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一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型及构建方法技术

技术编号:8626283 阅读:288 留言:0更新日期:2013-04-25 23:31
本发明专利技术公开了一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型及构建方法,通过比较活动性肺结核组与健康对照组、肺炎组、肺癌组、COPD组的蛋白质组学差异,获得活动性肺结核的蛋白表达差异质谱。此外,本发明专利技术还涉及活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型构建的新方法,利用相对和绝对定量的同位素ITRAQ标记及串联质谱技术,能有效地对血清里的蛋白进行鉴定和相对定量,采用该技术能获得活动性肺结核病人血清中的蛋白表达差异质谱。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于蛋白质组学
技,尤其涉及一种蛋白质组学
,尤其涉及。
技术介绍
血清蛋白参与机体免疫、凝血、物质交换、运输、代谢、生长信号调节等多种重要的生理功能,尤其是低丰度蛋白质的组成和数量变化往往受一些病理状态的影响。血清蛋白质组学通过比较某种疾病血清中表达的全部蛋白质,寻找和鉴定有显著差异的蛋白,进一步研究其结构和功能,为研究疾病致病机理、生物标记物、药物作用靶点开辟新的途径。相对和绝对定量同位素标记(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术可同时对八个样本中的所有蛋白质进行精确鉴定、定量和比较。该试剂已被广泛应用于生命科学的许多领域,包括生物标志物的发现、信号转导及翻译后修饰研究、基因与蛋白质表达相关分析、细胞膜与亚细胞结构分析和药物靶点分析等。
技术实现思路
本专利技术可以提供一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型和一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型的构建方法,为应用蛋白表达差异质谱技术,寻找血清生物标志物提供新的途径。本专利技术实施例是这样实现的,一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型包括肺结核与健康对照组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白I3DLI1、C4BPA、⑶14、SAA、IGHD, IGHM、SHBG, PPIA、PZP、MASP2、PEPD, ZYX、VffF, FLNA, TAGL2、FCN2、CD5L、F13A、FHR5、HBD、IBP2、HBB、GPV1、HYOUl、TTHY、HBA、LDHB、TLNl、NPC2、TENA、HABP2、TRMLl、CAH2、ITBl、C4BPB、HPT、FCGBP, PROFl、FIBB、4F2、ITIH3、SODE, FETUB_HUMAN、CALR、TIMPl 和下调蛋白PLF4、RET4、AP0M、LYSC、IL1AP、IBP5、FINC、AP0D、ANGT、ALBU、C1R、AP0C1、HGFA、N0E1、SAMP、MME、CHLE、CPN2、TRY1、CBG、LUM、IBPl、PEDF、BTD、TETN、KLKBl、ATRN、K1C10、LYVEl、PONl、TRFE, LMAN2、NGAL, LCAT, IPSP, APOF, NRPl、GPV, K2C1、P0N3、AP0A1、PHLD、ICAM2、FAl1、ANAG, C04B、GPX3、K1C9、TRFL, AFAM、C0L11、SAA4、AP0C2、CNDPl、AP0C4 构成。