本发明专利技术涉及一种郁金香花芽休眠期需冷量相关的
【技术实现步骤摘要】
一种郁金香花芽休眠期需冷量相关的SNP标记及其应用
[0001]本专利技术涉及郁金香休眠期不同需冷量品种筛选领域,具体涉及一种郁金香花芽休眠期需冷量相关的
SNP
标记及其应用
。
技术介绍
[0002]郁金香是百合科郁金香属单子叶植物,是世界上重要的球根花卉,其花型典雅,花色艳丽,极具观赏价值
。
郁金香种球生产规模逐年扩大,目前全球郁金香种球生产国约有
15
个,种植面积达到
13000hm2。
其中荷兰为郁金香种球的主要生产国,每年种球产量超过
43
亿颗,创造了巨大的经济效益
。
[0003]郁金香的种球在夏季完成花芽分化,随后进入休眠状态
。
解除郁金香的休眠是郁金香花芽生长和开花的必要条件,郁金香休眠状态的解除需要一段时间的低温处理,生产上一般采用
5℃
或
9℃
的低温处理郁金香种球
12
周以上以解除休眠
。
然而,不同品种郁金香解除休眠所需低温处理时间存在极大差异,无差别低温处理会耗费巨大人力和物力成本
。
选育低需冷量品种郁金香或是根据不同品种需冷量差异选择合适的低温处理时间则是更经济
、
更环保的选择
。
[0004]分子标记辅助育种是一种存在范围广
、
遗传稳定的分子育种技术,其中单核苷酸多态性
(Single Nucleotide Polymorphism
,
SNP)
是目前在生物基因组分布频率最高的遗传分子标记,具有全基因组覆盖
、
特异性高
、
实验结果稳定性高
、
高通量的技术优势
。
目前郁金香主要采用传统杂交育种及芽变选种的方法进行新品种培育,存在育种周期长
、
效率低的问题,且缺乏目标性状的精准选择方法
。
通过基因功能研究,发掘郁金香需冷量性状相关的功能基因,并根据其
SNP
多态性筛选需冷量相关分子标记,对于郁金香品种资源评价
、
分子育种工具开发和种球精准低温处理具有重要意义
。
[0005]TgDRR1
基因属于
bHLH(basic helix
‑
loop
‑
helix)
转录因子家族,是具有转录激活活性的
E
‑
box binding
类转录因子
。
前期研究表明,
TgDRR1
基因参与调控内源脱落酸的合成以及赤霉素的信号转导,进而调控低温介导的郁金香花芽休眠解除过程
。
技术实现思路
[0006]本专利技术的目的是提供一种与郁金香花芽休眠期需冷量性状相关的
SNP
标记及其应用,以解决上述现有技术存在的问题,通过对
TgDRR1
基因的基因组序列进行分析和筛选,得到该基因编码区与需冷量性状相关联的
SNP
位点,该位点作为郁金香需冷量性状分子标记能准确
、
快速地对郁金香品种资源等需冷量性状进行选择和评价,并以此为依据建立种球休眠解除精准低温处理技术方案,提升郁金香开花品质
。
[0007]本专利技术解决上述技术问题的技术方案如下:
[0008]一种郁金香花芽休眠期需冷量相关的
SNP
标记,所述
SNP
分子标记对应于郁金香
TgDRR1
基因第5个外显子上的
A/G
突变,位于如
SEQ ID NO:1
所示的碱基序列自5’
端起的第
1544
位
。
[0009]进一步的,
SNP
分子标记的基因型为
AA、AG
和
GG
中的任意一种
。
[0010]上述的郁金香花芽休眠期需冷量相关的
SNP
标记在郁金香花芽休眠过程需冷量判断中的应用
。
[0011]应用方法为,若郁金香的相关
SNP
分子标记为
AA
基因型,则判定为休眠期低需冷量品种,若郁金香的相关
SNP
分子标记为
AG
或
GG
基因型,则判定为休眠期高需冷量品种
。
[0012]进一步的,低需冷量品种郁金香休眠时需要在
5℃
下低温处理3周,高需冷量郁金香休眠时需要在
5℃
下低温处理
12
周以上
。
[0013]本专利技术的有益效果为:本专利技术通过克隆并分析郁金香
TgDRR1
基因的基因组序列,筛选到一个与郁金香需冷量性状相关联的
SNP
位点,即郁金香
TgDRR1
基因外显子5上的
A/G
突变,位于如
SEQ ID NO:1
所示的碱基序列自5’
端起始密码子的第
1544
位
。
该
SNP
突变位点可作为新的
SNP
分子标记应用到早期筛选低需冷量性状郁金香品种,减少生产上郁金香种球低温处理时间,降低生产成本
。
通过关联分析发现,该
SNP
位点的
AA
基因型个体表现出解除休眠所需的较低需冷量,
AG、GG
基因型个体表现出解除休眠所需的较高需冷量,研究结果可以为郁金香分子育种的实际应用提供参考标记
。
附图说明
[0014]图1为不同品种郁金香
TgDRR1
基因
PCR
扩增产物的琼脂凝胶电泳图;
[0015]图2为郁金香
TgDRR1
基因
A1544G
突变位点及其侧翼序列的比对结果;
[0016]图3为郁金香
TgDRR1
基因
A1544G
位点
AA、AG、GG
基因型测序峰图,其中
‘
道琼斯
’
为低需冷量品种,
‘
夜皇后
’
和
‘
范兰迪
’
为高需冷量品种;
[0017]图4为低需冷量品种和高需冷量品种在低温处理不同时间后,进行定植后的开花表型
。
具体实施方式
[0018]以下是对本专利技术的原理和特征进行描述,所举实例只用于解释本专利技术,并非用于限定本专利技术的范围
。
[0019]1、
郁金香材料
[0020]所用郁金香品种的种球
(
球径
...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.
一种郁金香花芽休眠期需冷量相关的
SNP
标记,其特征在于,所述
SNP
分子标记对应于郁金香
TgDRR1
基因第5个外显子上的
A/G
突变,位于如
SEQ ID NO:1
所示的碱基序列自5’
端起始密码子
ATG
起的第
1544
位
。2.
根据权利要求1所述的郁金香花芽休眠期需冷量相关的
SNP
标记,其特征在于,
SNP
分子标记的基因型为
AA、AG
和
GG
中的任意一种
。3.
权利要求1或2所...
【专利技术属性】
技术研发人员:王艳平,尹博,产祝龙,赵慧敏,向林,
申请(专利权)人:华中农业大学,
类型:发明
国别省市:
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。