基于基本原理的癌症靶向疗法的设计制造技术

本发明专利技术的方法、组合物和药剂盒与来他替尼降低SPOP底物的水平和途径活性的发现有关。因此，本文描述了使用来他替尼下调有需要的受试者中的一种或多种SPOP底物或其信号传导途径活性的方法和组合物。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】交叉引用本申请要求于2013年12月3日提交的美国临时申请号61/911,423的权益，该临时申请在此通过引用以其全文并入本文。
技术介绍
遍在蛋白(ubiquitin)介导的蛋白质降解通常通过遍在蛋白蛋白酶体途径发生。在该途径中，遍在蛋白-蛋白质连接酶(例如，E3连接酶)通过将遍在蛋白链连接至待降解的蛋白质而靶向选定的供降解的蛋白质。遍在蛋白化使得该蛋白质能够随后被蛋白酶体复合物识别，然后该复合物降解该蛋白质。斑点(speckle)型POZ蛋白(SPOP)通过起到底物识别的作用而与遍在蛋白介导的靶蛋白降解有关。SPOP通常包含两个结构域：MATH域以及痘病毒和锌指(POZ)域(或者被称为BTB域)。SPOP的一般结构在图1中示出。SPOP蛋白通常通过其MATH和POZ域将蛋白质底物(例如，SPOP底物)募集至E3遍在蛋白连接酶。SPOP底物通常与SPOP蛋白的MATH域复合，而滞蛋白-3E3遍在蛋白连接酶与POZ域相互作用。SPOP介导的SPOP底物向滞蛋白-3型E3遍在蛋白连接酶的募集有利于SPOP底物的E3介导的遍在蛋白化，由此靶向供蛋白酶体降解的底物。人前列腺肿瘤的外显子组测序揭示，前列腺肿瘤的子集包含SPOP突变(Nature Genetics 2012；44:685–689，在此通过引用并入本文)。总而言之，发现SPOP突变存在于6-15％的研究中的前列腺肿瘤中(Nature Genetics 2012；44:685–689)。有趣的是，与前列腺肿瘤相关的所有鉴别的SPOP突变都在SPOP的底物结合袋内(Nature Genetics 2012；44:685–689)，表明这样的突变可能损害SPOP底物结合以及随后的遍在蛋白化(Proc Natl Acad Sci USA.2013 110:6997-7002，在此通过引用并入本文)。据报道，SRC-3蛋白在38％的前列腺癌肿瘤样品中过表达(Br J Cancer.2001；85:1928-36，在此通过引用并入本文)。另一项研究显示，SCR-3表达是前列腺癌细胞增殖和存活所需的，并且其水平与前列腺特异性抗原(PSA)相关。在来自接受前列腺切除术的患者的一批前列腺癌样品中，证明了具有SRC3高表达的肿瘤与较低的无复发生存率有关(Cancer Res.2005Sep 1；65(17):7976-83，在此通过引用并入本文)。这些研究提示了SCR-3在前列腺癌形成中以及作为不良预后因素的重要作用。此外，与前列腺癌相关的SPOP突变阻碍了SPOP诱导SRC-3的遍在蛋白依赖性降解的能力(Proc Natl Acad Sci USA.2013 110:6997-7002)。也已经证明，SRC3在乳腺癌中在基因水平和转录水平上均增加(Nature Reviews Clinical Oncology 2010；7:83-89，在此通过引用并入本文)。例如，在一项研究中，58％的乳房肿瘤活检物展示了升高的SRC3基因表达水平。升高的SRC3水平还与许多其他癌症有关。除了乳腺癌和前列腺癌之外，在胰腺癌和胃癌中也显示了升高的SRC3水平。Kim等人(APMIS.2013；121:626-33)通过单链构象多态性(SSCP)在45个胃癌样品、45个结直肠癌样品和45个前列腺癌样品中完成了SPOP的突变和表达分析。此外，他们还通过免疫组织化学分析了60个胃癌、60个结直肠癌和60个前列腺癌肿瘤标本中的SPOP蛋白表达。SPOP基因在编码序列中的三个体细胞错义突变(2个在前列腺癌中，1个在结直肠癌中)(Ser14Leu、Tyr87Cys和Phe133Leu)全部位于N-末端底物结合域中。在免疫组织化学中，SPOP蛋白在正常的胃、结肠和前列腺上皮细胞中表达，而在30％的胃癌、20％的结直肠癌和37％的前列腺癌中发现了SPOP的丧失。