在一些方面，本公开涉及用于减少假阳性连接事件的检测的方法。在一些方面，所述方法包括使用双重分割(或"复式分割")探针。当使用具有高连接效率但低特异性的连接酶(例如，连接酶)时，本文的所述方法特别适用于减少假阳性连接事件的检测。还提供了试...

提供了用于分析物的空间分析的系统和方法。获得一种数据结构，其包含具有标识符、基准标记和一组捕获点的基底上的样品的图像，作为像素值阵列。所述像素值用于标识导出基准点。基底标识符标识具有参考基准点的参考位置和对应的坐标系的模板。使用对齐算法...

本公开在一些方面涉及直接RNA(dRNA)检测方法，所述dRNA检测方法包括使用具有不对称臂的可环化探针(例如，挂锁探针)、连接的可环化探针的滚环扩增和原位检测(例如，使用基于杂交的原位测序)对生物样品中的核酸序列(例如，诸如SNP和点...

本公开在一些方面涉及用于准确地检测和定量存在于生物样品中的多种分析物的方法和组合物。在一些方面，本文提供的方法和组合物解决了与分析物丰度(例如，基因表达水平)的不均匀性和样品的不同位置处反应之间的差异(例如，扩增反应在一个位置处比另一位...

本公开提供了经工程改造的逆转录酶，所述经工程改造的逆转录酶已经被修饰以增强其酶活性，增加其持续合成能力、模板转换效率、结合亲和力和/或转录效率并降低其RNA酶H活性。本公开还提供了包含经工程改造的逆转录酶的组合物和试剂盒，以及使用这些逆...

本公开在一些方面涉及用于制备其中包埋有生物样品的薄聚合物基质(例如，水凝胶基质)的方法，所述聚合物基质用于对一种或多种分析物进行原位分析。

本文提供了用于关联生物颗粒的物理和遗传特性的方法和系统。具体地，本文提供了用于处理来自生物颗粒(例如，细胞)的核酸分子的方法和系统。可产生多个分配区(例如，液滴)，以使多个分配区中的分配区各自包括包含核酸分子的生物颗粒(例如，细胞)和颗...

本申请涉及用于样品处理的组合物和方法。具体地，本申请涉及用于样品处理，尤其是用于测序应用的方法和组合物。用于附接至含有条形码的大量寡核苷酸的珠子的多样性文库的珠子组合物。方法包括制备条形码化珠子的文库的方法以及使珠子与样品组合的方法，例...

本公开提供了生物样品制备和分析方法，这些方法在从生物组织制备解离的固定细胞时使用切碎和固定处理，以便用于批量测定或单细胞/单细胞核测定，诸如基于分区的测定。本公开还提供了测定方法，包括基于分区的方法，这些方法使用从生物组织制备的固定细胞...

本文提供了用于基于微滴的单细胞条形编码的方法和系统。具体地，本文提供了用于样品制备技术的方法和系统，所述样品制备技术允许可能目标单细胞的扩增例如全基因组扩增、逆转录、细胞核酸的扩增等和测序。所述方法和系统通常通过将包含多个生物颗粒的第一...

本文提供了用于制备生物样品的方法、组合物和试剂盒，这些生物样品用于多重空间基因表达和蛋白质组分析，诸如确定生物样品中核酸分析物和蛋白质分析物的位置。

在一些方面，本公开涉及用于准确检测和定量以高水平存在的分析物(如样品中的高表达基因)的方法和组合物。在一些实施方案中，本文公开的探针解析条形码序列不明确对应于任何特定的靶分析物，但可以用于解析由于与靶分析物的不同分子相关联的空间重叠信号...

本申请提供了包含具有至少一种改变的逆转录酶相关活性的经工程改造的融合逆转录酶的组合物。所述经工程改造的融合逆转录酶出乎意料地表现出一种或多种改变的逆转录酶相关活性，诸如但不限于改变的模板转换效率、改变的转录效率或两者。

获得与各自分配有不同探针斑点条形码的多个探针斑点相关联的离散属性值数据集。所述数据集包括空间投影，所述空间投影各自包括生物样品的图像。每个图像包含所述探针斑点的对应多个离散属性值。每个此类值基于所述探针斑点条形码与所述多个探针斑点中的探...

本文提供了用于处理来自样品的生物分子(例如，核酸分子、蛋白质)的系统和方法。用于处理生物分子的方法可以包括使探针分子与核酸分子(例如，核糖核酸(RNA)分子)的靶区域杂交，并为所述探针

本文提供了用于从样品中对单细胞进行药物筛选的系统和方法。一种用于药物筛选的方法可以包括用不同的药物或药物组合处理各种单细胞样品，用包含样品条形码的标记剂标记经处理细胞，并且处理经处理的标记的细胞以产生用于测序的核酸文库。本文所述的方法的...

本文提供了用于测量来自单细胞的分泌型抗体或其他分析物的方法和系统。本文所公开的方法包括使用与分泌型抗体结合的捕获剂和报告剂，以及分区(例如，液滴或孔)中的珠粒，以在单细胞基础上测量分泌型抗体，其中该捕获剂和/或该报告剂可以是分析物特异性...

本发明提供了用于快速设置、调整和控制微流体装置的温度的方法。流体装置的温度的方法。

在一些方面，本公开涉及用于减少信号拥挤、例如光学拥挤的方法，当多重检测样品中的核酸时可能发生所述信号拥挤，这可能使得难以解析单独的信号并且可能导致动态范围减小。在一些方面，本公开涉及在检测样品中的多种靶核酸序列中例如使用杂交探针减少信号...

本文提供了方法和试剂盒，所述方法和试剂盒用于将分析物捕获序列结合至捕获探针的捕获域。获域。