用于预防或治疗病毒和其它微生物感染的组合物制造技术

本申请涉及用于预防或治疗病毒和其它微生物感染的组合物。在一些实施例中，本申请提供了包含特异性地结合至通过黏膜感染的病原体的靶结合部分和带正电荷的黏膜粘附肽片段的嵌合蛋白。还提供了特异性地结合至SARS

【技术实现步骤摘要】
用于预防或治疗病毒和其它微生物感染的组合物
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2020年10月16日提交的美国临时申请第63/093,076号、2020年11月25日提交的美国临时申请第63/118,570号和2020年12月7日提交的美国临时申请第63/122,432号的优先权，其通过引用以其整体并入本文。
[0003]在ASCII文本文件上提交序列列表
[0004]以下提交的ASCII文本文件的内容通过引用以其整体并入本文：序列表的计算机可读形式(CRF)(文件名：750042001842SEQLIST.TXT，记录日期：2021年10月8日，大小：138,775字节)。


[0005]本专利技术涉及用于预防或治疗病毒感染和其它微生物感染例如冠状病毒感染的组合物和方法。

技术介绍

[0006]呼吸道微生物感染(包括病毒感染和细菌感染)是全球成人和儿科疾病和死亡的主要原因。对更有效地针对这些感染的新型治疗和预防方法的大量需求尚未得到满足。SARS
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CoV
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2感染(导致COVID
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19的病毒)的快速传播和高发病率和死亡率已在2020年对人类健康和经济造成了严重的影响。随着社会活动和社会迁移的增加导致病毒传播的发生率增加，SARS
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CoV
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2感染病例和住院人数激增。SARS
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CoV
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2感染主要通过被感染的人说话、打喷嚏或咳嗽时的呼吸道飞沫在人与人之间传播。传染性飞沫可以落入附近人的嘴巴或鼻子中或者可能被吸入肺中，其中上呼吸道黏膜表面是病毒感染的最初部位和主要部位。此外，病毒的空气传播可以通过气溶胶颗粒发生，这些气溶胶颗粒在空气中停留更长的时间段，并且可以比飞沫更远离其来源行进。面罩正在被用作第一道防线，但它们对于感染来说是被动屏障，并且其功效并不完善。治疗性发现和预防工作对于阻止SARS
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CoV
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2的大流行传播是必要的。
[0007]用于COVID
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19治疗的治疗性药物开发包括小分子药物候选物和大分子(例如抗体)药物候选物。尽管目前没有经批准的治疗性抗体，但许多靶向SARS
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CoV
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2刺突(S)蛋白的受体结合结构域(RBD)的中和抗体正在临床试验中。矛盾的是，此类抗体可能经由感染的抗体依赖性增强(ADE)使病毒进入，这在使用治疗性抗体时是值得关注的重要问题。当抗体促进病毒进入宿主细胞并增强这些细胞中的病毒感染时，就发生了ADE。已经观察到许多病毒的ADE。靶向一种血清型病毒但仅亚中和另一种病毒的抗体通常导致后一种病毒的ADE。ADE对病毒流行病学，尤其是通过密切相关病毒亚型的继发性感染，以及疫苗开发和针对病毒感染的基于抗体的疗法具有重大影响。参见Eroshenko,N等人,2020,自然生物技术(Nat.Biotechnol.)38:789
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791。
[0008]当前用于COVID
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19的药物预防策略集中在SARS
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CoV
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2疫苗的开发；然而，此类疫苗方法可能受到病毒基因突变和ADE概率的影响。因此，迫切需要预防SARS
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CoV
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2感染的安
全且灵活的方法。还需要此类方法来预防其它呼吸道微生物感染。

