抗KIR3DL3抗体和其用途制造技术

本公开部分地基于以下的发现：与KIR3DL3特异性结合的单克隆抗体和其抗原结合片段；与KIR3DL3和PD

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】抗KIR3DL3抗体和其用途
[0001]相关申请案的交叉引用
[0002]本申请要求于2019年10月4日提交的美国临时申请序列号62/910,594的权益；所述申请的全部内容通过引用整体并入本文。
[0003]权利声明
[0004]本专利技术是在由美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)授予的授权号P50CA101942下由政府支持进行的。政府享有本专利技术的某些权利。

技术介绍

[0005]免疫检查点，如CTLA
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4、PD
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1、VISTA、B7
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H2、B7
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H3、PD
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L1、B7
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H4、B7
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H6、ICOS、HVEM、PD
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L2、CD160、gp49B、PIR
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B、KIR家族受体、TIM
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1、TIM
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3、TIM
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4、LAG
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3、GITR、4
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IBB、OX
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40、BTLA、SIRPα(CD47)、CD48、2B4(CD244)、B7.1、B7.2、ILT
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2、ILT
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4、TIGIT、嗜乳脂蛋白和A2aR以及更多，基于众多输入之间的复杂和组合相互作用负调节免疫应答进程。免疫检查点抑制剂可以调节一些受试者的免疫应答，但免疫检查点表达和与天然结合配偶体的相互作用在受试者之间和受试者的组织内有所不同。显著百分比的患者对此治疗没有应答，并且许多有应答的患者最终会产生抗性。因此，迫切需要找到不因PD
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1途径而冗余的另外的免疫途径。
[0006]HERV
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H LTR相关2(HHLA2，也称为B7
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H5、B7
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H7)是调节T细胞功能的B7家族成员。HHLA2在多种肿瘤(例如实体癌和血液癌，包含原发性人肾细胞癌(RCC))和抗原呈递细胞中广泛表达，并且已被认为是T细胞激活和抑制配体。HHLA2被鉴定为TMIGD2(CD28H、IGPR
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1)的特异性配体，并且HHLA2/TMIGD2相互作用通过AKT依赖性信号传导级联选择性地共刺激人T细胞生长和细胞因子产生(Zhu等人(2013)《自然通讯(Nat.Comm.)》4:2043；Janakiram等人(2015)《临床癌症研究(Clin.Cancer Res.》)21:2359
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2366)。在原初T细胞中表达的TMIGD2是HHLA2的激活受体，并且在T细胞抗原受体(TCR)参与后转导共刺激信号。TMIGD2在重复TCR刺激后被下调。HHLA2的推定抑制性受体可能在激活的T细胞上被上调以调节T细胞激活。

