一种单细胞基因组目标区域捕获的方法技术

技术编号:21507910 阅读:42 留言:0更新日期:2019-07-03 06:54
本发明专利技术涉及一种单细胞基因组目标区域捕获的方法。具体的通过对单细胞基因组进行全基因组扩增,对扩增后的基因组进行打断、末端修复、3'端加A、加接头、PCR扩增、目标区域捕获、对目标区域捕获的DNA片段进行PCR扩增及测序。通过本发明专利技术提供的方法可以提高捕获测序结果的覆盖度,提高捕获结果的特异性。

A Method for Capturing Target Region of Single Cell Genome

【技术实现步骤摘要】
一种单细胞基因组目标区域捕获的方法
本专利技术涉及一种单细胞基因组目标区域捕获的方法,属于基因检测

技术介绍
单细胞测序在2011年被《NatureMethods》列为年度值得期待的技术之一,在2013年被《Science》列为年度最值得关注的六大领域榜首,其越来越受到科研工作者的青睐,相关的研究成果也井喷式地发表在各顶级期刊上,这些都表明,单细胞测序已逐渐成为科研热点。单细胞测序技术可以剖析细胞的异质性,揭示肿瘤细胞基因组中发生的变异。有助于我们描述肿瘤细胞的克隆结构,并追踪疾病的进展和扩散范围。目前该技术已广泛地应用在辅助生殖、癌症、神经学和免疫学等领域。单细胞目标区域捕获测序是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增,获得高覆盖率的完整的基因组之后定制目标基因组区域的探针,与基因组DNA进行杂交,将目标区域DNA富集后进行高通量测序的技术手段。单细胞目标区域测序技术用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系,也有助于发现和验证疾病特别是癌症的相关候选基因或相关位点,在临床诊断和药物开发方面有着巨大的应用潜力[1]。目标区域捕获测序的优势在于只对感兴趣的基因组区域进行研究,本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种单细胞基因组目标区域捕获的方法,包括:步骤A:采用多重置换扩增方法对单细胞基因组进行等温扩增,获得扩增后的基因组;步骤B:取3μg扩增后的基因组进行打断,获得片段化的DNA片段;步骤C:将片段化的DNA片段进行末端修复,获得平末端DNA片段;步骤D:将平末端DNA片段进行3'端加A,获得3'端加A的DNA片段;步骤E:将3'端加A的DNA片段进行加接头,获得加接头的DNA片段;步骤F:将加接头的DNA片段进行PCR扩增,获得扩增的DNA片段;步骤G:将扩增的DNA片段进行目标区域捕获,获得捕获的DNA片段;步骤H:将捕获的DNA片段进行PCR扩增,获得PCR扩增产物;步骤I:将PCR扩...

【技术特征摘要】
2017.12.26 CN 20171143145061.一种单细胞基因组目标区域捕获的方法,包括:步骤A:采用多重置换扩增方法对单细胞基因组进行等温扩增,获得扩增后的基因组;步骤B:取3μg扩增后的基因组进行打断,获得片段化的DNA片段;步骤C:将片段化的DNA片段进行末端修复,获得平末端DNA片段;步骤D:将平末端DNA片段进行3'端加A,获得3'端加A的DNA片段;步骤E:将3'端加A的DNA片段进行加接头,获得加接头的DNA片段;步骤F:将加接头的DNA片段进行PCR扩增,获得扩增的DNA片段;步骤G:将扩增的DNA片段进行目标区域捕获,获得捕获的DNA片段;步骤H:将捕获的DNA片段进行PCR扩增,获得PCR扩增产物;步骤I:将PCR扩增产物进行测序;其中,所述步骤A中等温扩增的条件为30℃反应2小时;所述步骤F中PCR扩增的循环数为4~6个循环;所述步骤G中目标区域捕获的条...

【专利技术属性】
技术研发人员:洪燕惠峰玄兆伶李大为梁峻彬陈重建
申请(专利权)人:安诺优达基因科技北京有限公司
类型:发明
国别省市:北京,11

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