一种用于个体识别的引物组、试剂盒及应用制造技术

本发明专利技术提供了一种用于个体识别的引物组、试剂盒及应用，涉及生物技术领域。本发明专利技术提供了一种人染色体InDel基因座在个体识别中的应用，发明专利技术人挑选出了25个常染色体InDel基因座，与Amel结合，组成26

【技术实现步骤摘要】
一种用于个体识别的引物组、试剂盒及应用


[0001]本专利技术涉及生物
，尤其是涉及一种用于个体识别的引物组、试剂盒及应用。

技术介绍

[0002]专利(申请号：2022102199480)提供了人染色体66个InDel基因座在个体识别或亲权鉴定中的应用。专利技术人从dbSNP数据库中自主筛选66个InDel基因座，并评估了66
‑
plex InDels(66个InDel基因座)在251名中国汉族人群中群体遗传学参数，分析其法医学应用价值。结果表明：66个InDel基因座在中国汉族人群中具有良好的遗传多态性，可独立应用于法医个体识别和亲权鉴定研究。
[0003]Sanger测序因其读长长、数据可靠、精度高，被誉为测序技术的“金标准”，但是其通量小、成本高、速度慢、仪器便携性差。二代测序技术解决了通量小、成本高、速度慢等问题，实现了样本的快速检测，但是二代测序技术数据分析步骤繁杂、同时仪器运行环境要求较高，不适用于现场快速检测。基因芯片通过碱基之间的互补配对，将PCR扩增的核苷酸序列与探针结合进行杂交，除了通量高、速度快、成本低之外，芯片可适用性强，适配仪器多为小型仪器，便携性好；分型结果简单，观察芯片信号即可判定结果；操作简单，利于推广应用。鉴于专利(申请号：2022102199480)筛选出的InDel遗传标记，有必要采用生物基因芯片技术自主构建InDel基因芯片分型体系用于个体识别的研究。
[0004]有鉴于此，特提出本专利技术。

技术实现思路

[0005]本专利技术的第一目的在于提供一种人染色体InDel基因座在个体识别中的应用。
[0006]本专利技术的第二目的在于提供一种扩增上述InDel基因座的引物组。
[0007]本专利技术的第三目的在于提供一种个体识别的方法。
[0008]本专利技术的第四目的在于提供一组探针。
[0009]本专利技术的第五目的在于提供一种基因芯片。
[0010]本专利技术的第六目的在于提供一种试剂盒。
[0011]第一方面，本专利技术提供了一种人染色体InDel基因座在个体识别中的应用；
[0012]所述InDel基因座包括：rs56113354、rs76989317、rs66493016、rs34564973、rs5849187、rs71843136、rs2307807、rs139101426、rs33955557、rs56110100、rs10541877、rs10656522、rs59027185、rs3028599、rs10535391、rs145041883、rs56348842、rs10667259、rs35105918、rs372779701、rs146109101、rs3993057、rs34105738、rs10544053、rs11471707和Amel。
[0013]第二方面，本专利技术提供了一种扩增上述InDel基因座的引物组，所述引物组的序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.60所示。
[0014]第三方面，本专利技术提供了一种个体识别的方法，包括如下步骤：
[0015]a.以待测样品的DNA为模板，采用所述的引物组进行扩增；
[0016]b.根据a步骤的扩增结果进行InDel基因座的分型；
[0017]c.根据基因座的基因型进行个体识别；
[0018]所述InDel基因座包括：rs56113354、rs76989317、rs66493016、rs34564973、rs5849187、rs71843136、rs2307807、rs139101426、rs33955557、rs56110100、rs10541877、rs10656522、rs59027185、rs3028599、rs10535391、rs145041883、rs56348842、rs10667259、rs35105918、rs372779701、rs146109101、rs3993057、rs34105738、rs10544053、rs11471707和Amel。
[0019]作为进一步技术方案，分别用于扩增rs56113354、rs76989317、rs66493016、rs34564973、rs5849187、rs71843136、rs2307807、rs139101426、rs33955557、rs56110100、rs10541877、rs10656522、rs59027185、rs3028599、rs10535391、rs145041883、rs56348842、rs10667259、rs35105918、rs372779701、rs146109101、rs3993057、rs34105738、rs10544053、rs11471707和Amel的引物的浓度比为2.25:1:2.25:1.5:2.25:1.5:2:3:1:1.5:1.5:1.5:1.75:1.5:1.5:2.5:3:1.25:2:1.25:2.5:2.5:4.25:2:1.5:1.5。
[0020]作为进一步技术方案，所述引物组的PCR反应程序为：94℃变性1min；94℃变性30s，60℃退火45s，72℃延伸45s，共32个循环；72℃延伸10min。
[0021]第四方面，本专利技术提供了一组探针，所述探针捕获所述引物组PCR扩增产物。
[0022]作为进一步技术方案，所述探针具有如SEQ ID NO.61～SEQ ID NO.111所示的序列。
[0023]作为进一步技术方案，所述探针5
’
端用氨基进行化学修饰。
[0024]第五方面，本专利技术提供了一种基因芯片，包括所述的探针。
[0025]第六方面，本专利技术提供了一种试剂盒，包括所述的引物组、所述的探针或所述的基因芯片中的至少一种。
[0026]与现有技术相比，本专利技术具有如下有益效果：
[0027]专利技术人在在先申请专利(申请号：2022102199480)研究的基础上，进一步挑选出了25个常染色体InDel基因座，Amel作为性别判定基因座，与25个常染色体基因座结合，组成26
‑
plex InDels，经验证，该体系满足Hardy
‑
Weinberg平衡同时各基因座间处于连锁平衡状态，26
‑
plex InDels体系的累计个体识别率为0.999 999 999 970 783，大于常规STR体系的TDP(0.999 999 999 98)，满足个体识别的要求，能够用于个体识别。
[0028]本专利技术提供的引物组能够特异性强，灵敏度高，能够实现对上述26个InDel基因座的扩增。本专利技术提供的探针能够特异性捕获上述引物组的扩增产物。本专利技术提供的基因芯片特异性强，灵敏度高，稳定性好，数据可靠。
附图说明
[0029]为了更清楚地说明本专利技术具体实施方式或现有技术中的技术方案，下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种人染色体InDel基因座在个体识别中的应用；所述InDel基因座包括：rs56113354、rs76989317、rs66493016、rs34564973、rs5849187、rs71843136、rs2307807、rs139101426、rs33955557、rs56110100、rs10541877、rs10656522、rs59027185、rs3028599、rs10535391、rs145041883、rs56348842、rs10667259、rs35105918、rs372779701、rs146109101、rs3993057、rs34105738、rs10544053、rs11471707和Amel。2.一种扩增权利要求1中所述InDel基因座的引物组，其特征在于，所述引物组的序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.60所示。3.一种个体识别的方法，其特征在于，包括如下步骤：a.以待测样品的DNA为模板，采用权利要求2所述的引物组进行扩增；b.根据a步骤的扩增结果进行InDel基因座的分型；c.根据基因座的基因型进行个体识别；所述InDel基因座包括：rs56113354、rs76989317、rs66493016、rs34564973、rs5849187、rs71843136、rs2307807、rs139101426、rs33955557、rs56110100、rs10541877、rs10656522、rs59027185、rs3028599、rs10535391、rs145041883、rs56348842、rs10667259、rs35105918、rs372779701、rs146109101、rs3993057、rs34105738、rs10544053、rs11471707和Amel。4.根...

【专利技术属性】
技术研发人员：‑，
申请(专利权)人：中国人民解放军军事科学院军事医学研究院，
类型：发明
国别省市：