一种黄牛SPAG17基因插入/缺失的检测方法及其应用技术

本发明专利技术公开了一种黄牛SPAG17基因插入/缺失的检测方法及其应用。以包含SPAG17基因的待测全基因组DNA为模板，以参照牛全基因组设计的引物对P1为引物，通过PCR技术扩增SPAG17基因，再进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果鉴定SPAG17基因在AC_000160:g146755-146756insTCCTGACT位点存在不同的基因型。结果发现，SPAG17基因8-bp插入/缺失的不同类型与夏南牛体高和体斜长等生长发育性状之间存在显著相关，提示SPAG17基因8-bp插入/缺失的不同类型可作为提高夏南牛生长发育性状的DNA标记。故本发明专利技术将有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于现代生物技术与家畜育种领域，涉及基因插入/缺失(indel)的检测，特别涉及一种检测夏南牛SPAG17基因8-bp插入/缺失(indel)的方法。
技术介绍
动物育种技术主要包括以表型和表型值为基础的常规育种技术和以DNA多态为基础的分子育种技术。作为分子育种技术体系的重要组成部分，分子标记辅助选择(marker-assistedselection，MAS)育种技术首先检测重要基因的DNA多态性，然后分析DNA多态与遗传性状之间的相关性，最后再根据与遗传性状显著相关的DNA标记进行性状选择。作为现代分子生物学技术发展过程中孕育而生的新技术，MAS育种技术可以在DNA水平上快速准确地分析个体的遗传组成，该方法通过有性杂交将目的基因转移到需要改良的亲本中，将目标基因型的鉴定与传统育种相结合，从而实现对基因型的直接选择，提高育种目标的定向性。该方法在克服表型鉴定的困难、早期选择、进行无损害的性状评价和选择及提高回交育种效率等方面具有优越性。在MAS育种技术体系中，寻找重要功能基因、筛查重要基因遗传变异位点，并分析重要功能基因遗传变异位点与生长本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种黄牛SPAG17基因插入/缺失的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：以待测夏南牛全基因组DNA为模板，以引物对P1为引物，通过PCR扩增夏南牛SPAG17基因片段，该片段包含夏南牛SPAG17基因8‑bp插入/缺失多态性位点；再对PCR扩增得到的片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定夏南牛SPAG17基因8‑bp插入/缺失多态性位点的插入/缺失多态性；所述的引物对P1为：上游引物：5’‑ACATGGGAGAAATACCCG‑3’；下游引物：5’‑GTCTGAAGATGGCAAACG‑3’。

【技术特征摘要】
1.一种黄牛SPAG17基因插入/缺失的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：以待
测夏南牛全基因组DNA为模板，以引物对P1为引物，通过PCR扩增夏南牛SPAG17基
因片段，该片段包含夏南牛SPAG17基因8-bp插入/缺失多态性位点；再对PCR扩增得到
的片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定夏南牛SPAG17基因8-bp插
入/缺失多态性位点的插入/缺失多态性；所述的引物对P1为：
上游引物：5’-ACATGGGAGAAATACCCG-3’；
下游引物：5’-GTCTGAAGATGGCAAACG-3’。
2.根据权利要求1所述一种黄牛SPAG17基因插入/缺失的检测方法，其特征在于：
所述PCR的扩增反应程序为：
1)94℃预变性5min，然后进入步骤2)；
2)94℃变性30s，复性30s，72℃延伸20s；共18个循环；第一个循环中复性温
度为68℃，剩余每个循环中复性温度较上一个循环降低1℃，然后进入步骤3)；
3)94℃变性30s，60℃复性30s，72℃延伸20s；共24个循环，然后进入步骤
4)；
4)...

【专利技术属性】
技术研发人员：蓝贤勇，金云云，陈宏，雷初朝，祁兴磊，林凤鹏，祁兴山，屈卫东，
申请(专利权)人：西北农林科技大学，
类型：发明
国别省市：陕西;61