抗生素溶杆菌环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒及检测方法技术

本发明专利技术公开了一种抗生素溶杆菌环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒及检测方法，其中试剂盒借助生物信息平台进行大规模基因组分析，根据抗生素溶杆菌的吩嗪合成基因

【技术实现步骤摘要】
抗生素溶杆菌环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒及检测方法
本专利技术涉及一种利用环介导恒温基因扩增（loop-mediatedisothermalamplificationofDNA，LAMP）技术进行菌样快速检测的试剂盒，具体涉及一种抗生素溶杆菌环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒及检测方法。
技术介绍
农作物病害是制约农业生产的一个重要因素，生产中主要通过选育抗病品种和化学农药防治。但由于化学农药的非生物源性容易使有害生物产生抗性，再加上滥用化学农药，导致了化学农药在自然界和食物链中长期残留造成了环境污染、生态平衡破坏、社会公害等严重后果。而微生物农药具有对非靶标生物安全、毒副作用小、对环境兼容性好等特点，在控制植物病害方面倍受青睐。抗生素是微生物的天然代谢产物。溶杆菌属细菌是一类重要的微生物资源，已成为各国开发新型抗生素的重要来源。在国外该属细菌产生的抗生素在医学和农业病害控制方面都有一定的研究。溶杆菌（Lysobacte）革兰氏染色阴性，杆状，两端钝圆，单生，无鞭毛，滑行运动，好气性，代谢为呼吸型，无芽孢，氧化酶阳性，过氧化氢酶阳性，G+C含量为65.4%-70.1%。在自然界，从海洋到河流、土壤中广泛分布，为腐生性，通过降解有机物和其他微生物获取营养来生存。溶杆菌属共有4个种，分别为产酶溶杆菌、抗生素溶杆菌、变棕溶杆菌和胶状溶杆菌。溶杆菌对多种病原真菌、细菌和线虫具有溶菌活性等典型特征。抗生素溶杆菌（Lysobaterantibioticus）对多种植物病原菌具有明显抑制作用，同时在田间对多种细菌病害表现出良好的防病效果。通过进一步研究，有望开发为一种能防治植物病害的新型微生物农药。目前针对抗生素溶杆菌有多种检测方法。传统的增菌培养方法一般需要10天以上，周期较长，并且需要使用实验动物，成本较高；免疫学检测（Immunoassay，IA）是一种根据抗原、抗体反应的原理，利用已知的抗原检测未知抗体或利用已知的抗体检测未知抗原的技术，主要包括酶联免疫吸附（ELISA）、放射免疫（RIA）、反向间接血凝法（RPHA）和反向乳胶凝集实验（RPLA）等，此类方法周期短，一次可检测大量样本，并且不需实验动物，但其缺点是必须有高亲和性的抗体；实时荧光定量PCR方法能够用于病原菌的检测，但对仪器设备和人员的专业技术水平要求较高，并且操作复杂，耗时较长，限制了该技术的推广。DNA环介导恒温核酸扩增技术（LAMP）是一种新型的恒温核酸扩增方法，此技术克服了以往基因扩增方法的不足，能够在恒温条件下进行核酸的扩增，具有简单、快速、成本低和特异性强等优点，适于现场检测，有较好的应用性。目前，还没有专门针对抗生素溶杆菌的环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒及检测方法的相关记载。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供了一种快速灵敏准确的抗生素溶杆菌环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒及检测方法。本专利技术为实现上述目的采用如下技术方案：抗生素溶杆菌环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒，其特征在于包括：（1）反应液1：由10mmol/L脱氧核苷三磷酸、10×ThermoPolBuffer反应缓冲液、150mmol/L硫酸镁、5mol/L甜菜碱和灭菌双蒸水组成；（2）反应液2：由10μmol/L外引物1、10μmol/L外引物2、40μmol/L内引物1和40μmol/L内引物2组成，引物序列如下：外引物1：GCGAGCATGCAGCAGC，外引物2：GGCAAGGTCGCGAGGAT，内引物1：CACCGGCAAGGTCGACGAGG-CGATTCCGGCCTGGGA，内引物2：CGCGCCATGTCTTCGTGGG-GCGCAGGTCGGGTTTCA；（3）8U/μLBstDNA聚合酶；（4）显色剂：质量浓度为10%的SYBRGreenI荧光染料；上述环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒中反应液1折合每样品19μL，其组成为：10mmol/L脱氧核苷三磷酸4μL、10×ThermoPolBuffer反应缓冲液2.5μL、150mmol/L硫酸镁1μL、5mol/L甜菜碱5μL和灭菌双蒸水6.5μL；反应液2折合每样品3μL，其组成为：10μmol/L外引物10.5μL、10μmol/L外引物20.5μL、40μmol/L内引物11μL和40μmol/L内引物21μL。本专利技术所述的抗生素溶杆菌环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒的检测方法，其特征在于具体步骤为：步骤（1），提取待检样品基因组DNA，采用试剂盒提取法制备待检样品基因组DNA；步骤（2），环介导恒温扩增反应，取2μL待检样品基因组DNA溶液，加入19μL反应液1、3μL反应液2和1μL8U/μLBstDNA聚合酶，将配制好的反应体系在65℃扩增反应50-70min后取出待检；步骤（3），分析判断反应结果，在反应产物中加入1μL显色剂，混匀，静置2min，若反应液显现绿色即为阳性，橙色则为阴性。本专利技术根据抗生素溶杆菌的吩嗪合成基因phzF设计了四条特异性引物，该基因序列为抗生素溶杆菌所共有，以保证检测不同来源的抗生素溶杆菌的可靠性。本专利技术采用LAMP技术，针对抗生素溶杆菌建立了快速灵敏准确的检测方法，并构建用于该方法的快速检测试剂盒。使用本专利技术的快速检测试剂盒和检测方法，在反应后可通过肉眼观察鉴定，无需电泳等其它任何分析设备，具有检测时间短、特异性强、仪器设备要求低和操作简便等优点，可用于抗生素溶杆菌的快速检测。附图说明图1是不同菌株的阳性扩增结果对比图，其中1号反应管内样品为绿色，2-7号反应管内样品为橙色。具体实施方式下面结合具体实施例，对本专利技术中试剂盒及检测方法的建立和应用作进一步说明，但并不以任何形式限制本专利技术的内容。实施例1抗生素溶杆菌环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒及检测方法的建立步骤（1），引物的设计、合成试剂盒的组装本实施例确定用于检测的引物序列如下：外引物1：GCGAGCATGCAGCAGC，外引物2：GGCAAGGTCGCGAGGAT，内引物1：CACCGGCAAGGTCGACGAGG-CGATTCCGGCCTGGGA，内引物2：CGCGCCATGTCTTCGTGGG-GCGCAGGTCGGGTTTCA；在此基础上设计用于抗生素溶杆菌环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒，该试剂盒包括以下试剂：（1）反应液1：由10mmol/L脱氧核苷三磷酸（dNTP）、10×ThermoPolBuffer反应缓冲液、150mmol/L硫酸镁（MgSO4）、5mol/L甜菜碱和灭菌双蒸水（ddH2O）组成；（2）反应液2：由10μmol/L外引物1（F3）、10μmol/L外引物2（B3）、40μmol/L内引物1（FIP）和40μmol/L内引物2（BIP）组成；（3）8U/μLBstDNA聚合酶；（4）显色剂：质量浓度为10%的SYBRGreenI荧光染料；上述环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒中反应液1折合每样品19μL，其组成为：10mmol/L脱氧核苷三磷酸（dNTP）4μL、10×ThermoPolBuffer反应缓冲液2.5μL、150mmol/L硫酸镁（MgSO4）1μL、5mol/L甜菜碱5μL和灭菌双蒸水（ddH2O）6.5μL；反应液2折合每样品3μL，其组成为：10μm本文档来自技高网...

