针对具有G12D突变的RAS的HLAII类限制性DRBT细胞受体制造技术

本文公开了分离的或纯化的T细胞受体(TCR)，其中所述TCR对于突变的人类RAS氨基酸序列具有抗原特异性，所述突变的人类RAS氨基酸序列在位置12处的甘氨酸被天冬氨酸取代。所述TCR可识别HLA

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】针对具有G12D突变的RAS的HLA II类限制性DRB T细胞受体
相关申请的交叉引用
[0001]本专利申请要求2020年7月13日提交的第63/050,931号美国临时专利申请的权益，将所述美国临时专利申请通过引用以其整体并入本文。关于联邦资助的研究或开发的声明
[0002]本专利技术是在政府支持下由美国国立卫生研究院的国家癌症研究所在项目编号ZIABC010984下完成的。政府对本专利技术享有一定的权利。以电子方式提交的材料的引用并入
[0003]与本文同时提交并如下鉴定的计算机可读核苷酸/氨基酸序列表通过引用以其整体并入本文：一个名称为“754395_ST25.txt”的160,788字节ASCII(文本)文件，日期为2021年7月13日。专利技术背景
[0004]一些癌症可能具有极有限的治疗选择，尤其在癌症发生转移和不可切除时。尽管在诸如例如手术、化学疗法及放射疗法的治疗中取得一定进展，但许多癌症(诸如例如胰腺癌、结肠直肠癌、肺癌、子宫内膜癌、卵巢癌和前列腺癌)的预后可能较差。因此，存在对于癌症的另外治疗的未满足的需求。专利技术概述
[0005]本专利技术的一个实施方案提供了分离的或纯化的T细胞受体(TCR)，其包含以下氨基酸序列：(a)SEQ ID NO:1
‑
3的全部，(b)SEQ ID NO:4
‑
6的全部，(c)SEQ ID NO:1
‑
6的全部，(d)SEQ ID NO:11
‑
13的全部，(e)SEQ ID NO:14
‑
16的全部，(f)SEQ ID NO:11
‑
16的全部，(g)SEQ ID NO:21
‑
23的全部，(h)SEQ ID NO:24
‑
26的全部，(i)SEQ ID NO:21
‑
26的全部，(j)SEQ ID NO:31
‑
33的全部，(k)SEQ ID NO:34
‑
36的全部，或(l)SEQ ID NO:31
‑
36的全部，其中TCR对于突变的人类RAS氨基酸序列具有抗原特异性，所述突变的人类RAS氨基酸序列在位置12处的甘氨酸被天冬氨酸取代，其中突变的人类RAS氨基酸序列是突变的人Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)、突变的人Harvey大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(HRAS)或突变的人神经母细胞瘤大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(NRAS)氨基酸序列，以及其中位置12分别参照野生型人KRAS蛋白、野生型人HRAS蛋白或野生型人NRAS蛋白被定义。
[0006]本专利技术的另一个实施方案提供了包含本专利技术的TCR的功能部分的分离的或纯化的多肽，其中所述功能部分包含以下氨基酸序列：(a)SEQ ID NO:1
‑
3的全部，(b)SEQ ID NO:4
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6的全部，(c)SEQ ID NO:1
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6的全部，(d)SEQ ID NO:11
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13的全部，(e)SEQ ID NO:14
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16的全部，(f)SEQ ID NO:11
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16的全部，(g)SEQ ID NO:21
‑
23的全部，(h)SEQ ID NO:24
‑
26的全部，(i)SEQ ID NO:21
‑
26的全部，(j)SEQ ID NO:31
‑
33的全部，(k)SEQ ID NO:34
‑
36的全部，或(l)SEQ ID NO:31
‑
36的全部。
[0007]本专利技术的另一个实施方案提供了分离的或纯化的蛋白质，其包含(a)含有SEQ ID NO:1
‑
3的氨基酸序列的第一多肽链和含有SEQ ID NO:4
‑
6的氨基酸序列的第二多肽链；(b)含有SEQ ID NO:11
‑
13的氨基酸序列的第一多肽链和含有SEQ ID NO:14
‑
16的氨基酸序列的第二多肽链；(c)含有SEQ ID NO:21
‑
23的氨基酸序列的第一多肽链和含有SEQ ID NO:24
‑
26的氨基酸序列的第二多肽链；或(d)含有SEQ ID NO:31
‑
33的氨基酸序列的第一多肽
链和含有SEQ ID NO:34
‑
36的氨基酸序列的第二多肽链。
[0008]本专利技术的实施方案还提供了与本专利技术的TCR、多肽及蛋白质相关的核酸、重组表达载体、宿主细胞、细胞群体和药物组合物。
[0009]本专利技术的一个实施方案提供了自5
’
至3
’
包含第一核苷酸序列和第二核苷酸序列的分离的或纯化的核酸，其中第一核苷酸序列和第二核苷酸序列分别编码以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7和8；SEQ ID NO:8和7；SEQ ID NO:9和10；SEQ ID NO:10和9；SEQ ID NO:17和18；SEQ ID NO:18和17；SEQ ID NO:19和20；SEQ ID NO:20和19；SEQ ID NO:27和28；SEQ ID NO:28和27；SEQ ID NO:29和30；SEQ ID NO:30和29；SEQ ID NO:37和38；SEQ ID NO:38和37；SEQ ID NO:39和40；SEQ ID NO:40和39；SEQ ID NO:55和56；SEQ ID NO:56和55；SEQ ID NO:57和58；SEQ ID NO:58和57；SEQ ID NO:59和60；SEQ ID