肠疾病中的新的治疗靶标制造技术

本发明专利技术涉及用于检测、诊断和治疗肠疾病（ＢＤ）的新的序列。本发明专利技术提供其表达与ＢＤ有关的ＢＤ相关多核苷酸序列。本文提供用于检测ＢＤ的诊断组合物和方法。本发明专利技术提供对ＢＤ多肽有特异性的单克隆和多克隆抗体。本发明专利技术还提供用于筛选、预防和治疗ＢＤ的诊断工具和治疗组合物及方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】相关申请本申请要求2008年10月17日申请的美国临时申请60/999,234的权益。上述申请的全部内容都通过引用结合到本文中。专利技术背景2004年，FDA批准将(利福昔明(Rifaximin)，RIFax)用于治疗旅行者腹泻(Laustsen and Wimmett，2005)。研究表明，RIFax是对抑制细菌RNA合成起作用的通用抗生素。并不完全了解促成RIFax在慢性胃肠疾病中起有益作用的机制。因此，在本领域中存在对提供涉及肠疾病(BD)，特别是肠易激综合征(IBS)的多核苷酸和多肽序列的需求。在本领域中还存在对提供与各种BD有关的抗原(BD相关多肽)作为诊断和/或治疗化合物和组合物的靶标的需求，包括对提供抗体的需求。这些抗原还可用于药物开发(例如小分子)，以及用于细胞调节、生长和分化的进一步表征。还存在对鉴定和表征可以用作药剂或药物靶标，或者可以在预防、改善或纠正功能障碍或疾病中起作用的基因和相关蛋白质的需求。专利技术概述一方面，本文提供筛选调节孕烷X受体(PXR)蛋白或其片段的化合物或其盐的方法，所述方法包括使PXR受体与一种或多种候选化合物接触。在一个实施方案中，候选化合物包含利福霉素类似物。在一个相关实施方案中，利福霉素类似物包含利福昔明。在一个实施方案中，调节包括调节由PXR蛋白或其片段与利福霉素类似物的结合所诱导的信号转导。在一个实施方案中，PXR受体与膜缔合、在转基因小鼠中、在测定板中、在细胞中和/或在人工膜中。在一个实施方案中，PXR蛋白包含由序列登录号O75469、Q8SQ01、Q9R1A7、O54915、NP_148934、NP 003880或NP 071285所表示的氨基酸序列或其片段或变体或者由序列登录号NM 033013、NM 009803、NM 022002、NM 003889、CS618137、CS618135、CS618133所表示的核酸或其片段或变体。在另一个实施方案中，CYP3A11、GSTA1、MRP2和OATP2上调。在一个实施方案中，所述方法还可包括用利福昔明、利福霉素类似物或候选化合物的一种或多种预治疗。在一个实施方案中，用候选化合物预治疗不会影响CYP3A底物咪达唑仑的药代动力学特征。在另一个实施方案中，用候选化合物预治疗提高1′-羟基咪达唑仑的Cmax并降低1′-羟基咪达唑仑的Tmax。在一个实施方案中，在用候选化合物治疗后与对照相比，CYP3A11增加约1倍～约4倍。在另一个实施方案中，GSTA1mRNA在候选化合物治疗后上调。-->在另一个实施方案中，上调范围介于约65％～约200％之间。在一个实施方案中，肠MRP2mRNA在候选化合物治疗之后上调。一方面，本文提供用于筛选(I)调节PXR受体或其片段的化合物或其盐的试剂盒，所述试剂盒包括PXR受体蛋白或其活性片段和利福霉素类似物。一方面，本文提供用于治疗PXR相关疾病的药物，所述药物包含调节孕烷X受体(PXR)蛋白或其片段的化合物或其盐，或者调节由PXR蛋白或其片段与利福霉素类似物的结合所诱导的信号转导的化合物或其盐。一方面，本文提供治疗、预防或减轻受治疗者的PXR相关疾病的方法，所述方法包括给予调节孕烷X受体(PXR)蛋白或其片段的化合物或其盐。在一个实施方案中，调节孕烷X受体(PXR)蛋白或其片段的化合物或其盐不是利福昔明。在一个实施方案中，调节包括调节由PXR蛋白或其片段与利福霉素类似物的结合所诱导的信号转导。在另一个实施方案中，PXR受体与膜缔合、在转基因小鼠中、在测定板中、在细胞中和/或在人工膜中。在一个实施方案中，PXR蛋白包含由序列登录号O75469、Q8SQ01、Q9R1A7、O54915、NP_148934、NP_003880或NP_071285表示的氨基酸序列或其片段或变体或者由序列登录号NM_033013、NM_009803、NM_022002、NM_003889、CS618137、CS618135、CS618133表示的核酸或其片段或变体。一方面，本文提供包含有效量的产生治疗效果的PXR蛋白激动剂组合物。一方面，本文提供包含纯合破坏(homozygous disruption)的内源孕烷X受体(PXR)基因的转基因小鼠。在另一个实施方案中，小鼠包含人PXR基因。一方面，本文提供从本文所述转基因小鼠中分离的细胞或组织。一方面，本文提供鉴定能够调节PXR基因的活性或PXR基因表达产物的活性的调节剂的方法，所述方法包括给予本文所述的转基因小鼠推定的调节剂；给予野生型对照小鼠所述调节剂；将转基因小鼠的生理反应与对照小鼠的生理反应进行比较；其中在转基因小鼠与对照小鼠之间生理反应上的差异表示所述调节剂能够调节基因或基因表达产物的活性。