技术实现思路

[0007]在本公开之前，若干项研究表明在激活的T细胞上存在未表征的HHLA2受体，所述受体发挥共同抑制功能(Zhao等人(2013)《美国国家科学院院刊(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)》110:9879
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9884；Xiao和Freeman等人(2015)《临床癌症研究》21:2201
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2203；Wang等人(2014)《免疫学杂志(J.Immunol.)》192:126.11)。发现HHLA2与KIR3DL3结合，即T细胞和NK细胞上的受体，并且HHLA2
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KIR3DL3相互作用的结果是抑制T细胞和NK细胞激活(PCT/US2019/026034)。因此，本公开涵盖对KIR3DL3受体是癌症免疫疗法候选者的认识，并且本文提供了用于靶向KIR3DL3以调节免疫应答的组合物和方法。
[0008]本公开至少部分地基于以下发现：靶向KIR3DL3的药剂(例如抗体)可以特异性阻断HHLA2
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KIR3DL3相互作用并且可以用于调节免疫应答的方法中。重要的是，本文提出靶向
KIR3DL3不会破坏HHLA2的整体功能，这还包含通过其与TMIGD2的相互作用激活免疫应答。因此，本公开提供了重要且令人惊讶的发现，即靶向KIR3DL3提供仅阻断HHLA2的免疫抑制功能的特异性，从而在不下调HHLA2的免疫激活功能的情况下引发有效的免疫应答(例如，针对癌细胞)。开发特异性阻断HHLA2途径的免疫抑制活性并且保持其刺激功能的药物表示在患有癌症(例如，血液癌症和实体瘤，包含透明细胞肾细胞癌(ccRCC))的患者中进行免疫检查点阻断的新方法。
[0009]本公开还至少部分地基于以下发现：靶向KIR3DL3和PD
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1的药剂可以用于调节免疫应答和/或治疗癌症。在一些实施例中，本文所描述的KIR3DL3 x PD
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1双特异性抗体可用作检查点免疫疗法，如激活肿瘤中的T细胞和NK细胞。在一些实施例中，KIR3DL3 x PD
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1双特异性抗体与PD
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1或PD
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L1或其它检查点免疫疗法相加或协同。此外，所述肿瘤中的HHLA2和/或KIR3DL3表达是用于确定对KIR3DL3 mAb和/或KIR3DL3 x PD
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1双特异性抗体检查点阻断的应答性的有用生物标志物。
[0010]一组示例性代表性抗KIR3DL3人单克隆抗体(mAb)在本文中被描述为免疫检查点抑制剂。鉴定了阻断性和非阻断性抗KIR3DL3 mAb，并且阻断HHLA2与KIR3DL3结合的抗KIR3DL3 mAb在T细胞和NK细胞测定中示出为检查点抑制剂抗体。
[0011]一方面，提供了单克隆抗体或其抗原结合片段，其包括：a)重链序列，所述重链序列与选自由表2、7和8中列出的序列组成的组的重链序列具有至少约95％同一性；和/或b)轻链序列，所述轻链序列与选自由表2、7和8中列出的序列组成的组的轻链序列具有至少约95％同一性。
[0012]另一方面，提供了单克隆抗体或其抗原结合片段，其包括：a)一个、两个或三个重链CDR序列，所述重链CDR序列各自与选自由表2、7和8中列出的序列组成的组的重链CDR序列具有至少约95％同一性；和/或b)一个、两个或三个轻链CDR序列，所述轻链CDR序列各自与选自由表2、7和8中列出的序列组成的组的轻链CDR序列具有至少约95％同一性。
[0013]仍另一方面，提供了单克隆抗体或其抗原结合片段，其包括：a)重链序列，所述重链序列选自由表2、7和8中列出的序列组成的组；和/或b)轻链序列，所述轻链序列选自由表2、7和8中列出的序列组成的组。
[0014]又另一方面，提供了单克隆抗体或其抗原结合片段，其包括：a)一个、两个或三个重链CDR序列，所述重链CDR序列各自选自由表2、7和8中列出的序列组成的组；和/或b)一个、两个或三个轻链CDR序列，所述轻链CDR序列各自选自本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种单克隆抗体或其抗原结合片段，其包括：a)重链序列，所述重链序列与选自由表2、7和8中列出的序列组成的组的重链序列具有至少约95％同一性；和/或b)轻链序列，所述轻链序列与选自由表2、7和8中列出的序列组成的组的轻链序列具有至少约95％同一性。2.一种单克隆抗体或其抗原结合片段，其包括：a)一个、两个或三个重链CDR序列，所述重链CDR序列各自与选自由表2、7和8中列出的序列组成的组的重链CDR序列具有至少约95％同一性；和/或b)一个、两个或三个轻链CDR序列，所述轻链CDR序列各自与选自由表2、7和8中列出的序列组成的组的轻链CDR序列具有至少约95％同一性。3.一种单克隆抗体或其抗原结合片段，其包括：a)重链序列，所述重链序列选自由表2、7和8中列出的序列组成的组；和/或b)轻链序列，所述轻链序列选自由表2、7和8中列出的序列组成的组。4.一种单克隆抗体或其抗原结合片段，其包括：a)一个、两个或三个重链CDR序列，所述重链CDR序列各自选自由表2、7和8中列出的序列组成的组；和/或b)一个、两个或三个轻链CDR序列，所述轻链CDR序列各自选自由表2、7和8中列出的序列组成的组。5.根据权利要求1到4中任一项所述的单克隆抗体或其抗原结合片段，其中所述单克隆抗体或其抗原结合片段是嵌合的、人源化的、复合的、鼠的或人的。