NO:60和59；SEQ ID NO:61和62；SEQ ID NO:62和61；SEQ ID NO:63和64；SEQ ID NO:64和63；SEQ ID NO:65和66；SEQ ID NO:66和65；SEQ ID NO:67和68；SEQ ID NO:68和67；SEQ ID NO:69和70；SEQ ID NO:70和69；SEQ ID NO:71和72；SEQ ID NO:72和71；SEQ ID NO:73和74；SEQ ID NO:74和73；SEQ ID NO:75和76；SEQ ID NO:76和75；SEQ ID NO:77和78；SEQ ID NO:78和77；SEQ ID NO:79和80；SEQ ID NO:80和79；SEQ ID NO:81和82；SEQ ID NO:82和81；SEQ ID NO:83和84；SEQ ID NO:84和83；SEQ ID NO:85和86；或SEQ ID NO:86和85。
[0010]本专利技术的实施方案还提供了检测哺乳动物癌症存在的方法、治疗或预防哺乳动物的癌症的方法、诱导哺乳动物中针对癌症的免疫应答的方法、产生表达对MTEYKLVVVGADGVGKSALTIQ本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.分离的或纯化的T细胞受体(TCR)，其包含以下氨基酸序列：(a)SEQ ID NO 1
‑
3的全部，(b)SEQ ID NO:4
‑
6的全部，(c)SEQ ID NO:1
‑
6的全部，(d)SEQ ID NO:11
‑
13的全部，(e)SEQ ID NO:14
‑
16的全部，(f)SEQ ID NO:11
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16的全部，(g)SEQ ID NO:21
‑
23的全部，(h)SEQ ID NO:24
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26的全部，(i)SEQ ID NO:21
‑
26的全部，(j)SEQ ID NO:31
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33的全部，(k)SEQ ID NO:34
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36的全部，或(l)SEQ ID NO:31
‑
36的全部，其中所述TCR对于突变的人类RAS氨基酸序列具有抗原特异性，所述突变的人类RAS氨基酸序列在位置12处的甘氨酸被天冬氨酸取代，其中所述突变的人类RAS氨基酸序列是突变的人Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)、突变的人Harvey大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(HRAS)或突变的人神经母细胞瘤大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(NRAS)氨基酸序列，以及其中位置12分别参照野生型人KRAS蛋白、野生型人HRAS蛋白或野生型人NRAS蛋白被定义。2.如权利要求1所述的TCR，其中所述突变的人类RAS氨基酸序列是MTEYKLVVVGADGVGKSALTIQLI(SEQ ID NO:88)。3.如权利要求1或2所述的TCR，其中所述TCR对MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLI(SEQ ID NO:89)的野生型人类RAS氨基酸序列不具有抗原特异性。4.如权利要求1
‑
3中任一项所述的TCR，其中所述突变的人类RAS氨基酸序列由人白细胞抗原(HLA)II类分子呈递。5.如权利要求4所述的TCR，其中所述HLA II类分子是HLA
‑
DR异二聚体。6.如权利要求4所述的TCR，其中所述HLA II类分子包含由HLA
‑
DRB1基因、HLA
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DRB3基因或HLA
‑
DRB4基因中的任一种编码的HLA
‑
DRα链与HLA
‑
DRβ链的组合。7.如权利要求4所述的TCR，其中所述HLA II类分子是HLA
‑
DRB1*03:HLA
‑
DRA*01异二聚体、HLA
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DRB1*11:HLA
‑
DRA*01异二聚体、HLA
‑
DRB3*01:HLA
‑
DRA*01异二聚体、HLA
‑
DRB3*03:HLA
‑
DRA*01异二聚体、HLA
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DRB4*03:HLA
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DRA*01异二聚体或HLA
‑
DRB4*01:HLA
‑
DRA*01异二聚体。8.如权利要求1
‑
7中任一项所述的TCR，其包含以下氨基酸序列：(i)SEQ ID NO:7，(ii)SEQ ID NO:8，(iii)SEQ ID NO:9，(iv)SEQ ID NO:10，(v)SEQ ID NO:17，
(vi)SEQ ID NO:18，(vii)SEQ ID NO:19，(viii)SEQ ID NO:20，(ix)SEQ ID NO:27，(x)SEQ ID NO:28，(xi)SEQ ID NO:29，(xii)SEQ ID NO:30，(xiii)SEQ ID NO:37，(xiv)SEQ ID NO:38，(xv)SEQ ID NO:39，(xvi)SEQ ID NO:40，(xvii)SEQ ID NO:7和8两者，(xviii)SEQ ID NO:9和10两者，(xix)SEQ ID NO:17和18两者，(xx)SEQ ID NO:19和20两者，(xxi)SEQ ID NO:27和28两者，(xxii)SEQ ID NO:29和30两者，(xxiii)SEQ ID NO:37和38两者，或(xxiv)SEQ ID NO:39和40两者。9.如权利要求1
‑