【技术保护点】
抗生素溶杆菌环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒，其特征在于包括：（1）反应液1：由10mmol/L脱氧核苷三磷酸、10×ThermoPol Buffer反应缓冲液、150mmol/L硫酸镁、5mol/L甜菜碱和灭菌双蒸水组成；（2）反应液2：由10μmol/L外引物1、10μmol/L外引物2、40μmol/L内引物1和40μmol/L内引物2组成，引物序列如下：外引物1：GCGAGCATGCAGCAGC，外引物2：GGCAAGGTCGCGAGGAT，内引物1：CACCGGCAAGGTCGACGAGG‑CGATTCCGGCCTGGGA，内引物2：CGCGCCATGTCTTCGTGGG‑GCGCAGGTCGGGTTTCA；（3）8U/μL Bst DNA聚合酶；（4）显色剂：质量浓度为10%的SYBR Green I荧光染料；上述环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒中反应液1折合每样品19μL，其组成为：10mmol/L脱氧核苷三磷酸4μL、10×ThermoPol Buffer反应缓冲液2.5μL、150mmol/L硫酸镁1μL、5mol/L甜菜碱5μL和灭菌双蒸水6.5μL；反应液2折合每样品3μL，其组成为：10μmol/L外引物1 0.5μL、10μmol/L外引物2 0.5μL、40μmol/L内引物1 1μL和40μmol/L内引物2 1μL。...

【技术特征摘要】
1.抗生素溶杆菌环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒，其特征在于包括：（1）反应液1：由10mmol/L脱氧核苷三磷酸、10×ThermoPolBuffer反应缓冲液、150mmol/L硫酸镁、5mol/L甜菜碱和灭菌双蒸水组成；（2）反应液2：由10μmol/L外引物1、10μmol/L外引物2、40μmol/L内引物1和40μmol/L内引物2组成，引物序列如下：外引物1：GCGAGCATGCAGCAGC，外引物2：GGCAAGGTCGCGAGGAT，内引物1：CACCGGCAAGGTCGACGAGG-CGATTCCGGCCTGGGA，内引物2：CGCGCCATGTCTTCGTGGG-GCGCAGGTCGGGTTTCA；（3）8U/μLBstDNA聚合酶；（4）显色剂：质量浓度为10%的SYBRGreenI荧光染料；上述环介导恒温基因扩增快速检测试剂盒中反应液1折合每样品19μL，其组成为：10mmol/L脱氧核苷...

【专利技术属性】
技术研发人员：徐雅梦，姜晓冰，姜晓杰，于涛，张艺鸽，
申请(专利权)人：河南师范大学，
类型：发明
国别省市：河南,41