The present invention provides a rapid detection kit for IL28B genotype based on POCT mode. The kit contains fluorescent quantitative PCR primers and probes for detecting IL28B genotype and cell lysate. The sequence of the PCR primers is shown as SEQ ID NO.1_2 and SEQ ID NO.5_6, and the sequence of the probes is shown as SEQ ID NO.3_4 and SEQ ID NO.7_8. This kit can be used for real-time detection without DNA purification. It can directly add samples to the reagent for PCR reaction. It is especially suitable for rapid and accurate detection of samples with low DNA content (such as oral exfoliated cells). The detection accuracy is over 99%, and the detection sensitivity is high. It can accurately detect genomic DNA as low as 0.125 ng. The whole detection time is short, and the detection results can be obtained within one hour. The first time to provide the basis for doctors to use drugs, reduce the risk of patients using drugs.
【技术实现步骤摘要】
基于POCT模式的IL28B基因型快速检测试剂盒
本专利技术涉及分子生物学领域,具体地说,涉及一种基于POCT模式的IL28B基因型快速检测试剂盒。
技术介绍
IL28B是第三类干扰素(interferon,IFN)家族的成员,主要由巨噬细胞和树突细胞在接受病毒蛋白或Toll样受体(toll-likereceptor)刺激时产生,负责肝脏和上皮组织的病毒免疫应答反应。IL28B具有多个单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)位点,包括rs8099917(T>G)、rs12980275(A>G)、rs12979860(C>T)等。其中,以rs12979860和rs8099917最为突出。1000genomeprojectphase3提供的数据表明,IL28B(rs12979860,C>T)等位基因在中国西双版纳傣族人群中等位基因C出现的频率占89.78%;在中国北京汉族人群中IL28B(rs12979860,C>T)等位基因C出现的频率占93.69%; ...
【技术保护点】
1.一种检测IL28B基因多态性的引物组合,其特征在于,检测IL28B基因的引物组合包括:检测IL28B(rs12979860)位点的引物:上游引物:5’‑GATGGGTACTGGCAGCGC‑3’;下游引物:5’‑GGAGCGCGGAGTGCAATTC‑3’;检测IL28B(rs8099917)位点的引物:上游引物:5’‑GTAAGTCTTGTATTTCACCTCCTGG‑3’;下游引物:5’‑AAAAGCCAGCTACCAAACTGTAT‑3’。
【技术特征摘要】
1.一种检测IL28B基因多态性的引物组合,其特征在于,检测IL28B基因的引物组合包括:检测IL28B(rs12979860)位点的引物:上游引物:5’-GATGGGTACTGGCAGCGC-3’;下游引物:5’-GGAGCGCGGAGTGCAATTC-3’;检测IL28B(rs8099917)位点的引物:上游引物:5’-GTAAGTCTTGTATTTCACCTCCTGG-3’;下游引物:5’-AAAAGCCAGCTACCAAACTGTAT-3’。2.与权利要求1所述引物组合配套使用的探针组合,其特征在于,所述探针组合包括如SEQIDNO.3-4和SEQIDNO.7-8所示的探针。3.根据权利要求2所述的探针组合,其特征在于,所述探针组合包括:检测IL28B(rs12979860)位点的探针:野生型探针:5’-AAGGCGCGAACC-3’;突变型探针:5’-CGAAGGCG+TGAACCA-3’;检测IL28B(rs8099917)位点的探针:野生型探针:5’-TGAGCAAT+TTCACCCA-3’;突变型探针:5’-TGAGCAAT+GTCACCCA-3’;其中,“+”表示右侧的单碱基为LNA修饰。4.含有权利要求1所述引物组合和权利要求2或3所述探针组合的检测试剂或试剂盒。5.一种检测IL28B基因多态性的PCR反应液,其特征在于,所述PCR反应液包括权利要求1所述的引物组合与权利要求2或3所述的探针组合...
【专利技术属性】
技术研发人员:贺庭祯,罗德朋,向霄,熊伟,黎帮勇,钟越,刘黎,董锐,崔奇新,杨园,
申请(专利权)人:重庆京因生物科技有限责任公司,
类型:发明
国别省市:重庆,50
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