8中任一项所述的TCR，其还包含：(a)包含SEQ ID NO:49的氨基酸序列的α链恒定区，其中：(i)SEQ ID NO:49的位置48处的X是Thr或Cys；(ii)SEQ ID NO:49的位置112处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:49的位置114处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:49的位置115处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(b)包含SEQ ID NO:50的氨基酸序列的β链恒定区，其中SEQ ID NO:50的位置57处的X是Ser或Cys；或(c)(a)和(b)两者。10.如权利要求1
‑
9中任一项所述的分离的或纯化的TCR，其包含：(a)包含SEQ ID NO:55的氨基酸序列的α链，其中：(i)SEQ ID NO:55的位置184处的X是Thr或Cys；(ii)SEQ ID NO:55的位置248处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:55的位置250处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:55的位置251处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(b)包含SEQ ID NO:56的氨基酸序列的β链，其中SEQ ID NO:56的位置199处的X是Ser或Cys；(c)(a)和(b)两者；(d)包含SEQ ID NO:57的氨基酸序列的α链，其中：(i)SEQ ID NO:57的位置165处的X是Thr或Cys；
(ii)SEQ ID NO:57的位置229处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:57的位置231处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:57的位置232处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(e)包含SEQ ID NO:58的氨基酸序列的β链，其中SEQ ID NO:58的位置175处的X是Ser或Cys；(f)(d)和(e)两者；(g)SEQ ID NO:59；(h)SEQ ID NO:60；(i)SEQ ID NO:61；(j)SEQ ID NO:62；(k)(g)和(h)两者；(l)(i)和(j)两者；(m)包含SEQ ID NO:63的氨基酸序列的α链，其中：(i)SEQ ID NO:63的位置182处的X是Thr或Cys；(ii)SEQ ID NO:63的位置246处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:63的位置248处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:63的位置249处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(n)包含SEQ ID NO:64的氨基酸序列的β链，其中SEQ ID NO:64的位置197处的X是Ser或Cys；(o)(m)和(n)两者；(p)包含SEQ ID NO:65的氨基酸序列的α链，其中：(i)SEQ ID NO:65的位置164处的X是Thr或Cys；(ii)SEQ ID NO:65的位置228处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:65的位置230处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:65的位置231处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(q)包含SEQ ID NO:66的氨基酸序列的β链，其中SEQ ID NO:66的位置173处的X是Ser或Cys；(r)(p)和(q)两者；(s)SEQ ID NO:67；(t)SEQ ID NO:68；(u)SEQ ID NO:69；(v)SEQ ID NO:70；(w)(s)和(t)两者；(x)(u)和(v)两者；(y)包含SEQ ID NO:71的氨基酸序列的α链，其中：(i)SEQ ID NO:71的位置187处的X是Thr或Cys；(ii)SEQ ID NO:71的位置251处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:71的位置253处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:71的位置254处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；
(z)包含SEQ ID NO:72的氨基酸序列的β链，其中SEQ ID NO:72的位置191处的X是Ser或Cys；(aa)(y)和(z)两者；(bb)包含SEQ ID NO:73的氨基酸序列的α链，其中：(i)SEQ ID NO:73的位置168处的X是Thr或Cys；(ii)SEQ ID NO:73的位置232处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:73的位置234处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:73的位置235处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(cc)包含SEQ ID NO:74的氨基酸序列的β链，其中SEQ ID NO:74的位置173处的X是Ser或Cys；(dd)(bb)和(cc)两者；(ee)SEQ ID NO:75；(ff)SEQ ID NO:76；(gg)SEQ ID NO:77；(hh)SEQ ID NO:78；(ii)(ee)和(ff)两者；(jj)(gg)和(hh)两者；(kk)包含SEQ ID NO:79的氨基酸序列的α链，其中：(i)SEQ ID NO:79的位置175处的X是Thr或Cys；(ii)SEQ ID