一种焦磷酸测序检测clade2.1.3分支H5N1亚型禽流感病毒的方法技术

本发明专利技术公开了一种焦磷酸测序检测clade2.1.3分支H5N1亚型禽流感病毒的方法。本发明专利技术提供了一种检测clade 2.1.3分支H5N1禽流感病毒的成套引物，包括如下引物对：所述引物对由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成。上述成套引物还包括核苷酸序列为序列表中序列3的测序引物。本方法的特异性强、灵敏度高，与病毒分离和血凝抑制实验等常规实验方法的鉴定结果相比，符合率达100％，可以及时对禽染病情况及区域、环境的病毒污染情况作出及时快捷的检测和确诊，这对于及时监测clade2.1.3分支H5N1禽流感病毒入境传播具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物
，尤其涉及一种焦磷酸测序检测clade2.1.3分支H5N1亚型禽流感病毒的方法。
技术介绍
传统的禽流感病毒检测方法为接种鸡胚进行病毒分离培养(需时2-3天)，然后采用血凝抑制试验进行流感病毒亚型的鉴定(需时1天)。传统的检测方法具有费时、费力的弊端，难以做出快速而及时的诊断，且传统的检测方法对同源性较高的病毒不能做出准确的区分。高致病H5N1亚型禽流感病毒已在亚洲、欧洲、非洲15个国家的家禽中流行，并引发人的感染。在这些国家中，印尼的发病数及死亡率居全世界首位。截止2015年9月，印尼已有199人确诊感染H5N1禽流感病毒，167人死亡，发病数及死亡率居全世界首位。印尼地区主要流行的H5N1毒株为clade2.1分支，包括2.1.1，2.1.2，2.1.3。自2005年以来，calde2.1.1和clade2.1.2所占比例明显减少，而clade2.1.3逐渐成为印尼主要流行毒株，且几乎所有感染人的毒株均属于clade2.1.3分支。表明clade2.1.3分支病毒相比于其他分支H5亚型流感病毒对人类的感染性、致病性更强。目前为止，我国尚未有人或禽类感本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种检测clade 2.1.3分支H5N1禽流感病毒的成套引物，包括如下引物对：所述引物对由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成。

【技术特征摘要】
1.一种检测clade2.1.3分支H5N1禽流感病毒的成套引物，包括如下引物对：所述引物对由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成。2.根据权利要求1所述的成套引物，其特征在于：所述引物对中的一条引物末端生物素标记。3.根据权利要求1或2所述的成套引物，其特征在于：所述成套引物还包括核苷酸序列为序列表中序列3的测序引物。4.含有权利要求1-3任一所述成套引物的成套PCR试剂或含有所述成套引物或所述成套PCR试剂的试剂盒。5.根据权利要求4所述的成套PCR试剂，其特征在于：所述成套PCR试剂由PCR试剂1和PCR试剂2组成；所述PCR试剂1为含有权利要求1-3任一所述成套引物中所述引物对的试剂；或，所述引物对中每条引物在所述PCR试剂1中的浓度为20μM；所述PCR试剂2为含有权利要求1-3任一所述成套引物中所述测序引物的试剂；或，所述测序引物在所述PCR试剂2中的浓度为0.3μM。6.权利要求1-3任一所述成套引物或权利要求4所述的成套PCR试剂或试剂盒在检测clade2.1.3分支H5N1禽流感病毒中的应用；或，权利要求1-3任一所述成套引物或权利要求4所述的成套PCR试剂或试剂盒在制备检测clade2.1.3分支H5N1禽流感病毒产品中的应用；或，权利要求1-3任一所述成套引物或权利要求4所述的成套PCR试剂或试剂盒在检测待测样本中是否含有clade2.1.3分支H5N1禽流感病毒中的应用；或，权利要求1-3任一所述成套引物或权利要求4所述的成套PCR试剂或试剂盒在制备检测待测样本中是否含有clade2.1.3分支H5N1禽流感病毒产品中的应用；或，权利要求1-3任一所述成套引物或权利要求4所述的成套PCR试剂或试剂盒在检测H5N1亚型禽流感病毒HA蛋白裂解位点P6位氨基酸残基中的应用；或，权利要求1-3...

【专利技术属性】
技术研发人员：孙洪磊，王晨曦，张谞霄，蒲娟，孙怡朋，刘金华，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：北京;11