长链非编码RNA的测序文库构建方法及其应用技术

技术编号:24792850 阅读:31 留言:0更新日期:2020-07-07 20:10
本发明专利技术公开了长链非编码RNA的测序文库构建方法及其应用。其中,该长链非编码RNA的测序文库构建方法包括:对所述待测样本进行去除rRNA处理,以便得到去除rRNA的产物;基于所述去除rRNA的产物进行逆转录处理,以便得到单链DNA,其中,所述逆转录处理的引物具有SEQ ID NO:1所示的序列;将所述单链DNA进行第一扩增处理,以便得到双链DNA;将所述双链DNA进行片段化处理,以便得到DNA片段;以及将所述DNA片段进行第二扩增处理,所述第二扩增的产物构成所述测序文库。该方法先通过rRNA去除探针去除rRNA,再进行逆转录,避免了大量的rRNA对mRNA和lncRNA逆转录的影响,并且,利用rRNA去除探针去除rRNA,rRNA的去除率高,方法的稳定性好。

【技术实现步骤摘要】
长链非编码RNA的测序文库构建方法及其应用
本专利技术涉及生物
,特别是基因测序领域。具体地,本专利技术涉及长链非编码RNA的测序文库构建方法及其应用。更具体地,本专利技术涉及长链非编码RNA的测序文库构建方法,和对长链非编码RNA进行测序的方法。
技术介绍
全基因组范围内的转录组分析被广泛应用,早期的方法是从大量的组织样品中获取RNA进行测序。但此传统方法依赖于一次性总体分析数百万个细胞的基因表达,往往会掩盖特异组织中某些特化细胞具有生物学意义的基因表达差异。并且,在健康组织或肿瘤等病变组织中,某些细胞的数量稀少,除了单细胞方法没有任何其他的技术能够对它们进行分析。单细胞基因表达分析则克服了这些局限,可用于在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。与活细胞成像系统相结合,单细胞转录组分析更有助于深入理解细胞分化、细胞重编程及转分化等过程及相关的基因调节网络。将此技术应用于临床,理论上可以在生理或病理情况下连续追踪基因表达的动力学变化,从而监测疾病的进展。单细胞转录组分析的另一应用本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种长链非编码RNA的测序文库构建方法,其特征在于,包括:/n对待测样本进行去除rRNA处理,以便得到去除rRNA的产物,其中,所述去除处理是利用rRNA去除探针进行的;/n基于所述去除rRNA的产物进行逆转录处理,以便得到单链DNA,其中,所述逆转录处理的引物具有SEQ ID NO:1所示的序列;/n将所述单链DNA进行第一扩增处理,以便得到双链DNA;/n将所述双链DNA进行片段化处理,以便得到DNA片段;以及/n将所述DNA片段进行第二扩增处理,所述第二扩增的产物构成所述测序文库。/n

【技术特征摘要】
20181229 CN 201811639997X1.一种长链非编码RNA的测序文库构建方法,其特征在于,包括:
对待测样本进行去除rRNA处理,以便得到去除rRNA的产物,其中,所述去除处理是利用rRNA去除探针进行的;
基于所述去除rRNA的产物进行逆转录处理,以便得到单链DNA,其中,所述逆转录处理的引物具有SEQIDNO:1所示的序列;
将所述单链DNA进行第一扩增处理,以便得到双链DNA;
将所述双链DNA进行片段化处理,以便得到DNA片段;以及
将所述DNA片段进行第二扩增处理,所述第二扩增的产物构成所述测序文库。


2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述去除rRNA处理包括:
将所述待测样本与rRNA去除探针进行杂交处理,以便得到杂交产物;
利用RNaseH去除所述杂交产物中的rRNA;以及
利用DNaseI去除所述杂交产物中的DNA。


3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述杂交处理是利用PCR进行的,所述杂交处理的条件是95℃,2分钟;95-22℃,0.1℃/秒;22℃,5分钟。


4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述rRNA去除探针的长度...

【专利技术属性】
技术研发人员:潘伟业韩典霖陈雪李大为玄兆伶王海良王娟肖飞
申请(专利权)人:浙江安诺优达生物科技有限公司安诺优达基因科技北京有限公司
类型:发明
国别省市:浙江;33

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