The invention belongs to molecular diagnostic technology, and uses direct PCR combined with hybridization (RDB) technology to rapidly and simultaneously detect three non-deletion types of alpha thalassemia (alpha) by gene chip, amplification reagent and kit for detecting alpha thalassemia.
【技术实现步骤摘要】
一种用于检测α地中海贫血的基因芯片、扩增试剂及试剂盒
本专利技术涉及α-地中海贫血的分子检测技术,特别是涉及一种利用直接PCR(DirectPCR)结合杂交(RDB)技术快速同时检测α-地中海贫血3种非缺失型(αCSα、αQSα、αWSα)及4种缺失型(--SEA、--THAI、-α4.2和-α3.7)试剂盒。
技术介绍
地中海贫血(thalassemia,简称地贫),是由于珠蛋白基因的缺陷(基因突变或缺失)使血红蛋白(hemoglobin,Hb)的珠蛋白肽链有一种或几种合成减少或不能合成,而引起血红蛋白的α-链/非α-链比例失衡,进而导致血红蛋白不稳定、红细胞破坏,血红蛋白产量减少所引起的一组全球最常见严重威胁人类健康的致死、致残的遗传性血液病。以α和β地中海贫血为主要类型。α-地中海贫血(以下简称α-地贫),其分子基础是位于16号染色体短臂末端16p13.3位点上的α珠蛋白基因簇的先天性遗传缺陷,根据基因的缺失或突变情况及临床表现严重程度,可将α地贫分为静止型(-α/αα)、轻型(标准型,--/αα或-α/-α)、中间型(HbH病,--/-α或--/αTα)和 ...
【技术保护点】
1.一种用于检测α‑地中海贫血的基因芯片,其特征在于,所述芯片上固定有:用于检测3种非缺失型α‑地中海贫血基因αCSα、αQSα、αWSα所对应的探针,其碱基序列如SEQ ID NO:11‑16所示;和/或用于检测4种缺失型α‑地中海贫血基因‑‑SEA、‑‑THAI、‑α4.2和‑α3.7的探针,其碱基序列如SEQ ID NO:17‑20所示。
【技术特征摘要】
1.一种用于检测α-地中海贫血的基因芯片,其特征在于,所述芯片上固定有:用于检测3种非缺失型α-地中海贫血基因αCSα、αQSα、αWSα所对应的探针,其碱基序列如SEQIDNO:11-16所示;和/或用于检测4种缺失型α-地中海贫血基因--SEA、--THAI、-α4.2和-α3.7的探针,其碱基序列如SEQIDNO:17-20所示。2.根据权利要求1所述的基因芯片,其特征在于,所述芯片上还固定有阴性对照探针(NC),其碱基序列如SEQIDNO:21,阳性对照探针(AC),其碱基序列如SEQIDNO:22,显色体系控制探针(CC),其碱基序列如SEQIDNO:23。3.一种用于PCR检测非缺失α-地中海非贫血基因的扩增试剂,其特征在于:包括如下核苷酸序列的引物组:APF:SEQIDNO.1,APR:SEQIDNO.2;其扩增的特征序列与权利要求1或2所述的基因芯片中的用于检测三种非缺失型α-地中海贫血基因αCSα、αQSα、αWSα所对应的探针特异性结合;所述扩增试剂中加入其它PCR扩增组分,通过一次PCR反应对待测样品或提取自待测样品的DNA直接进行三种非缺失α-地中海贫基因QS、CS、WS;所述待测样品选自新鲜采集的抗凝外周血、-20℃--80℃保存未反复冻融的陈旧性抗凝外周血、培养羊水细胞、绒毛、羊水、脐带血、末梢血、DBS样本和/或类似DBS处理的样本、唾液、胚胎的遗传物质包括配子如精子或卵子、卵裂期胚胎的卵裂球、囊胚滋养外胚层细胞,即囊胚细胞、多个细胞或单个细胞等。4.根据权利要求3所述的扩增试剂,其特征在于,用于一个反应的所述PCR扩增试剂中,含有:5.一种用于PCR检测缺失型α-地中海非贫血基因的扩增试剂,其特征在于:包含如下核苷酸序列的引物组:SEAF:SEQIDNO.3SEAR:SEQIDNO.4THAIF:SEQIDNO.5THAIR:SEQIDNO.64.2F:SEQIDNO.74.2R:SEQIDNO.83.7F:SEQIDNO.93.7R:SEQIDNO.10其扩增的特征序列与权利要求1或2所述的基因芯片中的用于检测四种缺失型α...
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