一方面，本文提供筛选具有抗炎性肠病活性的候选药物的方法，所述方法包括提供表达PXR基因或其片段或变体的细胞，所述PXR基因由选自以下序列的核酸序列编码：NM_033013、NM_009803、NM_022002、NM_003889、CS618137、CS618135、CS618133或O75469、Q8SQ01、Q9R1A7、O54915、NP_148934、NP_003880、NP_071285；使细胞与候选药物接触；以及监测组织样品中候选药物对BD多核苷酸表达的作用。一方面，本文提供与PXR多肽结合的分离抗体或其抗原结合片段。在一个实施方案中，抗体或其片段与固相支持体连接；其中抗体是单克隆抗体；其中抗体是多克隆抗体；和/或其中抗体或其片段另包含可检测标记。本专利技术部分是基于这样的发现，即BD易感性与核受体家族的成员PXR基因的遗传变异强相关。PXR是一种调节参与异生素(xenobiotic)和限制抗生素沉积(deposition)-->及解毒的基因的核受体。本专利技术还部分基于人PXR的RIFax特异性活化。PXR是构成参与内源性解毒和异生素解毒的机体防御机制的固有组分(Kliewer等，2002)。PXR被包括处方药、草药补充剂、农药、内分泌破坏物和其它环境污染物在内的广谱异生素激活(Carnahan和Redinbo，2005)。PXR活化调节参与异生素(包括毒性化学物质)代谢和分泌的多种基因(Kliewer，2003；Rosenfeld等，2003；Sonoda等，2005)。本文还公开了一种新的动物模型PXR人源化小鼠(hPXR)，其中将完整人PXR基因重新导入Pxr失效背景中(Ma等，2007)。本专利技术提供用于筛选调节炎性肠病的组合物的方法。本专利技术还提供用于筛选调节炎性肠病的组合物的方法。本文还提供抑制肠及相关组织和器官的炎症的方法。本文还提供治疗炎性肠病的方法。本公开内容总的来讲涉及转基因动物，以及与基因功能的表征有关的组合物和方法。一方面，筛选候选药物的方法包括提供表达炎性肠病相关(BD)基因或其片段的细胞系。BD基因的某些实施方案是在BD中进行差异性表达的基因。用于本文方法的BD基因的某些实施方案包括但不限于选自NCBI登录号NM_033013、NM_009803、NM_022002、NM_003889、CS618137、CS618135、CS618133的核酸或其相当于由其产生的人mRNA的片段。所述方法另包括将候选药本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种筛选调节孕烷Ｘ受体（ＰＸＲ）蛋白或其片段的化合物或其盐的方法，所述方法包括使ＰＸＲ受体与一种或多种候选化合物接触，并选出调节ＰＸＲ受体的化合物或其盐。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】US 2007-10-17 60/9992341.一种筛选调节孕烷X受体(PXR)蛋白或其片段的化合物或其盐的方法，所述方法包括使PXR受体与一种或多种候选化合物接触，并选出调节PXR受体的化合物或其盐。2.权利要求1的方法，其中所述候选化合物包含利福霉素类似物。3.权利要求1的方法，其中调节包括调节由PXR蛋白或其片段与利福霉素类似物的结合所诱导的信号转导。4.权利要求1的方法，其中所述PXR受体与膜缔合、在转基因小鼠中、在测定板中、在细胞中和/或在人工膜中。5.权利要求1的方法，其中所述PXR蛋白包含由序列登录号O75469、Q8SQ01、Q9R1A7、O54915、NP_148934、NP_003880或NP_071285所表示的氨基酸序列或其片段或变体或者由序列登录号NM_033013、NM_009803、NM_022002、NM_003889、CS618137、CS618135、CS618133所表示的核酸或其片段或变体。6.权利要求1的方法，其中CYP3A11、GSTA1、MRP2和OATP2全都上调。7.权利要求1的方法，所述方法另外包括用利福昔明预治疗。8.权利要求1的方法，所述方法另外包括用PXR受体蛋白与候选化合物预治疗。9.权利要求8的方法，其中用候选化合物预治疗不会影响CYP3A底物咪达唑仑的药代动力学。10.权利要求8的方法，其中用候选化合物预治疗提高1′-羟基咪达唑仑的Cmax并降低1′-羟基咪达唑仑的Tmax。11.权利要求1的方法，其中在用候选化合物治疗后与对照相比，CYP3A11增加约1～约4倍。12.权利要求1的方法，在候选化合物治疗后，GSTA1mRNA上调。13.权利要求12的方法，其中上调范围介于约65％～约200％之间。14.权利要求1的方法，其中在候选化合物治疗之后肠MRP2mRNA上调。15.一种用于筛选调节PXR受体或其片段的化合物或其盐的试剂盒，所述试剂盒包括PXR受体蛋白或其活性片段和利福霉素类似物。16.一种用于治疗PXR相关疾病的药物，所述药物包含调节孕烷X受体(PXR)蛋白或其片段的化合物或其盐，或者调节由PXR蛋白或其片段与利福霉素类似物的结合所诱导的信号转导的化合物或其盐。17.一种治疗、预防或减轻受治疗者的PXR相...

【专利技术属性】
技术研发人员：FJ冈萨雷斯，L约翰逊，X马，
申请(专利权)人：萨利克斯药品有限公司，美国政府卫生与公众服务部，
类型：发明
国别省市：US[美国]