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棉花纤维的类β微管蛋白及其编码基因与应用制造技术

技术编号:1723867 阅读:151 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术公开了棉花纤维的类β微管蛋白及其编码基因与应用,目的是提供和棉花纤维伸长具有密切相关的类β微管蛋白及其编码基因。本发明专利技术所提供的棉花纤维类β微管蛋白的名称为Gh-BtubL,是具有序列表中序列2氨基酸残基序列的蛋白质,或者是将序列2的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有与序列2的氨基酸残基序列相同活性的由序列2衍生的蛋白质。棉花纤维类β微管蛋白Gh-BtubL的编码基因,是下列核苷酸序列之一:1)序列表中序列1的DNA序列;2)与序列表中序列1限定的DNA序列具有85%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA序列。(*该技术在2022年保护过期,可自由使用*)

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及植物蛋白及其编码基因与应用,特别是涉及棉花纤维的类β微管蛋白及其编码基因与应用。1992年,John和Crow克隆并分析了第一个纤维特异表达基因E6,掀起了克隆纤维特异基因的热潮。E6转录子在纤维发育的整个过程中都能检测到。E6的mRNA和蛋白浓度在初生壁合成晚期和次生壁合成早期最高,未发现与E6基因同源的已知原核或真核基因。然而,将反义基因转入棉花中,未发现纤维的发育和品质有明显的表型变化,表明E6基因对于纤维的正常发育和结构完整不是至关重要的。1995年,Delmer等克隆到棉纤维特异的GTP结合蛋白基因Rac13,在发育的纤维中高效表达,在由伸长期向次生细胞壁合成转换期表达量最高,此时细胞骨架正进行重新组织。因此Rac13可能在细胞骨架组织的信号传递中发挥作用。1995年,John 克隆到一纤维高表达基因B6,长1.2kb,它在初生壁和次生壁合成阶段都有表达,蛋白有一个疏水N末端和两个富含Pro的区域。并获得了上游2.3kb启动子区,能引导GUS的瞬时表达。但该基因的功能不详。1995年,John和Keller 克隆到纤维特异表达的基因H6,蛋白中富含Pro,存在17个五氨基基元(motif)Ala(Ser)-Thr(Ser)-Pro-Pro-Pro。其mRNA在初生壁形成早期聚集,但其蛋白在初生壁形成晚期即次生壁合成期开始时聚集,表明H6可能存在翻译水平的调节并在次生壁装配中发挥作用。从它的氨基酸组成和可溶性推测它可能属于阿拉伯半乳糖蛋白(AGP),作为细胞膜嵌入成分参与棉花纤维次生壁的发育和构架。1995年,Ma等克隆到GH3,它编码一脂转移蛋白(LTP),可能定位于纤维细胞外膜。GH3基因受发育调控,在伸长期表达量最高,可能参与跨膜转运几丁质单体,促进几丁质合成。1996年,Reinhart等克隆到棉纤维特异表达的基因FbL2A。它的表达受发育调控,在初生壁合成晚期和次生壁合成早期被激活。该基因编码一个43.4KD的蛋白,除N端疏水外高度亲水,62%由重复基元组成,有一个55氨基酸的区域重复4次之多。该蛋白在纤维细胞中的功能不详。1997年,Ma等克隆到脂转移蛋白Ltp6基因,与GH3的氨基酸同源性为64%。Ltp6也在纤维细胞中伸长期表达量最高,只是表达水平低些。1999年,Hsu等分离到Ltp6的启动子,Ltp6启动子具有组织表达特异性。1997年,Oxford和Timmis克隆到脂转移蛋白FS6(LTP)和一富含Pro蛋白(PRP)FS17,两者都在纤维发育早期高表达。存在的信号肽序列表明,LTP和PRP都定位于纤维的胞外基质中。FS6与以前发现的棉花LTP GH3氨基酸同源性为88%,但两者疏水性差别很大。FS17可能有强化细胞壁的功能,它与细胞壁复杂的结构相连接,快速伸长的纤维细胞中富含FS17,可能与这种生长需要持续供应壁物质有关,存在典型的PRP重复基元(motif)PPVYK,与以前报道的富含Pro蛋白H6无显著相似性。另一纤维特异未知功能的蛋白B6,有两个富含Pro的区域,但这两个区域都与FS17中的重复序列不相似。1997年,Song和Allen克隆到棉纤维特异表达的基因酰基载体蛋白(ACP)。