NO:79的位置239处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:79的位置241处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:79的位置242处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(ll)包含SEQ ID NO:80的氨基酸序列的β链，其中SEQ ID NO:80的位置190处的X是Ser或Cys；(mm)(kk)和(ll)两者；(nn)包含SEQ ID NO:81的氨基酸序列的α链，其中：(i)SEQ ID NO:81的位置159处的X是Thr或Cys；(ii)SEQ ID NO:81的位置223处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:81的位置225处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:81的位置226处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(oo)包含SEQ ID NO:82的氨基酸序列的β链，其中SEQ ID NO:82的位置172处的X是Ser或Cys；(pp)(nn)和(oo)两者；(qq)SEQ ID NO:83；(rr)SEQ ID NO:84；(ss)SEQ ID NO:85；(tt)SEQ ID NO:86；(uu)(qq)和(rr)两者；或(vv)(ss)和(tt)两者。
11.分离的或纯化的多肽，其包含权利要求1
‑
10中任一项所述的TCR的功能部分，其中所述功能部分包含以下氨基酸序列：(a)SEQ ID NO:1
‑
3的全部，(b)SEQ ID NO:4
‑
6的全部，(c)SEQ ID NO:1
‑
6的全部，(d)SEQ ID NO:11
‑
13的全部，(e)SEQ ID NO:14
‑
16的全部，(f)SEQ ID NO:11
‑
16的全部，(g)SEQ ID NO:21
‑
23的全部，(h)SEQ ID NO:24
‑
26的全部，(i)SEQ ID NO:21
‑
26的全部，(j)SEQ ID NO:31
‑
33的全部，(k)SEQ ID NO:34
‑
36的全部，或(l)SEQ ID NO:31
‑
36的全部。12.如权利要求11所述的分离的或纯化的多肽，其中所述功能部分包含以下氨基酸序列：(i)SEQ ID NO:7，(ii)SEQ ID NO:8，(iii)SEQ ID NO:9，(iv)SEQ ID NO:10，(v)SEQ ID NO:17，(vi)SEQ ID NO:18，(vii)SEQ ID NO:19，(viii)SEQ ID NO:20，(ix)SEQ ID NO:27，(x)SEQ ID NO:28，(xi)SEQ ID NO:29，(xii)SEQ ID NO:30，(xiii)SEQ ID NO:37，(xiv)SEQ ID NO:38，(xv)SEQ ID NO:39，(xvi)SEQ ID NO:40，(xvii)SEQ ID NO:7和8两者，(xviii)SEQ ID NO:9和10两者，(xix)SEQ ID NO:17和18两者，(xx)SEQ ID NO:19和20两者，(xxi)SEQ ID NO:27和28两者，(xxii)SEQ ID NO:29和30两者，(xxiii)SEQ ID NO:37和38两者，或
(xxiv)SEQ ID NO:39和40两者。13.如权利要求11或12所述的分离的或纯化的多肽，其还包含：(a)SEQ ID NO:49的氨基酸序列，其中：(i)SEQ ID NO:49的位置48处的X是Thr或Cys；(ii)SEQ ID NO:49的位置112处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:49的位置114处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:49的位置115处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(b)SEQ ID NO:50的氨基酸序列，其中SEQ ID NO:50的位置57处的X是Ser或Cys；或(c)(a)和(b)两者。14.如权利要求11
‑
13中任一项所述的分离的或纯化的多肽，其包含：(a)包含SEQ ID NO:55的氨基酸序列的α链，其中：(i)SEQ ID NO:55的位置184处的X是Thr或Cys；(ii)SEQ ID NO:55的位置248处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:55的位置250处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:55的位置251处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(b)包含SEQ ID NO:56的氨基酸序列的β链，其中SEQ ID NO:56的位置199处的X是Ser或Cys；(c)(a)和(b)两者；(d)包含SEQ ID NO:57的氨基酸序列的α链，其中：(i)SEQ ID NO:57的位置165处的X是Thr或Cys；(ii)SEQ ID NO:57的位置229处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(iii)SEQ ID NO:57的位置231处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp；和(iv)SEQ ID NO:57的位置232处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp；(e)包含SEQ ID NO:58的氨基酸序列的β链，其中SEQ ID NO:58的位置175处的X是Ser或Cys；(f)(d)和(e)两者；(g)SEQ ID NO:59；(h)SEQ ID NO:60；(i)SEQ ID NO:61；(j)SEQ ID NO:62；(k)(g)和(h)两者；(l)(...

【专利技术属性】
技术研发人员：诺姆，
申请(专利权)人：美国卫生和人力服务部，
类型：发明
国别省市：