荧光原位杂交测序检测ALDH2基因单核苷酸多态性的方法技术

技术编号:20217027 阅读:145 留言:0更新日期:2019-01-28 17:21
本发明专利技术公开了一种荧光原位杂交测序检测ALDH2基因单核苷酸多态性的方法,所述方法包括提取待测样本的DNA,并以DNA为模板进行单链化衍生,然后同时加入不同荧光标记的第一测序探针和第二测序探针与单链化衍生物进行杂交,最后对杂交结果进行判读。该方法精准性高,稳定性好,快速,安全,易自动化操作。所述方法可在一个单链化衍生和杂交反应循环中完成对单核苷酸多态性的精准分型,从而了解受试者的基因型,达到对危险因素引起疾病的预防及临床上个体化用药的指导。

【技术实现步骤摘要】
荧光原位杂交测序检测ALDH2基因单核苷酸多态性的方法
本专利技术公开了一种单核苷酸多态性的检测方法,属于分子遗传学领域。
技术介绍
随着医药科学发展的不断进步,全世界每年有很多的药物出现,因不良反应太大而在药物研究中被淘汰。虽然药物的效果和不良反应与人种及个体差异有关,但人与人之间基因组序列的遗传差异是药物疗效和不良反应的重要原因。单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphisms;SNP)就是人与人之间1个碱基之间的差异,基因组序列差异有好几种,SNP仅是最常见最普通的一种,在临床上意义重大。SNP是由单个碱基改变而引起的DNA序列的多态性。包括单碱基的转换,颠倒以及单碱基的插入或者缺失等。SNP在人基因组中的发生频率比较高,大约平均每1000个碱基中就有一个多态性位点,是继微卫星之后的第三代遗传标记,有些SNP位点还会影响基因的功能,从而导致生物性状改变甚至致病。SNP是人类可遗传的变异种最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上,目前dbSNP已经收录了约500万个已验证的人类SNP数据。在遗传学分析中,SNP作为一类遗传标记得以广泛应用,主要源于这几本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种荧光原位杂交测序检测ALDH2基因单核苷酸多态性的方法,包括如下步骤:(1)提取待测样本的DNA;(2)以步骤(1)获取的DNA为模板,在dNTP、反应缓冲液、DNA切割剂存在的情况下,在寡核苷酸分子的引导下进行单链化衍生,所述寡核苷酸分子分为第一引导序列和第二引导序列,同时加入两条序列各异的测序探针,分别被定义为第一测序探针和第二测序探针,在所述两条探针的5’端分别被标记了彼此不同的荧光分子,在其3’端分别被标记了淬灭基团,所述第一引导序列、第二引导序列、第一测序探针和第二测序探针为下列组合:SEQ ID NO:1、2、3和4;(3)对步骤(2)的单链化衍生物分别与第一测序探针和第二...

【技术特征摘要】
1.一种荧光原位杂交测序检测ALDH2基因单核苷酸多态性的方法,包括如下步骤:(1)提取待测样本的DNA;(2)以步骤(1)获取的DNA为模板,在dNTP、反应缓冲液、DNA切割剂存在的情况下,在寡核苷酸分子的引导下进行单链化衍生,所述寡核苷酸分子分为第一引导序列和第二引导序列,同时加入两条序列各异的测序探针,分别被定义为第一测序探针和第二测序探针,在所述两条探针的5’端分别被标记了彼此不同的荧光分子,在其3’端分别被标记了淬灭基团,所述第一引导序列、第二引导序列、第一测序探针和第二测序探针为下列组合:SEQIDNO:1、2、3和4;(3)对步骤(2)的单链化衍生物分别与第一测序探针和第二测序探针的杂交结果进行判读。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第一测序探针标记的荧光分子为5-羧基荧光素,第二测序探针标记的荧光分子为六氯荧光素,所述淬灭基团为BHQ。3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述的待测样本为血液、体液、分泌物、代谢物、脱落物或组织样本。4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述待测样本DNA模板浓度在103个/uL以上。5.根据权利要求1所述的方法,其特征...

【专利技术属性】
技术研发人员:王鹤尧孙美娜
申请(专利权)人:北京华夏时代生物工程有限公司
类型:发明
国别省市:北京,11

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