肺结核与肺炎组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白SAMP、CBPB2、IC1、HEP2、FLNA、AFAM、ZA2G、ANT3、KNGl、PLSL、THBG、C05、A2AP、LUM、MASPl、LBP、HABP2、GPX3、HYOUl、PROC、CHLE、APOH、C07、FKBIA、ATRN、TAGL2、CFA1、PROF1、RET4、CIQB、KLKB1、BTD、NEO1、PPIA、GPV、CBG, C1R、PROZ, SHBG, ANGT、PDIAl、F13B、ZP1、QS0X1、TLNl、C08B、HRG, KAIN、LYSC, C02、GP1BA、TETN、CPN2、CYTC, C06A3、MBL2、PEDF、NGAL, VffF, HGFL, APOCl、TRMLl、PRG4、FETUB,CAHl、CRIS3、C1RL、AMPN、PEPD, C08G、CD14、HGFA, FCG3B、1433Z、BGH3、FCGBP、4F2、D0P0,CALR、ZYX、CRACl、S0DE、PTCDS、FA10、FHRl、C1QA、PDLI1、IGF2、PLTP、EGLN、BSTl、NOEl 和下调蛋白 IGHAl、HPT、IGHG3、LAC2、IGKC、SAA、ALBU、IGHM、HBA、HBB、HPTR、PLF4、HBD、C4BPA、SAA4、CRP, TTHY, IGJ, CATA、PHLD、SLP1、LG3BP、PVR、FINC、IGLL5、APOM、FIBA、TENA、AP0L1、LCAT、KlClO、APOF、IBPl、PRDX2、ANAG、MAlAl、SEPPl、PODXL、SRCRL、PONl、CLUS、GGH、CXCL7构成。肺结核与肺癌组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白TAGL2、FLNA, TRMLU ALBU,PROFU SHBG, ZYX、PDLIU FETUB, CYTC, KNGl、SAA、TLNl、GPV1、CXCL7、C06A3、CRIS3、DOPO,SODE, NGAL, PPIA、PROZ, LYAMl、GP1BA、F13A、TENX, F13B、TTHY, BTD、NPC2、NCAMl、CALR、CFAD, HYOUl、CHLl、C07、CD14 和下调蛋白 HPT、HPTR、HBB、HBA、C4BPA、IGHG3、LAC2、PLF4、HBD、CADH5、FINC、LG3BP、AP0C2、IGHM、TRFL, SAA4、C4BPB、LBP、SLP1、PHLD, ITIH3、K2C1、A1AG2、CRP、AlAGl、ANGT、C06、APOLl、PROS、MAlAl、IGHAl、ATRN、FCN2、COIAl、C1R、CATD,PCSK9、C0L11、LCAT、C08B、FA5、APMAP、FIBB、SAMP、APOD、PLTP, HEP2、APOCl、K1C10、HGFL,SEPP1、C08A、CD5L_、CPN2、LMAN2、CFA1、ICAMU TRYl 构成。肺结核与COPD组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白ALBU、TAGL2、⑶14、FLNA,FETUB、PROF1、TENX、SODE、COMP、ZYX、TRML1、FAIO、PD IA1、KNG1、CRIS 3、TLNl、PROP、GPV1、PDLI1、PPIA、FKB1A, CBG, GPlBA、CRACl、FHRl、F13A、NPC2、ΙΒΡ5、VASN、1433Ζ、C04B、EGLN、PRG4、GGH、CFAD、CALR 和下调蛋白 HPT、IGHM、IGHG3、LAC2、HBB、HPTR、HBA、PLF4、C4BPA、HBD、IGKC、FINC、IGHAl、SAA、IGLL5、LBP、CRP、C4BPB、SAA4、ADIPO、AP0C2、A1AG2、TRFL, FIBB、ITIH3、PHLD、COLl1、CADH5、APOCl、APOD、C06、IGJ、C1R、ICAM2、AlAGl、CATA、ATRN、ANGT,FIBA、AP0C3、CLUS、LG3BP、PZP、PONU ALDOB, APOL1、SEPP1、C07、APOF、C08B、IGHD、PRDX2、C08A、LYVEl、CFA1、ENPL、GPNMB, CAH2、TENA、FA5、PROS、ICU MIME, ILlAP, FCGBP, K1C10、MRC1、CPN2、C05、GPX3、APMAP、CAHU VffF, AFAM、CATD, FBLN3 构成。