应用RNA酶保护法高通量筛选天然存在的正义-反义转录物制造技术

技术编号:1754819 阅读:207 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术涉及一种高通量筛选天然存在的正义-反义转录物(Naturalsense-antisense  transcripts,NSATs)的新方法。本发明专利技术利用细胞内NSATs是双链RNA分子的特点,以及双链RNA分子能够免受单链RNA特异的RNaseⅠ的酶解作用,从而在RNaseⅠ酶解反应中保留下来的特性,建立了通过实验的手段来实现高通量筛选细胞内真正的NSATs的方法。利用这一方法,可以通过高通量筛选各种来源和状态的组织或细胞内真正的正义RNA-反义RNA复合物,理论上,通过该方法可以获得细胞内任何一个存在的NSATs。在鉴定RNA作用的靶向基因或筛选潜在的RNA药物时,本发明专利技术也有重要的应用价值。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
本专利技术涉及一种高通量筛选细胞内真正的正义-反义转录物的新方法,实施步骤为:i.提取组织总RNA。ii.用RNaseⅠ处理总RNA。iii.证实残余的RNA是双链RNA(Double-strandedRNA,dsR NA)。iv.证实残余的RNA是细胞内源的RNA。v.把双链RNA变性为单链RNA。vi.把单链RNA逆转录为互补的DNA(ComplementDNA,cDNA)。vii.在cDNA的3’端加上多聚A。   viii.合成cDNA的第二条链。ix.制备双链DNA(Double-strandedDNA,dsDNA)的一个平端和一个粘端。x.把双链DNA克隆入克隆载体。xi.把重组载体转化如宿主细胞,构建总RNA中 NSATs的cDNA文库。xii.对克隆进行序列测定。xiii.把克隆序列进行生物信息学分析。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:刘德培柯细松宫环陆璐屈祎
申请(专利权)人:中国医学科学院基础医学研究所
类型:发明
国别省市:11[中国|北京]

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