检测IL-28B基因单核苷酸多态性的荧光原位杂交测序方法技术

本发明专利技术公开了一种检测IL‑28B基因单核苷酸多态性的荧光原位杂交测序方法，所述方法包括提取待测样本的DNA，并以DNA为模板进行单链化衍生，然后同时加入不同荧光标记的第一测序探针和第二测序探针与单链化衍生物进行杂交，最后对杂交结果进行判读。该方法精准性高，稳定性好，快速，安全，易自动化操作。所述方法可在一个单链化衍生和杂交反应循环中完成对单核苷酸多态性的精准分型，从而了解受试者的基因型，达到对危险因素引起疾病的预防及临床上个体化用药的指导。

Detection of single nucleotide polymorphism of IL-28B gene by fluorescence in situ hybridization

The invention discloses a fluorescence in situ hybridization (FISH) sequencing method for detecting single nucleotide polymorphism of IL 28B gene. The method includes extracting DNA from the sample to be tested, single-stranded derivation using DNA as template, and then hybridization with single-stranded derivatives by adding the first and second sequencing probes with different fluorescence labels. Finally, the hybridization results are interpreted. The method is accurate, stable, fast, safe and easy to operate automatically. The method can accurately classify single nucleotide polymorphisms in a single-stranded derivation and hybridization reaction cycle, so as to understand the genotype of the subjects, and to achieve the prevention of diseases caused by risk factors and the guidance of clinical individualized drug use.

【技术实现步骤摘要】
检测IL-28B基因单核苷酸多态性的荧光原位杂交测序方法
本专利技术公开了一种单核苷酸多态性的检测方法，属于分子遗传学领域。
技术介绍
随着医药科学发展的不断进步，全世界每年有很多的药物出现，因不良反应太大而在药物研究中被淘汰。虽然药物的效果和不良反应与人种及个体差异有关，但人与人之间基因组序列的遗传差异是药物疗效和不良反应的重要原因。单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphisms；SNP)就是人与人之间1个碱基之间的差异，基因组序列差异有好几种，SNP仅是最常见最普通的一种，在临床上意义重大。SNP是由单个碱基改变而引起的DNA序列的多态性。包括单碱基的转换，颠倒以及单碱基的插入或者缺失等。SNP在人基因组中的发生频率比较高，大约平均每1000个碱基中就有一个多态性位点，是继微卫星之后的第三代遗传标记，有些SNP位点还会影响基因的功能，从而导致生物性状改变甚至致病。SNP是人类可遗传的变异种最常见的一种，占所有已知多态性的90％以上，目前dbSNP已经收录了约500万个已验证的人类SNP数据。在遗传学分析中,SNP作为一类遗传标记得以广泛应用,主要源于这本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种检测IL‑28B基因单核苷酸多态性的荧光原位杂交测序方法，包括如下步骤：(1)提取待测样本的DNA；(2)以步骤(1)获取的DNA为模板，在dNTP、反应缓冲液、DNA切割剂存在的情况下，在寡核苷酸分子的引导下进行单链化衍生，所述寡核苷酸分子分为第一引导序列和第二引导序列，同时加入两条序列各异的测序探针，分别被定义为第一测序探针和第二测序探针，在所述两条探针的5’端分别被标记了彼此不同的荧光分子，在其3’端分别被标记了淬灭基团，所述第一引导序列、第二引导序列、第一测序探针和第二测序探针选自下列组合：SEQ ID NO：1、2、7和8；或者SEQ ID NO：3、4、9和10；或者SEQ...

【技术特征摘要】
1.一种检测IL-28B基因单核苷酸多态性的荧光原位杂交测序方法，包括如下步骤：(1)提取待测样本的DNA；(2)以步骤(1)获取的DNA为模板，在dNTP、反应缓冲液、DNA切割剂存在的情况下，在寡核苷酸分子的引导下进行单链化衍生，所述寡核苷酸分子分为第一引导序列和第二引导序列，同时加入两条序列各异的测序探针，分别被定义为第一测序探针和第二测序探针，在所述两条探针的5’端分别被标记了彼此不同的荧光分子，在其3’端分别被标记了淬灭基团，所述第一引导序列、第二引导序列、第一测序探针和第二测序探针选自下列组合：SEQIDNO：1、2、7和8；或者SEQIDNO：3、4、9和10；或者SEQIDNO：5、6、11和12；(3)对步骤(2)的单链化衍生物分别与第一测序探针和第二测序探针的杂交结果进行判读。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述第一测序探针标记的荧光分子为5-羧基荧光素,第二测序探针标记的荧光分子为六氯荧光素，所述淬灭基团为BHQ。3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤(1)所述的待测样本为血液、体液、分泌物、代谢物、脱落物或组织样本。4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述待测样本DNA模板浓度在103个/uL以上。5.根据权利要求1所述的方法，其特征...

【专利技术属性】
技术研发人员：王鹤尧，孙美娜，
申请(专利权)人：北京华夏时代生物工程有限公司，
类型：发明
国别省市：北京,11