SRC3还在乳腺癌和其他恶性肿瘤中起关键作用(Science 1997；277:965-8,Ann Oncol.2013；24:1414)。在Burandt(Breast Cancer Res Treat.2013 137:745-53)报道的研究中，分析了2,197个乳腺癌样品，并且通过基因谱分析和免疫组织化学(IHC)发现SRC3过表达与肿瘤大小、高组织学分级、低疾病特异性和总生存率有关。在11％的癌中通过荧光原位杂交(FISH)发现了AIB1增加。它与高组织学分级、淋巴结累及以及疾病特异性存活差有关(Breast Cancer Res Treat.2013137:745-53)。在7％的胃癌标本中观察到SRC3增加，而在40％的胃癌标本中观察到SRC3过表达(Int J Cancer.2000；89:217-23)。SRC3增加通常与其过表达一致，并与预后不良有关。有趣的是，86个胃腺癌病例中有15个(17.4％)对雄激素受体是阳性的(J.Can.Res.Clin.Onc.2004；130:253-258)。与(AR-)患者相比，具有AR阳性肿瘤(AR+)的患者具有显著更差的预后(中值存活期9个月对24个月，P＝0.03)。鉴别出一种新的雌激素受体(ER)靶标—DEK，其表达也促进乳腺癌细胞中雌激素诱导的增殖。DEK消耗增加了ER+乳腺癌细胞系中他莫昔芬诱导的细胞死亡(PLoS ONE 2012；7:e46985)。DEK之前被鉴别为DNA重塑蛋白。DEK调控DNA损伤应答和信号传导修复。DEK起到转录因子的作用，并且据报道还是一种癌基因并且在几乎所有器官和肿瘤中广泛表达(Nucleic Acids Res.2011；39:7465-76)。DEK通过促进DNA双链断裂修复，经由p53依赖性和非依赖性机制，保护肿瘤细胞免受DNA损伤剂的影响和免遭细胞死亡。DEK的高表达与胃癌的预后不良有关(Diagn.Pathol.2014；9:67)。来他替尼(Lestaurtinib)是一种吲哚并咔唑衍生物，其最初作为多种受体激酶的抑制剂被发现，该受体激酶包括JAK2(IC50＝0.9nM)、PDGFβ(IC50＝216nM)、STAT3(IC50＝10-30nM)、TRKB(IC50＝<25nM)、PRK1(IC50＝8.6nM)和PKC(IC50＝226nM)以及FLT3(Cancer Res.1999；59:2395-401,Blood.2002；99:3885-91，其在此通过引用并入本文)。由于其受体激酶抑制活性，提出来他替尼作为前列腺癌的潜在治疗剂。然而，2期人类临床试验证明，用来他替尼治疗前列腺癌患者未能实现降低PSA水平的主要临床终点(Cancer Biol Ther.2007；6:1360-7，在此通过引用并入本文)。此后，进行了非常有限的来他替尼临床开发。
技术实现思路
本专利技术的方法、组合物和药剂盒与来他替尼可以降低SPOP底物或其下游靶标的表达水平和/或途径活性的发现有关。因此，本专利技术提供了一种下调有需要的受试者中的斑点型POZ蛋白(SPOP)底物信号传导的方法，其包括向该受试者施用包含治疗有效量的来他替尼或其药学上可接受的盐的药物组合物，由此下调该受试者中的SPOP底物信号传导。在一些实施方案中，该底物选自本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种下调有需要的受试者中的斑点型POZ蛋白(SPOP)底物信号传导的方法，其包括向该受试者施用包含治疗有效量的来他替尼或其药学上可接受的盐的药物组合物，由此下调该受试者中的SPOP底物信号传导。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2013.12.03 US 61/911,4231.一种下调有需要的受试者中的斑点型POZ蛋白(SPOP)底物信号传导的方法，其包括向该受试者施用包含治疗有效量的来他替尼或其药学上可接受的盐的药物组合物，由此下调该受试者中的SPOP底物信号传导。2.如权利要求1所述的方法，其中所述底物选自SRC1、SRC2、SRC3、Daxx、Gli、AWP-1、滞蛋白-4B和滞蛋白-7。3.如权利要求2所述的方法，其中所述底物是SRC1、SRC2或SRC3。4.如权利要求3所述的方法，其中所述底物是SRC3。5.