The present invention provides a rapid detection kit for CYP2C19*2 or*3 genotypes based on POCT mode, which contains at least fluorescent quantitative PCR primers and probes and cell lysate for detecting CYP2C19*2 (rs4244285, SEQ ID NO:1*4) or *3 (rs4986893, SEQ ID NO:5*8) genotypes, in addition to dNTPs, DNA polymerase and Mg.
【技术实现步骤摘要】
基于POCT模式的CYP2C19*2或*3基因型快速检测试剂盒
本专利技术涉及分子生物学领域,具体地说,涉及一种基于POCT模式的CYP2C19*2或*3基因型快速检测试剂盒。
技术介绍
细胞色素P450(CytochromeP450)同工酶,是由一系列结构和功能相关的酶组成的超家族,包括CYP1、2、3家族。CYP2C19是CYP2C家族的重要酶,在体内药物代谢反应中发挥重要作用。CYP2C19基因具有遗传多样性,酶活性在不同个体间存在差异,使得不同个体对于药物的代谢能力存在较大差异,使得人群出现快代谢型、中间代谢型和慢代谢型3种表型。CYP2C19基因多态性主要由两种突变引起:一种突变降低酶活性;一种突变增强酶活性。其中,CYP2C19*2(681G>A,rs4244285)和CYP2C19*3(636G>A,rs4986893)突变是最主要的两种突变类型,引起CYP2C19酶活性降低。研究表明,慢代谢型个体携带两个降低CYP2C19酶活性的突变位点,如CYP2C19*2/*2、CYP2C19*3/*3和CYP2C19*2/*3;中 ...
【技术保护点】
1.用于检测CYP2C19*2及*3基因型的荧光定量PCR引物和探针,其特征在于,包括上游引物、下游引物、野生型探针和突变型探针,它们的核苷酸序列分别如下:用于检测CYP2C19*2基因型的荧光定量PCR引物和探针:上游引物:5’‑CAGAGCTTGGCATATTGTATCTATA‑3’下游引物:5’‑CGAGGGTTGTTGATGTCCATC‑3’野生型探针:5’‑F1‑TTTCCCGGGAACC‑Q‑3’突变型探针:5’‑F2‑TTCCCAGGAACCC‑Q‑3’用于检测CYP2C19*3基因型的荧光定量PCR引物和探针:上游引物:5’‑CAGCAATTTCTTAACT ...
【技术特征摘要】
1.用于检测CYP2C19*2及*3基因型的荧光定量PCR引物和探针,其特征在于,包括上游引物、下游引物、野生型探针和突变型探针,它们的核苷酸序列分别如下:用于检测CYP2C19*2基因型的荧光定量PCR引物和探针:上游引物:5’-CAGAGCTTGGCATATTGTATCTATA-3’下游引物:5’-CGAGGGTTGTTGATGTCCATC-3’野生型探针:5’-F1-TTTCCCGGGAACC-Q-3’突变型探针:5’-F2-TTCCCAGGAACCC-Q-3’用于检测CYP2C19*3基因型的荧光定量PCR引物和探针:上游引物:5’-CAGCAATTTCTTAACTTGATGGA-3’下游引物:5’-CAATATAGAATTTTGGATTTCCCAG-3’野生型探针:5’-F1-CCCCTGGATCCAG-Q-3’突变型探针:5’-F2-ACCCCCTGAATCCA-Q-3’其中,F1和F2为不同的荧光报告基团,Q为荧光淬灭基团。2.根据权利要求1所述的引物和探针,其特征在于,所述探针如下:CYP2C19*2探针:野生型探针:5’-F1-TTTCCCGGGAACC-Q-3’突变型探针:5’-F2-TTCCCAG+GAACCC-Q-3’CYP2C19*3探针:野生型探针:5’-F1-CCCCTGG+ATCCAG-Q-3’突变型探针:5’-F2-ACCCCCTG+AATCCA-Q-3’其中,+表示LNA修饰碱基。3.含有权利要求1或2所述引物和探针的检测试剂或试剂盒。4.用于荧光定量PCR检测CYP2C19*2或*3基因型的反应体系,其特征在于,所述反应体系包括权利要求1或2所述引物和探针、DNA聚合酶、dNTPs、Mg2+、反应缓冲液和细胞裂解液;其中,所述细胞裂解液由十二烷基硫酸钠和聚乙二醇辛基苯基醚组成。5.根据权利要求4所述的反应体系,其特征在于,所述反应体系中各组分的终浓度为:0.5-1.5×PCR反应缓冲液、DNA聚合酶0....
【专利技术属性】
技术研发人员:贺庭祯,罗德朋,黎帮勇,向霄,熊伟,钟越,刘黎,董锐,崔奇新,杨园,
申请(专利权)人:重庆京因生物科技有限责任公司,
类型:发明
国别省市:重庆,50
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