Northern blot表明该基因在纤维伸长期高效表达,Southern blot分析发现单拷贝的ACP可能在棉花A和D基因组中都存在,在进化过程中,ACP基因家族的一员特异表达成为纤维,可能为迅速伸长的纤维合成膜脂。1998年,Kawai等克隆到GhCAP(adenyl cyclase-associated)基因。GhCAP编码471aa的读码框。Northern blot表明GhCAP主要在纤维伸长期表达。GhCAP在微丝组织中起作用,可能在细胞骨架重组中起信号传递作用。1998年,Oxford和Timmis克隆到pGhEX1。它编码expansin。该基因只在棉纤维中表达,在伸长期受发育调控,即16DPA时最高,之后下降。研究表明它可能与植物细胞膨压驱动的生长有关,同时也发现棉纤维细胞基因表达在转录水平上受到调控。1999年,Loguercio等克隆到几个可能与棉花纤维分化及发育相关的myb类基因。研究了6个属于R2R3-MYB家族的棉花myb类基因(GhMYB)在异源四倍体陆地棉中的表达特性。在反式调节区内发现了可能调节GhMYB活性的几个结构域和基元。一个是存在于5个GhMYB中的恰好位于DNA结合结构域(DBD)下游的40个氨基酸的碱性区域(TRR1)。并且,存在于一类植物MYB中的保守基元GIDxxH也存在于GhMYB1和GhMYB6TRR1结构域的同一位置。至少两个GhMYBs(GhMYB4和GhMYB5)在5’前导序列(5’-uORFs)有未定性的读码框,可能在翻译水平调节这些GhMYB蛋白的合成。多个DNA结合结构域(DBD)的存在表明GhMYB与苯丙酸合成相关的植物R2R3-MYB有结构相似性。GhMYB5是与棉花R2R3-MYB关系最远的,与干旱诱导的AtMYBG11同处于一个孤立的基因簇。除了保守的基元外,序列分析并未发现GhMYB、MIXTA(AmMYBMx)和G11(AtMYBG11)在DBD和TRR有其他相似性。然而进化树分析发现,GhMYB2、GhMYB3和GhMYB4属于包括GLABROUS1的基因簇,而GhMYB1和GhMYB6属于关系近的基因簇。半定量RT-PCR分析显示,GhMYB基因表达有两个不同的类型一型GhMYB(GhMYB-1,-2和-3)转录子在所有组织中都有,并且比二型丰度高;二型GhMYB(GhMYB-4,-5和-6)在纤维中高表达。GhMYB表达的发育调控与这些DNA结合因子在纤维分化和伸长中的功能一致。1999年,Oxford等克隆到一全长cDNA克隆FS18,它是只编码71个氨基酸的蛋白,与LTP有一些相似性,功能不详。该基因在纤维中高表达,尤其突出的是它在次生壁合成开始和以后(18-24DPA)表达量最高。2001年,Cui等克隆到新基因CFL1,该基因与FKS1酵母β-1,3-葡聚糖(胼胝质)合酶催化亚基同源。CFL1在纤维初生壁合成期高表达,它在幼根中表达量也较高。序列分析和CaM-gel overlay assay推测在它亲水性的N末端有一CaM结合位点。Product-entrapment assay显示,该蛋白能与体外合成的胼胝质沉淀结合。CFL1是酵母β-1,3-葡聚糖合酶催化亚基FKS1的植物同系物,可能在胼胝质合成中起作用。2001年,Zhao等克隆到10个纤维特异cDNA。其中5个分别编码二磷酸核甘酸酶(bisphosphate nucleotidase)、α-tubulin、β半乳糖甘酶、膜连蛋白(annexin)和可逆糖基化多肽;另5个功能未定。这10个cDNA都在纤维细胞高效表达,绝大多数在纤维发育的早期累积,除了F14,它在纤维发育晚期表达量最高。2001年,Tan等克隆了一个在棉花纤维和根尖组织中特异表达的基因ghprp1(proline-rich proteins),该基因编码一个299个氨基残基的蛋白质,在该蛋白的N端有一疏水信号肽。该基因存在于本文档来自技高网...

【技术保护点】
棉花纤维的类β微管蛋白Gh-BtubL,是具有序列表中序列2氨基酸残基序列的蛋白质,或者是将序列2的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有与序列2的氨基酸残基序列相同活性的由序列2衍生的蛋白质。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

【专利技术属性】
技术研发人员:朱玉贤姬生健卢迎春冯建勋
申请(专利权)人:北京大学
类型:发明
国别省市:11[中国|北京]

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