一种芹菜EST-SSR指纹图谱构建方法及其应用技术

技术编号:7834833 阅读:311 留言:0更新日期:2012-10-11 20:25
本发明专利技术公开了一种芹菜EST-SSR指纹图谱构建方法以及指纹图谱的应用。该方法以芹菜育种材料的基因组DNA模板为研究对象,通过查询GenBank数据库上公布的芹菜EST序列,利用BatchPrimer3v1.0在线引物设计软件,设计EST-SSR引物。经过PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选出多态性较强的EST-SSR位点,并使用GeneTools(Sygene)软件进行条带分子量分析,构建EST-SSR指纹图谱。利用EST-SSR指纹图谱可用于芹菜品种亲缘关系、品种鉴定等分析。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于农业的蔬菜分子辅助育种与应用
,具体涉及芹菜EST-SSR指纹图谱的构建方法及其应用,是一种基于EST-SSR分子标记技术的分析。
技术介绍
芹菜,属伞形科植物。有水芹、旱芹两种,功能相近,药用以旱芹为佳。旱芹香气较浓,又名“香芹,亦称药芹。芹菜含有丰富蛋白质、胡萝卜素、碳水化合物、脂肪、B族维生素、维生素C、糖类、氨基酸及矿物质和膳食纤,其中磷和钙的含量较高。芹菜是高纤维食物,它经肠内消化作用产生一种木质素或肠内脂的物质,这类物质是一种抗氧化剂,常吃芹菜,尤其是吃芹菜叶,对预防高血压、动脉硬化等都十分有益,并有辅助治疗作用。芹菜是一年或两年生草本植物,株高约50 80厘米。茎一般都在手指粗细,中间 为空。根呈须状。叶为羽状复叶卵形。花白色。芹菜每年六月开始播种,一星期左右就可出苗,经过六十天左右生长,就可以食用。芹菜的开花期为七月至十一月,花朵细小呈白色,里面可找到种子。芹菜耐寒不喜高温,最佳温度在15到20摄氏度之间为佳。芹菜品种间形态特征差异极小,从植物学上较难区分,且易受到环境和人为因素影响;再加上芹菜为二年生蔬菜,生长期长,进行芹菜优良性状早期鉴定和遗本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种芹菜EST-SSR指纹图谱的构建方法,其特征在于包括候选EST-SSR位点搜寻、验证、EST-SSR位点分析及指纹图谱构建步骤 (1)候选EST-SSR位点搜寻以芹菜英文名或拉丁文名或别称为关键词查询GenBank数据库公布的芹菜EST序列,利用BatchPrimer3 vl. O在线软件扫描分析EST序列中候选EST-SSR位点信息,并设计每个候选EST-SSR位点PCR扩增引物,包括上游引物和下游引物; (2)候选EST-SSR位点验证以芹菜基因组DNA为模板,每个位点经过PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳,筛选出多态性较强的EST-SSR位点; 其中的PCR扩增反应的总体积为10 UL,扩增反应体系为2XGoTaq Master Mixes 5uL,10u mol/L上游和下游引物各0. 25 ii L ;50 ng/ u L的芹菜基因组DNA模板I y L,双蒸水补足10 U L ;PCR反应程序为95°C预变性5 min,35个扩增循环(94°C 30 sec, 50°C 30sec, 72°C 30 sec) ;72°C延伸 7 min,4°C保存; 其中的聚丙烯酰胺凝胶电泳条件为浓度为8%,凝胶组分为...

【专利技术属性】
技术研发人员:兰青阔王永赵新陈锐朱珠李欧静徐石勇郭永泽
申请(专利权)人:天津市农业质量标准与检测技术研究所
类型:发明
国别省市:

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