从生物样品中多重捕获基因和蛋白质表达制造技术

技术编号:40176937 阅读:19 留言:0更新日期:2024-01-26 23:44
本文提供了用于制备生物样品的方法、组合物和试剂盒,这些生物样品用于多重空间基因表达和蛋白质组分析,诸如确定生物样品中核酸分析物和蛋白质分析物的位置。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍

1、受试者组织内的细胞由于不同细胞内的分析物水平(例如,基因和/或蛋白质表达)多变而存在细胞形态和/或功能的差异。细胞在组织内的具体位置(例如,细胞相对于相邻细胞的位置,或细胞相对于组织微环境的位置)可能影响例如细胞的形态、分化、命运、活力、增殖、行为,以及与组织中其他细胞的信号传导和交叉对话。

2、空间异质性先前已使用在完整组织或一部分组织的背景下仅提供少量分析物的数据、或者提供离解组织(即,单细胞)的大量分析物数据的技术进行了研究,但未能提供关于单细胞在母体生物样品(例如,组织样品)中的位置的信息。

3、此外,对同一生物样品中的不同分析物(例如,核酸、蛋白质等)进行多重检测,同时保留空间信息,仍然是该领域中的难题。目前的方法包括转录组宽空间检测或各种蛋白质检测方法,然而,仍然需要在生物样品的空间背景内实现这两方面的方法。


技术实现思路

1、对同一生物样品中的不同分析物(例如,核酸、蛋白质等)进行多重检测,同时保留空间信息,仍然是本领域中的难题。如上所述,目前的方法包括转本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于确定来自生物样品的核酸和蛋白质的空间位置的方法,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述多个第一捕获探针的所述捕获结构域是规定的非均聚捕获序列或均聚序列。

3.根据权利要求2所述的方法,其中所述多个第二捕获探针的所述捕获结构域是规定的非均聚序列或均聚捕获序列。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中所述多个第一捕获探针的所述捕获结构域不同于所述多个第二捕获探针的所述捕获结构域。

5.根据权利要求3所述的方法,其中所述均聚序列包括多聚T序列,所述非均聚序列则包括固定序列或简并序列。

6.根据权利要求5所述...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种用于确定来自生物样品的核酸和蛋白质的空间位置的方法,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述多个第一捕获探针的所述捕获结构域是规定的非均聚捕获序列或均聚序列。

3.根据权利要求2所述的方法,其中所述多个第二捕获探针的所述捕获结构域是规定的非均聚序列或均聚捕获序列。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中所述多个第一捕获探针的所述捕获结构域不同于所述多个第二捕获探针的所述捕获结构域。

5.根据权利要求3所述的方法,其中所述均聚序列包括多聚t序列,所述非均聚序列则包括固定序列或简并序列。

6.根据权利要求5所述的方法,其中所述固定序列包括选自seq id no:1至seq id no:11的至少一个序列。

7.根据权利要求1所述的方法,其中所述核酸是rna或dna。

8.根据权利要求7所述的方法,其中所述rna是mrna。

9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法,其中所述生物样品是组织样品。

10.根据权利要求9所述的方法,其中所述组织样品是新鲜冷冻的组织样品或固定的组织样品,其中所述固定的组织样品是福尔马林固定的组织样品、丙酮固定的组织样品、多聚甲醛组织样品,或甲醇固定的组织样品。

11.根据权利要求1至9中任一项所述的方法,其中所述生物样品是组织切片,其中所述组织切片是新鲜冷冻的组织切片或固定切片,并且任选地,其中所述固定组织切片是福尔马林固定石蜡包埋的组织切片、丙酮固定的组织切片、多聚甲醛组织切片,或甲醇固定的组织切片。

12.根据权利要求9所述的方法,其中所述组织样品来源于活检样品或完整的啮齿动物胚胎。

13.根据权利要求1至12中任一项所述的方法,其中在步骤(b)之前,将所述生物样品脱蜡和解交联。

14.根据权利要求13所述的方法,其中所述解交联包括使用缓冲液。

15.根据权利要求14所述的方法,其中所述缓冲液包括ph为约8至约10并且温度为约60℃至约80℃的tris-edta缓冲液。

16.根据权利要求14所述的方法,其中所述缓冲液包括ph为约5至约7并且温度为约70℃至约100℃的柠檬酸盐缓冲液。

17.根据权利要求1所述的方法,其中所述将所述模板化连接产物与所结合的分析物捕获剂的所述分析物捕获序列杂交包括透化所述生物样品。

18.根据权利要求1所述的方法,其中所述寡核苷酸的所述分析物捕获序列在与所述目标蛋白质结合之前被封闭。

19.根据权利要求18所述的方法,其中所述分析物捕获剂的所述寡核苷酸被封闭探针封闭。

20.根据权利要求19所述的方法,其中在将所述分析物捕获序列的所述寡核苷酸的所述分析物捕获序列与所述捕获探...

【专利技术属性】
技术研发人员:J·陈J·F·舒加P·罗埃利D·张A·爱马仕尹沂峰N·阿纳帕西R·哈托里M·斯托基厄斯R·斯帕林斯卡斯AM·卡索里C·尤廷科M·图尔库尔D·苏科维奇C·加隆斯卡A·尤雷克O·M·布洛朱
申请(专利权)人:一零x基因组学有限公司
类型:发明
国别省市:

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