【技术实现步骤摘要】
一种食道癌易感基因位点高效分子分型的检测试剂盒
本专利技术属于基因检测
,具体为一种食管癌易感基因位点高效分子分型的检测试剂盒。
技术介绍
食管癌是世界第八大最常见的肿瘤,分布呈现明显的区域性;中国有六大食管癌高发区,其中河南林州市和潮汕南澳岛发病率最高,严重危害当地人群的生命健康安全,如何筛查易感个体进行早期预防干预已成为当地亟待解决的社会公共卫生问题。随着高通量SNP检测芯片的飞速发展,食管癌大规模关联研究近年大量涌现,报道了一批散发食管癌易感基因和位点;本课题组致力于家族性食管癌易感基因定位研究十余年,已发现多个家族性食管癌易感基因位点;为家族性和散发性食管癌易感个体筛查奠定了坚实的基础。SequenomMassArray系统是一个高性能的DNA分析平台,具有通量、准确性、灵敏度、可重复性和成本效益的综合优势,特别适用于检测几十个DNA位点的人群筛查项目。
技术实现思路
基于18个食管癌易感基因上的18个位点可用来评估个体对食管癌易感性的基础上,本专利技术提供一种食管癌易感基因位点高效分子分型的检测试剂盒。一种食管癌易感基因位点高效分子分型的检测试剂盒,包括:PCR扩增引物;PCR延伸引物;PCR混合缓冲液(PCRBufferMix);PCR酶(PCREnzyme);SAP酶(SAPEnzyme);延伸酶(ExtendEnzyme);延伸混合缓冲液(ExtendBufferMix);其特征在于:所述的PCR扩增引物和PCR延伸引物针对18个食管癌易感基因位点而设计,基于SequenomMassArray系统,能对这18个位点高效精确分型。具体如表1 ...
【技术保护点】
一种食管癌易感基因位点高效分子分型的检测试剂盒,包括:PCR扩增引物;PCR延伸引物;PCR混合缓冲液(PCR Buffer Mix);PCR酶(PCR Enzyme);SAP酶(SAP Enzyme);延伸酶(Extend Enzyme);延伸混合缓冲液(Extend Buffer Mix);其特征在于:所述的PCR扩增引物和PCR延伸引物针对18个食管癌易感基因位点而设计,基于Sequenom MassArray系统,能对这18个位点高效精确分型,具体如表1所示:表1食管癌易感基因Sequenom质谱飞行平台分子分型PCR引物和延伸引物 。
【技术特征摘要】
1.一种食管癌易感基因位点高效分子分型的检测试剂盒,包括:PCR扩增引物;PCR延伸引物;PCR混合缓冲液(PCRBufferMix);PCR酶(PCREnzyme);SAP酶(SAPEnzyme);延伸酶(ExtendEnzyme);延伸混合缓冲液(ExtendBufferMix);所述的PCR扩增引物和PCR延伸引物针对13个食管癌易感基因位点而设计,基于SequenomMassArray系统,能对这13个位点高效精确分型,包括以下10个位点及其PCR扩增引物和PCR延伸引物如下所示:SNP_IDRiskAllele2nd-PCRP1st-PCRPUEP_SEQADH1B_rs1042026AACGTTGGATGGGGCATTTTATTTGAGTTCCACGTTGGATGGGGTAAGGTAAAGGATAGACAATTTCCTGTATTTAGAACTCTALDH2_rs671GACGTTGGATGTTGGTGGCTACAAGATGTCGACGTTGGATGAGGTCCCACACTCACAGTTTCTGCAGGCATACACTATP1B2_rs1642764CACGTTGGATGATCCAGACCAAGCTAAGCCGACGTTGGATGTGAACTCCTGGAATTAAGCgCTAGGGAGGTTGAGGCC12orf51_rs2074356TACGTTGGATGCACAGCTGGTAAACAGTATGACGTTGGATGAGCTGGAGTGGTTATACTGGgtGTAAACAGTATGACTTCAGATCYP1A1_rs1048943A2455GIle462ValGACGTTGGATGTGGGCAAGCGGAAGTGTATCACGTTGGATGCTGAATTCCACCCGTTGCAGtcGTGTATCGGTGAGACCCYP2E1_rs2031920Rsa1C-1053TCACGTTGGATGGTTCTTAATTCATAGGTTGCACGTTGGATGTCATTTCTCATCATATTTTCTCTTAATTCATAGGTTGCAATTTTFAT4_rs1014867Pro4972SerCACGTTGGATGAA...
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