一种非整倍体及拷贝数变异无创产前检测试剂、装置及应用制造方法及图纸

技术编号:41720512 阅读:22 留言:0更新日期:2024-06-19 12:46
本发明专利技术公开了一种非整倍体及拷贝数变异无创产前检测试剂,包含核酸提取富集试剂、建库试剂和测序试剂。可实现在高浓度盐离子酸性溶液体系下,使游离DNA与羟基结合部结合获得全部游离DNA和在碱性条件下使含有羧基结合部的液相与结合有游离DNA片段的羟基结合部的固相部分进行混合孵育,去除核酸大片段。从而实现以孕妇血浆为样本起始,稳定高效的获得胎儿游离DNA占比提升的游离DNA提取产物并构建测序文库上机测序,通过对测序数据分析,可高稳定的降低所得非整倍体及拷贝数变异无创产前检测结果的降低假阳性、假阴性检出率。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物,特别是基因测序领域。具体地,本专利技术涉及一种非整倍体及拷贝数变异无创产前检测试剂、装置及应用,可用于非整倍体及拷贝数变异无创产前检测。


技术介绍

1、无创产前dna检测技术(non-invasive prenatal testing,nitp)是一种基于孕妇外周血血浆中胎儿来源游离dna(cffdna)的新型产前筛查技术。主要筛查疾病包括唐氏综合征(t21)、爱德华氏综合征(t18)、帕陶氏综合征(t13)、性染色体非整倍体及部分染色体拷贝数变异。该技术通过采集孕妇静脉血,分离血浆并提取血浆中的游离dna(即cfdna)制备测序文库,借助于高通量基因测序方法进行深度测序,同时结合生物信息学分析技术,评估胎儿患染色体异常疾病的风险。目前,无创产前基因检测已经在临床上广泛应用,降低了孕妇因过度的侵入性产前诊断而导致的流产风险,同时提高了胎儿染色体非整倍体疾病的检出率,降低了检测的假阳性率。此外,nipt还应用于单基因遗传病检测,可直接检测胎儿是否携带致病基因;同时,还可以应用在染色体微缺失/微重复检测方面。染色体微缺失/微重复是除染色体非本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种非整倍体及拷贝数变异无创产前检测试剂,包含核酸提取富集试剂、建库试剂和测序试剂,其特征在于,所述核酸提取富集试剂包含羟基结合部、羧基结合部;所述羟基结合部为带有羟基修饰集团的核酸结合载体;所述羧基结合部为带有羧基修饰基团的核酸结合载体。

2.根据权利要求1所述的试剂,其特征在于,所述羟基结合部为羟基结合部为羟基磁珠、硅醇基磁珠、羟基玻璃珠中的任一种或多种;所述羧基结合部为羧基磁珠、羧基玻璃珠中的任一种或两种;优选地,所述羟基结合部为羟基磁珠;所述羧基结合部为羧基磁珠。

3.根据权利要求2所述的试剂,其特征在于,所述羟基磁珠为包含20~80mg/ml羟基修饰...

【技术特征摘要】

1.一种非整倍体及拷贝数变异无创产前检测试剂,包含核酸提取富集试剂、建库试剂和测序试剂,其特征在于,所述核酸提取富集试剂包含羟基结合部、羧基结合部;所述羟基结合部为带有羟基修饰集团的核酸结合载体;所述羧基结合部为带有羧基修饰基团的核酸结合载体。

2.根据权利要求1所述的试剂,其特征在于,所述羟基结合部为羟基结合部为羟基磁珠、硅醇基磁珠、羟基玻璃珠中的任一种或多种;所述羧基结合部为羧基磁珠、羧基玻璃珠中的任一种或两种;优选地,所述羟基结合部为羟基磁珠;所述羧基结合部为羧基磁珠。

3.根据权利要求2所述的试剂,其特征在于,所述羟基磁珠为包含20~80mg/ml羟基修饰磁珠的羟基磁珠悬浮液;优选地,所述羟基磁珠为包含30~60mg/ml羟基修饰磁珠的羟基磁珠悬浮液。

4.根据权利要求2所述的试剂,其特征在于,所述羧基磁珠为含有peg和盐离子的碱性的羧基磁珠悬浮液;优选地,所述羧基磁珠悬浮液中peg选自peg6000~20000任一种或多种的组合;优选地,所述羧基磁珠悬浮液中peg选自peg8000~15000任一种或多种的组合;优选地,所述羧基磁珠悬浮液,其组成包含0.05~2重量%的羧基修饰磁珠,10~20重量%的peg6000~20000,1~4m的nacl,1~100mm的tris-hcl,以及0.1~10mm的edta,ph值为6.0~9.0;优选地,所述羧基磁珠悬浮液,其组成包含0.5~1.5重量%的羧基修饰磁珠,12~18重量%的peg10000,1~3m的nacl,1~50mm的tris-hcl,以及0.1~5mm的edta,ph值为7.0~9.0。

5.根据权利要求1所述的试剂,其特征在于,所述核酸提取富集试剂还包含结合液;所述结合液为高浓度盐离子酸性溶液体系;优选地,所述结合液含有高浓度离液盐;优选地,所述高浓度离液盐,包含碘化钠、高氯酸钠、盐酸胍、异硫氰酸胍中的任一种或多种;优选地,所述高浓度离液盐,包含盐酸胍、异硫氰酸胍任一种或多种;优选地,所述结合液含有4~6m异硫氰酸胍,0.5~2m盐酸胍;优选地,所述结合液含有4.5~5.5m异硫氰酸胍,0.8~1.5m盐酸胍;优选地,所述结合液还含有表面活性剂、tris、edta;所述表面活性剂为非离子型表面活性剂;优选地,所述非离子型表面活性剂为tween20、triton-x100、sds、np40和聚氧乙烯中的一种或多种;优选地,所述结合液含有异硫氰酸胍、盐酸胍、tritonx-100、tris-hcl、edta;优选地,所述结合液含有4~6m异硫氰酸胍,0.5~2m盐酸胍,1~4重量% tritonx-100,50~100mm tris-hcl,ph5~6,5~10mm edta;优选地,所述结合液含有4.5~5.5m异硫氰酸胍,0.8~1.5m盐酸胍,2~3重量% tritonx-100,50~80mm tris-hcl,ph5~6,5~8mm edta。

6.根据权利要求1所述的试剂,其特征在于,所述核酸提取富集试剂,还包含第二羧基结合部;所述第二羧基结合部为带有羧基修饰基团的核酸结合载体;优选地,所述第二羧基结合部为羧基磁珠、羧基玻璃珠中的任一种或两种;优选地,所述第二羧基结合部为羧基磁珠。

7.根据权利要求6所述的试剂,其特征在于,所述羧基磁珠部为含有peg和盐离子碱性的第二羧基磁珠悬浮液;所述第二羧基磁珠悬浮液中的peg和盐离子浓度大于羧基磁珠悬浮液;优选地,所述第二羧基磁珠悬浮液中peg选自peg6000~20000任一种或多种的组合;优选地,所述第二羧基磁珠悬浮液中peg选自peg8000~15000任一种或多种的组合;优选地,所述第二羧基磁珠悬浮液,其组成包括0.05~2重量%的羧基修饰磁珠,15~30重量%的peg6000~20000,1~4m的nacl,1~100mm的tris-hcl,以及0.1...

【专利技术属性】
技术研发人员:姜锋朱穆真李世姣张介中王娟李志民
申请(专利权)人:安诺优达基因科技北京有限公司
类型:发明
国别省市:

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