技术实现思路

[0009]本申请提供了用于预防或治疗由通过个体中的黏膜感染的病原体引起的感染(例如冠状病毒(例如，SARS
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CoV
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2)感染)的组合物和方法。因此，本申请的一个方面提供了一种嵌合蛋白，其包含：(a)靶结合部分，其特异性地结合至通过黏膜(例如，鼻通道)感染的病原体(例如，SARS
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CoV、SARS
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CoV
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2，包括其变体)的组分；和(b)包含约5至约50个带正电荷的氨基酸残基的黏膜粘附肽片段，其中黏膜粘附肽片段促进嵌合蛋白与黏膜的附着。
[0010]在根据上述嵌合蛋白中任一种的一些实施例中，嵌合蛋白包含单个多肽链。在一些实施例中，嵌合蛋白包含两条或更多条多肽链。在一些实施例中，嵌合蛋白包含两个或更多个黏膜粘附肽片段。在一些实施例中，两个或更多个黏膜粘附肽片段中的每一个包含约5至约50个带正电荷的氨基酸残基。在一些实施例中，黏膜粘附肽片段或两个或更多个黏膜粘附肽片段中的每一个包含约6至约30个，约5至约50个带正电荷(例如，约6
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30个，如12个)的氨基酸残基。在一些实施例中，嵌合蛋白包含两个或更多个黏膜粘附肽片段，其中两个或更多个黏膜粘附肽片段中的每一个包含约11至约15个带正电荷的氨基酸残基。
[0011]在根据上述嵌合蛋白中任一种的一些实施例中，黏膜粘附肽片段包含约6至约30个带正电荷的氨基酸残基，其中带正电荷的氨基酸残基选自由赖氨酸、精氨酸、组氨酸、鸟氨酸及其组合组成的群组。在一些实施例中，带正电荷的氨基酸残基是赖氨酸残基。在一些实施例中，黏膜粘附肽片段包含约6至约30个(例如，6、12、24或30个)赖氨酸残基。在一些实施例中，带正电荷的氨基酸残基是精氨酸残基。在一些实施例中，黏膜粘附肽片段包含约6至约30个(例如，6、12、24或30个)精氨酸残基。在一些实施例中，带正电荷的氨基酸残基是组氨酸残基。在一些实施例中，黏膜粘附肽片段包含约6至约30个(例如，6、12、24或30个)组氨酸残基。在一些实施例中，带正电荷的氨基酸残基是鸟氨酸残基。在一些实施例中，黏膜粘附肽片段包含约6至约30个(例如，6、12、24或30个)鸟氨酸残基。
[0012]在根据上述嵌合蛋白中任一种的一些实施例中，带正电荷的氨基酸残基彼此邻接。在一些实施例中，带正电荷的氨基酸残基间散布有不带正电荷的氨基酸残基。在一些实施例中，黏膜粘附肽片段中至少50％的氨基酸残基是带正电荷的氨基酸残基。在一些实施例中，黏膜粘附肽片段不超过约15kD。
[0013]在根据上述嵌合蛋白中任一种的一些实施例中，黏膜粘附肽片段的等电点(pI)高于黏膜的pH。
[0014]在根据上述嵌合蛋白中任一种的一些实施例中，嵌合蛋白在黏膜上的半衰期为至少12小时。在一些实施例中，嵌合蛋白在黏膜上的半衰期为至少24小时。
[0015]在根据上述嵌合蛋白中任一种的一些实施例中，黏膜粘附肽片段不促进嵌合蛋白渗透到黏膜的细胞中。
[0016]在根据上述嵌合蛋白中任一种的一些实施例中，黏膜粘附肽片段不破坏嵌合蛋白在表达嵌合蛋白的宿主细胞内的折叠。
[0017]在根据上述嵌合蛋白中任一种的一些实施例中，黏膜粘附肽片段不干扰靶结合部分与病原体的组分之间的特异性结合。
[0018]在根据上述嵌合蛋白中任一种的一些实施例中，黏膜粘附肽片段与靶结合部分共
价地融合。在一些实施例中，本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种嵌合蛋白，其包含：(a)包含特异性地结合至通过黏膜感染的病原体的组分的抗体部分的靶结合部分；和(b)包含约5至约50个带正电荷的氨基酸残基的黏膜粘附肽片段，其中所述黏膜粘附肽片段促进所述嵌合蛋白与所述黏膜的附着。2.根据权利要求1所述的嵌合蛋白，其中所述带正电荷的氨基酸残基选自由赖氨酸、精氨酸、组氨酸、鸟氨酸及其组合组成的群组。3.根据权利要求1所述的嵌合蛋白，其中所述带正电荷的氨基酸残基是赖氨酸或组氨酸。4.根据权利要求1所述的嵌合蛋白，其中所述病原体是选自由SARS
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CoV、SARS
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CoV
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2和MERS
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CoV或其变体组成的群组的病毒。5.根据权利要求4所述的嵌合蛋白，其中所述病原体的所述组分是刺突(S)蛋白。6.根据权利要求1所述的嵌合蛋白，其中所述抗体部分包含抗体重链可变区(VH)，所述抗体重链可变区包含了包含SEQ ID NO:37的氨基酸序列的重链互补决定区HC
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CDR1、包含SEQ ID NO:38的氨基酸序列的HC
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CDR2和包含SEQ ID NO:39的氨基酸序列的HC
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CDR3；和轻链可变区，所述轻链可变区包含了包含SEQ ID NO:40的氨基酸序列的轻链互补决定区LC
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CDR 1、包含SEQ ID NO:41的氨基酸序列的LC
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CDR2和包含SEQ ID NO:42的氨基酸序列的LC
