A型流感病毒流行毒株检测和分型基因芯片及使用方法技术

本发明专利技术公开一种Ａ型流感病毒流行毒株检测和分型的基因芯片，它包括对Ｈ１Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、Ｈ５Ｎ１、Ｈ９Ｎ２四种亚型进行检测和分型的７９条特异性寡核苷酸探针、两条质控探针和载体，两条质控探针为质控探针Ⅰ和质控探针Ⅱ，其中特异性寡核苷酸探针和质控探针Ⅰ分布在载体上，本发明专利技术还公开了基因芯片的制备方法，包括以下步骤：步骤一，探针的设计；步骤二，探针的合成；步骤三，芯片的制备。本发明专利技术公开基因芯片的使用方法，其特征是它包括以下步骤：步骤一，流感病毒ＲＮＡ的提取；步骤二ＨＡ和ＮＡ基因ＰＣＲ扩增；步骤三，荧光标记；步骤四，杂交；步骤五，杂交后清洗基因芯片；步骤六，扫描；步骤七，数据分析。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种， 属于生物芯片领域。
技术介绍
流行性感冒(Influenza)简称流感，是由流行性感冒病毒(Influenza virus) 引起的一种急性呼吸道传染病。长期以来，流感一直是危害人类健康和公众安 全的严重传染病，每年由此造成的经济损失也十分巨大。据世界卫生组织估计， 每年全球流感患者约为6-12亿，其中约有3-5百万是重症流感患者，每年约有 30-50万人死于流感。流感病毒在分类上属于正粘病毒科，根据核蛋白(NP) 和基质蛋白(MP)抗原性的不同，分为甲(A)、乙(B)、丙(C)三型。A型流 感病毒可以感染多种动物，是人类流感和动物流感的主要病原。A型流感病毒 根据其表面蛋白血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的抗原性差异，可分为不同 的亚型，目前在水禽中已发现16种HA亚型和9种M亚型。在过去的一个世纪 里，A型流感病毒引发4次人类流感大流行。A型流感病毒不仅血清型复杂，遗传变异也十分活跃，变异的方式主要有核苷酸点突变积累引起的抗原漂移和不 同毒株基因节段重配引起的抗原转换两种。研究表明，每1-2年，H1和H3流 感病毒在人群免疫压力下都会发生一次大的抗原漂本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种Ａ型流感病毒流行毒株检测和分型的基因芯片，其特征是它包括对Ｈ１Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、Ｈ５Ｎ１、Ｈ９Ｎ２四种亚型进行检测和分型的７９条特异性寡核苷酸探针、两条质控探针和载体，两条质控探针为质控探针Ⅰ和质控探针Ⅱ，其中特异性寡核苷酸探针和质控探针Ⅰ分布在载体上，　对Ｈ１Ｎ１进行检测和分型的特异性寡核苷酸探针的序列　编号　名称　序列１　Ｈ１Ｎ１－ＨＡ－１　ａｔｇｃｃａａｃａａｃｔｃａａｃｃｇａｃ　２　Ｈ１Ｎ１－ＨＡ－２　ａｃｔｔｇａｇａａｇａａｔｇｔｇａｃａｇｔｇａｃ 　３　Ｈ１Ｎ１－ＨＡ－３　ａｃａｃａｇａａｔｇｃｃａｔｔｇａｃｇｇ　４　Ｈ１Ｎ１－ＨＡ－４　ｇａａａｔｔ...