蛋白表达差异质谱由相对和绝对定量的同位素标记血清全蛋白,经串联质谱分析检测蛋白质谱,再通过本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型,其特征在于,该活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型包括:肺结核与健康对照组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白PDLI1、C4BPA、CD14、SAA、IGHD、IGHM、SHBG、PPIA、PZP、MASP2、PEPD、ZYX、VWF、FLNA、TAGL2、FCN2、CD5L、F13A、FHR5、HBD、IBP2、HBB、GPVI、HYOU1、TTHY、HBA、LDHB、TLN1、NPC2、TENA、HABP2、TRML1、CAH2、ITB1、C4BPB、HPT、FCGBP、PROF1、FIBB、4F2、ITIH3、SODE、FETUB_HUMAN、CALR、TIMP1和下调蛋白PLF4、RET4、APOM、LYSC、IL1AP、IBP5、FINC、APOD、ANGT、ALBU、C1R、APOC1、HGFA、NOE1、SAMP、MIME、CHLE、CPN2、TRY1、CBG、LUM、IBP1、PEDF、BTD、TETN、KLKB1、ATRN、K1C10、LYVE1、PON1、TRFE、LMAN2、NGAL、LCAT、I?PSP、APOF、NRP1、GPV、K2C1、PON?3、APOA1、PHLD、ICAM2、FA11、ANAG、CO4B、GPX3、K1C9、TRFL、AFAM、COL11、SAA4、APOC2、CNDP1、APOC4构成;肺结核与肺炎组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白SAMP、CBPB2、IC1、HEP2、FLNA、AFAM、ZA2G、ANT3、KNG1、PLSL、THBG、CO5、A2AP、LUM、MASP1、LBP、HABP2、GPX3、HYOU1、PROC、CHLE、APOH、CO7、FKB1A、ATRN、TAGL2、CFAI、PROF1、RET4、C1QB、KLKB1、BTD、NEO1、PPIA、GPV、CBG、C1R、PROZ、SHBG、ANGT、PDIA1、F13B、ZPI、QSOX1、TLN1、CO8B、HRG、KAIN、LYSC、CO2、GP1BA、TETN、CPN2、CYTC、CO6A3、MBL2、PEDF、NGAL、VWF、HGFL、APOC1、TRML1、PRG4、FETUB、CAH1、CRIS3、C1RL、AMPN、PEPD、CO8G、CD14、HGFA、FCG3B、1433Z、BGH3、FCGBP、4F2、DOPO、CALR、ZYX、CRAC1、SODE、PTGDS、FA10、FHR1、C1QA、PDLI?1、IGF2、PLTP、EGLN、BST1、NOE1和下调蛋白IGHA1、HPT、IGHG3、LAC2、IGKC、SAA、ALBU、IGHM、HBA、HBB、HPTR、PLF4、HBD、C4BPA、SAA4、CRP、TTHY、IGJ、CATA、PHLD、SLPI、LG3BP、PVR、FINC、IGLL5、APOM、FIBA、TENA、APOL1、LCAT、K1C10、APOF、IBP1、PRDX2、ANAG、MA1A1、SEPP1、PODXL、SRCRL、PON1、CLUS、GGH、CXCL7构成;肺结核与肺癌组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白TAGL2、FLNA、TRML1、ALBU、PROF1、SHBG、ZYX、PDLI?1、FETUB、CYTC、KNG1、SAA、TLN1、GPVI、CXCL7、CO6A3、CRIS3、DOPO、SODE、NGAL、PPIA、PROZ、LYAM1、GP1BA、F13A、TENX、F13B、TTHY、BTD、NPC2、NCAM1、CALR、CFAD、HYOU1、CHL1、CO7、CD14和下调蛋白HPT、HPTR、HBB、HBA、C4BPA、IGHG3、LAC2、PLF4、HBD、CADH5、FINC、LG3BP、APOC2、IGHM、TRFL、SAA4、C4BPB、LBP、SLPI、PHLD、ITIH3、K2C1、A1AG2、CRP、A1AG1、ANGT、CO6、APOL1、PROS、MA1A1、IGHA1、ATRN、FCN2、COIA1、C1R、CATD、PCSK9、COL11、LCAT、CO8B、FA5、APMAP、FIBB、SAMP、APOD、PLTP、HEP2、APOC1、K1C10、HGFL、SEPP1、CO8A、CD5L_、CPN2、LMAN2、CFAI、I?CAM1、TRY1构成;肺结核与COPD组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白ALBU、TAGL2、CD14、FLNA、FETUB、PROF1、TENX、SOD...