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CDR3。7.根据权利要求6所述的嵌合蛋白，其中所述抗体部分包含VH和VL，所述VH包含与SEQ ID NO:75的氨基酸序列具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列，所述VL包含与SEQ ID NO:76的氨基酸序列具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。8.一种药物组合物，其包含根据权利要求1至7中任一权利要求所述的嵌合蛋白和药学上可接受的载剂。9.根据权利要求8所述的药物组合物，其包含多种嵌合蛋白，其中所述嵌合蛋白的靶结合部分彼此不同。10.根据权利要求8所述的药物组合物，其中所述药学上可接受的载剂：(i)包含约0.05％至约0.2％(w/w)的甲硫氨酸；(ii)具有约4.5至约7.5的pH；(iii)包含约20mM至约50mM的柠檬酸盐；(iv)包含约100mM至约150mM的NaCl；(v)包含约0.01％至约0.1％(w/w)的聚山梨酯80；(vi)包含约1％至约10％(w/w)的甘油；和/或(vii)包含约0.05％至约0.2％(w/w)的山梨酸钾。11.根据权利要求8所述的药物组合物，其中所述药物组合物用于鼻施用。12.一种编码根据权利要求1至7中任一权利要求所述的嵌合蛋白的分离的核酸或一组分离的核酸。13.一种宿主细胞，其包含根据权利要求12所述的核酸或一组核酸。14.一种根据权利要求1至7中任一权利要求所述的嵌合蛋白在制备用于预防或治疗个体中由通过黏膜感染的病原体引起的感染的药物的用途。15.根据权利要求14所述的用途，其中所述病原体是ARS
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CoV
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2或其变体。16.根据权利要求15所述的用途，其中所述SARS
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CoV
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2或其变体选自由WIV4、B.1.1.7
变体、B.1.351变体、B.1.526变体、B1.526.1变体、B1.617变体、B.1.617.1变体、B.1.617.2变体、B1.617.3变体、P.2变体、P.1变体、A.23.1变体、CAL.20C变体、B.1.427变体、B.1.429变体、B.1.525变体和P.1.351变体组成的群组。17.一种分离的抗体或其抗原结合片段，其包含：(1)VH，所述VH包含了包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列的HC
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CDR1、包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的HC
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CDR2和包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列的HC
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CDR3；VL，所述VL包含了包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列的LC
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CDR1、包含SEQ ID NO:5的氨基酸序列的LC
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CDR2和包含SEQ ID NO:6的氨基酸序列的LC
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CDR3；(2)VH，所述VH包含了包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列的HC
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CDR1、包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列的HC
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CDR2和包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列的HC
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CDR3；VL，所述VL包含了包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列的LC
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CDR1、包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列的LC
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CDR2和包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列的LC
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CDR3；(3)VH，所述VH包含了包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列的HC
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CDR1、包含SEQ ID NO:14的氨基酸序列的HC
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CDR2和包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列的HC
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CDR3；VL，所述VL包含了包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列的LC
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CDR1、包含SEQ ID NO:17的氨基酸序列的LC
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CDR2...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘诚，张红兵，杨智源，向京宜，崔自由，刘建英，
申请(专利权)人：优瑞科生物技术公司，
类型：发明
国别省市：