【技术特征摘要】
1、一种A型流感病毒流行毒株检测和分型的基因芯片，其特征是它包括对H1N1、H3N2、H5N1、H9N2四种亚型进行检测和分型的79条特异性寡核苷酸探针、两条质控探针和载体，两条质控探针为质控探针I和质控探针II，其中特异性寡核苷酸探针和质控探针I分布在载体上，对H1N1进行检测和分型的特异性寡核苷酸探针的序列 编号名称序列1H1N1-HA-1atgccaacaactcaaccgac2H1N1-HA-2acttgagaagaatgtgacagtgac3H1N1-HA-3acacagaatgccattgacgg4H1N1-HA-4gaaattggaaatggctgctttga5H1N1-HA-5ctatatgagaaagtaagaagccagc6H1N1-NA-1ctagtgggagcagcatttcttt7H1N1-NA-2ttgtggcgttgatagtgatactg8H1N1-NA-3attcatctctttgttctatcagtgga9H1N1-NA-4atacacaaaagacaacagcataagaat10H1N1-NA-5ctaatggatggacagataccgatag11H1N1-NA-6gattggtcaggatacagtggaag对H3N2进行检测和分型的特异性寡核苷酸探针的序列 12H3N2-HA-1ctgttacccttatgatgtgccg13H3N2-HA-2gaacgcagcaaagcctacag14H3N2-HA-3attaacagcacagggaatctaattg15H3N2-HA-4caataatgagatcagatgcaccca16H3N2-HA-5gaacaaagaagcaactgaggga17H3N2-HA-6gctgaggatatgggcaatgg18H3N2-HA-7atgacaacagcacggcaac19H3N2-HA-8caacaggtagaatatgcgacagt20H3N2-HA-9ctgttacccttatgatgtgccg21H3N2-HA-10ttatgcctcccttaggtcactag22H3N2-HA-11ggatgcggaatgtaccagaga 23H3N2-HA-12aactagaggcatattcggcg24H3N2-HA-13gggtcaatcagaaatggaacttatg25H3N2-NA-1tgaccaacaccaccatagagaa26H3N2-NA-2agcagaatacagaaattggtcaaag27H3N2-NA-3atgcgatcctgacaagtgttatc28H3N2-NA-4ggacagggaacaacactaaacaa29H3N2-NA-5atggagtgaaaggctgggc30H3N2-NA-6tcctggtaactactgtaacattgc31H3N2-NA-7gccacaatatgcttccttatgc32H3N2-NA-8gtatctgaccaacaccaccatag33H3N2-NA-9ctgtgtgaaccaacaataatagaaa34H3N2-NA-10gctcaagttgtcacgatggaa35H3N2-NA-11cctattgatgaatgagttgggtgt36H3N2-NA-12gaggcttgtagatagtattggttca37H3N2-NA-13catagttgacagaggtaataggtcc对H5N1进行检测和分型的特异性寡核苷酸探针的序列 38H5N1-HA-1cgacagagcaggttgacaca39H5N1-HA-2tcaagaaaggggactcagcaa40H5N1-HA-3aaggcaatagatggagtcacc41H5N1-HA-4gccgttggaagggaatttaataac42H5N1-HA-5aacaagaagatggaagacggatt43H5N1-HA-6cggaatggtcttacatagtggag44H5N1-HA-7ccagccaatgacctctgttac45H5N1-HA-8gctacaataataccaaccaagaaga46H5N1-HA-9cctaatgatgcggcagagc47H5N1-HA-10tgccattccacaacatacacc48H5N1-HA-11aagtgaattggaatatggtaactgc49H5N1-HA-12ccgcagtattcagaagaagcaa50H5N1-HA-13ttattcaacagtggcgagttcc51H5N1-HA-14aagaactgaaacacctattgagca52H5N1-NA-1tggaggaacaacatactgagaac53H5N1-NA-2ggcataataacagacactatcaaga 54H5N1-NA-3agcactaattccaggagcgg55H5N1-NA-4ccagaactgacaggattagattgc56H5N1-NA-5attggtcaggatatagcgggag57H5N1-NA-6gccgttcatctcatgctcc58H5N1-NA-7ttgactcagggagccttgc59H5N1-NA-8tggaggaacaacatactgagaac60H5N1-NA-9ttactgtaatgactgatggaccaag61H5N1-NA-10ttcggagacaatccacgcc62H5N1-NA-11tggcatggctcaaatcggc63H5N1-NA-12agcactaattccaggagcgg64H5N1-NA-13ggtggactggaacggacag对H9N2进行检测和分型的特异性寡核苷酸探针的序列 65H9N2-HA-1gcatcggctaccaatcaacaa66H9N2-HA-2tgt...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘奋勇，李稀罕，
申请(专利权)人：泰州亲和力生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：32[中国|江苏]