【技术特征摘要】
1.一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型,其特征在于,该活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型包括 肺结核与健康对照组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白PDLI1、C4BPA、⑶14、SAA、IGHD、IGHM、SHBG, PPIA、PZP、MASP2、PEPD, ZYX、VffF, FLNA, TAGL2、FCN2、CD5L、F13A、FHR5、HBD、IBP2、HBB、GPV1、HYOU1、TTHY、HBA、LDHB、TLN1、NPC2、TENA、HABP2、TRML1、CAH2、ITB1、C4BPB、HPT、FCGBP, PROFl、FIBB、4F2、ITIH3、SODE, FETUB_HUMAN、CALR、TIMPl 和下调蛋白 PLF4、RET4、AP0M、LYSC、IL1AP、IBP5、FINC、AP0D、ANGT、ALBU、C1R、AP0C1、HGFA、N0E1、SAMP、MME、CHLE、CPN2、TRYU CBG, LUM、IBP1、PEDF、BTD、TETN、KLKBl、ATRN、K1C10、LYVEl、PONl、TRi7E、LMAN2、NGAL、LCAT、I PSP、APOF、NRP1、GPV、K2C1、PON 3、APOA1、PHLD、ICAM2、FA11、ANAG、C04B、GPX3、K1C9、TRFL, AFAM、C0L11、SAA4、AP0C2、CNDPl、AP0C4 构成; 肺结核与肺炎组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白SAMP、CBPB2、IC1、HEP2、FLNA、AFAM、ZA2G、ANT3、KNG1、PLSL、THBG、⑶5、A2AP、LUM、MASP1、LBP、HABP2、GPX3、HYOU1、PROC、CHLE、APOH、C07、FKBIA、ATRN、TAGL2、CFA1、PROF1、RET4、CIQB、KLKB1、BTD、ΝΕΟ1、PPIA、GPV、CBG、C1R、PROZ, SHBG, ANGT、PDIAl、F13B、ZP1、QSOXl、TLNl、C08B、HRG, ΚΑΙΝ、LYSC, C02、GPlBA、TETN、CPN2、CYTC, C06A3、MBL2、PEDF, NGAL, VffF, HGFL, APOCl、TRMLl、PRG4、FETUB, CAHl、CRIS3、C1RL、AMPN、PEPD, C08G、CD14、HGFA, FCG3B、1433Z、BGH3、FCGBP、4F2、DOPO, CALR、ZYX、CRACl、SODE、PTCDS、FAlO、FHRl、C1QA、PDLI1、IGF2、PLTP、EGLN、BSTl、ΝΟΕΙ 和下调蛋白 IGHAl、HPT、IGHG3、LAC2、IGKC、SAA, ALBU, IGHM、HBA, HBB、HPTR、PLF4、HBD、C4BPA、SAA4、CRP, TTHY, IGJ, CATA、PHLD、SLP1、LG3BP、PVR、FINC、IGLL5、APOM、FIBA、TENA, AP0L1、LCAT,K1C10、AP0F、IBPl、PRDX2、ANAG, MAlAl、SEPPl、PODXL, SRCRL, PONl、CLUS、GGH、CXCL7 构成;肺结核与肺癌组的蛋白表达差异质谱,由上调蛋白TAGL2、FLNA, TRMLl、ALBU, PR0F1、SHBG, ZYX、PDLI K FETUB, CYTC, KNGl、SAA、TLNl、GPV1、CXCL7、C06A3、CRIS3、D0P0, SODE,NGAL, PPIA、PROZ, LYAMl、GP1BA、F13A、TENX, F13B、TTHY, BTD、NPC2、NCAMl、CALR、CFAD,HY0U1、CHLl、C07、CD14 和下调蛋白 HPT、HPTR、HBB、HBA、C4BPA、IGHG3、LAC2、PLF4、HBD、CADH5、FINC、LG3BP、AP0C2、IGHM、TRFL, SAA4、C4BPB、LBP、SLPI, PHLD, ITIH3、K2C1、A1AG2、CRP、AlAGl、ANGT、C06、AP0L1、PROS、MAlAl、IGHAU ATRN, FCN2、C0IA1、C1R、CATD, PCSK9、C0L1U LCAT、C08B、FA5、APMAP、FIBB、SAMP、APOD、PLTP、HE...

【专利技术属性】
技术研发人员:李继承徐丹丹
申请(专利权)人:浙江大学
类型:发明
国别省市:

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