筛查马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒的芯片及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种筛查马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒的芯片及其应用。本发明专利技术提供的鉴定或辅助鉴定马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒的探针组，由19条探针组成，所述19条探针的核苷酸序列依次分别为序列表中的序列1-19。还提供了筛查马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒的基因芯片，为将上述的探针组固定在片基表面得到的基因芯片。本发明专利技术的实验证明，本发明专利技术采用生物信息学方法对马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒类病毒的核苷酸序列进行分析，设计了该属的兼容性探针，标准类病毒样品验证结果证明探针效果良好。本发明专利技术的筛查马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒的芯片可用于马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒的检疫鉴定。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物信息学及生物检疫鉴定
，尤其涉及筛查马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒的芯片及其应用。
技术介绍
马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒(Pospiviroid)属于马铃薯纺锤形块茎类病毒科(Pospiviroidae),根据国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomyof Viruses, ICTV)第八次分类报告,该属包括马铃薯纺锤形块莖类病毒(Potato spindle tuber viroid, PSTVd)、菊花矮化类病毒(Chrysanthemum stunt viroid, CSVd)、柑橘裂皮类病毒(Citrus exocortis viroid, CEVd)、金鱼花潜隐类病毒(Columnea latent viroid,CLVd)、血觅类病毒 I (Iresine viroid 1，IrVd-1)、墨西哥心叶爺类病毒(Mexican papitaviroid,MPVd-1)、番爺顶缩类病毒(Tomato apical stunt viroid,TASVd)及番爺雄性株类病毒(Tomato planta 本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种鉴定或辅助鉴定马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒的探针组，由探针I-探针19共19条探针组成，所述探针I-探针19的核苷酸序列依次分别为序列表中的序列1-19。2.根据权利要求I所述的探针组，其特征在于所述马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒为马铃薯纺锤形块茎类病毒、菊花矮化类病毒、柑橘裂皮类病毒、金鱼花潜隐类病毒、血觅类病毒I、墨西哥心叶爺类病毒、番爺顶缩类病毒或番爺雄性株类病毒。3.—种筛查马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒的基因芯片，为将权利要求I或2所述的探针组固定在片基表面得到的基因芯片。4.根据权利要求3所述的基因芯片，其特征在于所述片基为醛基化玻璃片基；所述马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒为马铃薯纺锤形块茎类病毒、菊花矮化类病毒、柑橘裂皮类病毒、金鱼花潜隐类病毒、血苋类病毒I、墨西哥心叶茄类病毒、番茄顶缩类病毒或番茄雄性株类病毒。5.一种筛查马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒的试剂盒，包括权利要求3或4所述的基因芯片。6.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于所述试剂盒还包括用于扩增所述马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒的cDNA的引物对，所述引物对具体为引物对I或引物对2 ; 所述引物对I由序列表中序列20和序列表中序列21所示的DNA分子组成； 所述引物对2由序列表中序列22和序列表中序列23所示的DNA分子组成； 所述马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒为菊花矮化类病毒或番茄雄性株类病毒。7.权利要求I或2所述探针组、权利要求3或4所述的基因芯片、权利要求5或6所述的试剂盒在如下I)-4)中的应用 1)鉴定或辅助鉴定马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒； 2)制备鉴定或辅助鉴定马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒产品； 3)鉴定或辅助鉴定待测植物感染马铃薯纺锤形块茎类病毒属类病毒...

【专利技术属性】
技术研发人员：张永江，朱水芳，丁芳，王国平，李世访，辛言言，刘洪义，粟智平，
申请(专利权)人：中国检验检疫科学研究院，
类型：发明
国别省市：