6.根据权利要求1到5中任一项所述的单克隆抗体或其抗原结合片段，其中所述单克隆抗体或其抗原结合片段：(a)经可检测标记；(b)与细胞毒性药剂，任选地化学治疗剂、生物药剂、毒素和/或放射性同位素缀合；(c)包括效应结构域；(d)包括Fc结构域；和/或(e)选自由以下组成的组：Fv、Fav、F(ab')2)、Fab'、dsFv、scFv、sc(Fv)2和双抗体片段。7.根据权利要求1到6中任一项所述的单克隆抗体或其抗原结合片段，其中所述单克隆抗体或其抗原结合片段能从以保藏登记号______保藏的杂交瘤______获得。8.根据权利要求1到7中任一项所述的单克隆抗体或其抗原结合片段，其中所述单克隆抗体或其抗原结合片段抑制HHLA2与KIR3DL3的结合。9.根据权利要求1到8中任一项所述的单克隆抗体或其抗原结合片段，其中所述单克隆抗体或其抗原结合片段与KIR3DL3特异性结合。10.一种双特异性抗体或其抗原结合片段，其包括：a)重链序列，所述重链序列与选自由表2和7到9中列出的序列组成的组的重链序列具有至少约95％同一性；和/或b)轻链序列，所述轻链序列与选自由表2和7到9中列出的序列组成的组的轻链序列具有至少约95％同一性。11.一种双特异性抗体或其抗原结合片段，其包括：a)一个、两个或三个重链CDR序列，所述重链CDR序列各自与选自由表2和7到9中列出的序列组成的组的重链CDR序列具有至少约95％同一性；和/或b)一个、两个或三个轻链CDR序列，所述轻链CDR序列各自与选自由表2和7到9中列出的
序列组成的组的轻链CDR序列具有至少约95％同一性。12.一种双特异性抗体或其抗原结合片段，其包括：a)重链序列，所述重链序列选自由表2和7到9中列出的序列组成的组；和/或b)轻链序列，所述轻链序列选自由表2和7到9中列出的序列组成的组。13.一种双特异性抗体或其抗原结合片段，其包括：a)一个、两个或三个重链CDR序列，所述重链CDR序列各自选自由表2和7到9中列出的序列组成的组；和/或b)一个、两个或三个轻链CDR序列，所述轻链CDR序列各自选自由表2和7到9中列出的序列组成的组。14.根据权利要求10到13中任一项所述的双特异性抗体或其抗原结合片段，其中所述双特异性抗体或其抗原结合片段是嵌合的、人源化的、复合的、鼠的或人的。15.根据权利要求10到14中任一项所述的双特异性抗体或其抗原结合片段，其中所述双特异性抗体或其抗原结合片段：(a)经可检测标记；(b)与细胞毒性药剂，任选地化学治疗剂、生物药剂、毒素和/或放射性同位素缀合；(c)包括效应结构域；(d)包括Fc结构域；和/或(e)选自由以下组成的组：Fv、Fav、F(ab')2)、Fab'、dsFv、scFv、sc(Fv)2和双抗体片段。16.根据权利要求10到15中任一项所述的双特异性抗体或其抗原结合片段，其中所述双特异性抗体或其抗原结合片段能从以保藏登记号______保藏的杂交瘤______获得。17.根据权利要求10到16中任一项所述的双特异性抗体或其抗原结合片段，其中所述双特异性抗体或其抗原结合片段抑制(a)HHLA2与KIR3DL3的结合和(b)PD
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1与PD
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L1和/或PD
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L2的结合。18.根据权利要求10到17中任一项所述的双特异性抗体或其抗原结合片段，其中所述双特异性抗体或其抗原结合片段与KIR3DL3和PD
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1特异性结合。19.根据权利要求10到18中任一项所述的双特异性抗体或其抗原结合片段，其中所述双特异性抗体或其抗原结合片段包括：a)表9中列出的重链序列；和/或b)表9中列出的轻链序列。20.一种免疫球蛋白重链和/或免疫球蛋白轻链，其选自由表2和7到9中列出的免疫球蛋白重链和免疫球蛋白轻链序列组成的组。21.一种分离的核酸分子，其(a)编码根据权利要求1到20中任一项所述的免疫球蛋白重链、免疫球蛋白轻链和/或抗体或其抗原结合片段；和/或(b)在严格条件下与以下杂交：编码选自由表2和7到9中列出的多肽序列组成的组的多肽的核酸的补体或与编码选自由表2和7到9中列出的多肽序列组成的组的多肽的核酸具有至少约95％同源性的序列。22.一种载体，其包括根据权利要求21所述的分离的核酸。23.一种宿主细胞，其包括根据权利要求21所述的分离的核酸，包括根据权利要求22所述的载体，表达根据权利要求1到19中任一项所述的抗体或其抗原结合片段或者能以保藏登记号______获得。24.一种装置或试剂盒，其包括至少一种根据权利要求1到19中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，所述装置或试剂盒任选地包括用于检测所述至少一种抗体或其抗原结合片段或包括所述抗体或其抗原结合片段的复合物的标记。
25.一种产生至少一种根据权利要求1到19中任一项所述的抗体或其抗原结合片段的方法，所述方法包括以下步骤：(i)在适于允许所述抗体或其抗原结合片段的表达的条件下培养已被核酸转化的经转化宿主细胞，所述核酸包括编码至少一种根据权利要求1到19中任一项所述的抗体的序列；和(ii)回收所表达的抗体或其抗原结合片段。26.一种检测KIR3DL3多肽的存在或水平的方法，所述方法包括通过使用至少一种根据权利要求1到19中任一项所述的抗体或其抗原结合片段来在样品中检测所述多肽。27.根据权利要求26所述的方法，其中所述至少一种抗体或其抗原结合片段与KIR3DL3多肽形成复合物，并且所述复合物是以以下形式检测的：酶联免疫吸附测定(ELISA)、放射免疫测定(RIA)、免疫化学方式、蛋白质印迹或使用细胞内流动测定。28.一种预测对靶向KIR3DL3的疗法的应答性的方法，所述方法包括：a)使用至少一种根据权利要求1到19中任一项所述的抗体或其抗原结合片段测定受试者样品中的KIR3DL3和/或HHLA2的水平；b)使用所述至少一种抗体或其抗原结合片段测定来自至少一个对照受试者的样品中的KIR3DL3和/或HHL...

【专利技术属性】
技术研发人员：G，
申请(专利权)人：丹娜法伯癌症研究院，
类型：发明
国别省市：