一种用于纳米孔测序建库的位置锚定条码系统技术方案

本申请涉及一种用于纳米孔测序建库的位置锚定条码系统、制备方法及其应用。本申请所述位置锚定条码系统具有更高分辨率，更高分类准确度，能够显著降低鉴定假阳性率，从整体上提高纳米孔测序精度，降低测序成本。

【技术实现步骤摘要】
一种用于纳米孔测序建库的位置锚定条码系统
本专利技术涉及基因测序领域，具体涉及一种用于纳米孔测序建库的位置锚定条码系统。
技术介绍
当下全球临床感染患者众多且感染源种类繁多，在中国，感染性疾病甚至占全部疾病总发病数的49％。目前常规的临床诊断方法是医生的经验性判断加上镜检，生化分析等确定症状的感染源，但人为因素，检测周期以及检测范围的限制极易造成误检和漏判，尤其不利于急性感染的诊治。随着高通量测序和基因组学的蓬勃发展，宏基因组测序技术因其可以快速全面客观地鉴定样本中微生物的组成，在感染诊断领域蒸蒸日上，其愈发广泛地应用于感染病原微生物的检测，为临床决策和后续用药提供了更精准的诊断基础。Illumina二代测序在国内发展如火如荼，但应用于微生物检测存在以下问题：首先，二代测序的读长短，均在几百bp以下，而微生物不同种属间会存在较高的同源序列，造成宏基因组物种分析的准确度差，在数据报告中反馈无关的微生物信息，反而给医生造成更大的诊断干扰；其次，更深层次的致病基因及耐药基因的鉴定需要对测序序列进行组装拼接，因而复杂的分析需要更高的时间和资金成本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于纳米孔测序建库的位置锚定条码系统，其特征在于，所述系统包括如下结构：/n[BARCODE-ANCHOR]

【技术特征摘要】
1.一种用于纳米孔测序建库的位置锚定条码系统，其特征在于，所述系统包括如下结构：
[BARCODE-ANCHOR]n-BARCODEn+1
其中，n≥1，
所述BARCODE为条码序列，
所述ANCHOR为锚定序列。


2.权利要求1所述的位置锚定条码系统，其特征在于，所述1≤n≤10；优选的，所述n为1，2或3。


3.权利要求2所述的位置锚定条码系统，其特征在于，所述结构为
FLANK1-[BARCODE-ANCHOR]n-BARCODEn+1-FLANK2，
所述FLANK为侧翼序列。


4.权利要求2或3任一所述的位置锚定条码系统，其特征在于，所述BARCODE序列相同或者不同；优选的，所述BARCODE序列不同。


5.权利要求2-4任一所述的位置锚定条码系统，其特征在于，所述ANCHOR序列相同或者不同；优选的，所述ANCHOR序列不同。


6.权利要求2-5任一所述的位置锚定条码系统，其特征在于，所述ANCHOR序列长度为5-50bp；优选的，所述ANCHOR序列长度为10-35bp。


7.权利要求2-6任一所述的位置锚定条码系统，其特征在于，所述ANCHOR序列与BARCODE序列的同源性＜70％；优选的，所述ANCHOR序列与BARCODE序列的同源性＜50％。


8.权利要求2-6任一所述的位置锚定条码系统，其特征在于，所述结构为如下任意一个：
FLANK1-BARCODE1-ANCHOR1...

【专利技术属性】
技术研发人员：戴岩，胡龙，张烨，肖念清，任用，
申请(专利权)人：江苏先声医学诊断有限公司，北京先声医学检验实验室有限公司，
类型：发明
国别省市：江苏;32