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述下调包括降低所述SPOP底物或所述底物的下游靶标的水平和/或活性。6.如权利要求5所述的方法，其中所述下游靶标是PRK-1。7.如权利要求5所述的方法，其中所述下调包括降低所述SPOP底物的水平和/或活性。8.如权利要求5所述的方法，其中所述下调通过来源于所述受试者的细胞中所述下游靶标活性的降低来呈现。9.如权利要求5所述的方法，其中所述下调通过来源于所述受试者的细胞中所述底物水平的降低来呈现。10.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述水平包括表达水平。11.如权利要求10所述的方法，其中所述表达水平是蛋白质表达水平。12.如权利要求10所述的方法，其中所述表达水平通过所述SPOP底物的转录物的水平来呈现。13.如权利要求1所述的方法，其中所述下调通过所述细胞的胞质部分中所述底物水平的降低来呈现。14.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述受试者呈现出疾病的症状。15.如权利要求14所述的方法，其中所述疾病是前列腺疾病。16.如权利要求14所述的方法，其中所述疾病是前列腺肿瘤。17.一种治疗有需要的受试者的前列腺肿瘤的方法，其包括：(a)向所述受试者施用第一剂量的药物组合物，该药物组合物包含治疗有效量的来他替尼或其药学上可接受的盐；(b)确定来源于所述受试者的生物样品中的SPOP底物水平或其活性；以及(c)如果与未施用包含治疗有效量的来他替尼或其药学上可接受的盐的药物组合物的对照受试者相比，所述底物水平或其活性降低，则施用额外剂量的所述药物组合物。18.一种治疗受试者的前列腺肿瘤的方法，其包括向所述受试者施用包含治疗有效量的来他替尼或其药学上可接受的盐的药物组合物，其中与对照受试者相比，所述受试者展现出异常高的SPOP底物水平或其活性。19.如权利要求18所述的方法，其中所述异常高的水平通过所述肿瘤中SPOP突变的存在来呈现。20.如权利要求19所述的方法，其中所述突变导致所述SPOP氨基酸序列的位置31-161之间的氨基酸序列改变。21.如权利要求19所述的方法，其中所述氨基酸序列改变包括氨基酸置换。22.如权利要求19所述的方法，其中所述突变导致在所述SPOP氨基酸序列的Y87、F102、S119、F125、K129、W131、F133和/或K134处的置换。23.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述受试者是人。24.如权利要求16或18所述的方法，其中所述前列腺肿瘤是雄激素敏感的。25.如权利要求16或18所述的方法，其中所述前列腺肿瘤是雄激素不敏感的。26.一种下调前列腺细胞中的SPOP底物水平或其活性的方法，其包括：(a)向所述细胞施用有效量的来他替尼，由此下调所述细胞中的SPOP底物或其活性；以及(b)评价所述前列腺细胞中的SPOP底物水平或其活性的下调。27.如权利要求26所述的方法，其中所述前列腺细胞是前列腺癌细胞。28.如权利要求26所述的方法，其中所述前列腺细胞是培养的细胞。29.如权利要求26所述的方法，其中所述前列腺细胞是雄激素敏感的细胞。30.如权利要求26所述的方法，其中所述前列腺细胞是LNCaP细胞。31.如权利要求26所述的方法，其中所述底物选自SRC1、SRC2、SRC3、Daxx、Gli、AWP-1、滞蛋白-4B和滞蛋白-7。32.如权利要求31所述的方法，其中所述底物是SRC蛋白。33.如权利要求32所述的方法，其中所述SRC蛋白是SRC3蛋白。34.如权利要求26-33中任一项所述的方法，其中所述下调通过所述细胞中的所述底物水平的降低来呈现。35.如权利要求34所述的方法，其中所述表达水平包括蛋白质表达水平。36.如权利要求26-33中任一项所述的方法，其中所述下调通过所述细胞的胞质部分中所述底物的表达水平的降低来呈现。37.一种药剂盒，其包含：(a)药物组合物的...

【专利技术属性】
技术研发人员：艾伦·J·李，詹森·J·李，戴维·M·卢，瑞民·李，
申请(专利权)人：塞雷斯特拉生命科学有限责任公司，
类型：发明
国别省市：美国;US