲，韩振海，张新忠，王忆，许雪峰，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：北京,11