长链生物素标记物及其制备方法和用途技术

本发明专利技术公开长链生物素标记物及其制备方法和用途。本发明专利技术的长链生物素标记物包括生物素分子、间隔臂和反应基团。其中，生物素分子包括环状结构和戊酸侧链，间隔臂具有式(I)所示的结构，反应基团具有式(II)所示的结构，生物素分子中的戊酸侧链与间隔臂第一末端的NH连接，间隔臂的第二末端的氧与反应基团的磷结合形成O‑P键，从而将间隔臂与反应基团连接。本发明专利技术的长链生物标记物可用于基因的捕获测序。‑NH(CH2)mO‑(‑C＝O‑NH‑(CH2‑CH2O‑)4)n  式(I)

Long-chain biotin markers and their preparation methods and Applications

The invention discloses a long-chain biotin marker, a preparation method and application thereof. The long chain biotin markers of the invention include biotin molecules, spacer arms and reaction groups. Biotin molecule includes ring structure and side chain of valeric acid, spacer arm has the structure shown in formula (I), reaction group has the structure shown in formula (II), side chain of valeric acid in biotin molecule is connected with NH at the first end of spacer arm, and oxygen at the second end of spacer arm is combined with phosphorus of reaction group to form O P bond, thus connecting spacer arm with reaction group. The long-chain biomarker of the invention can be used for gene capture and sequencing. _NH(CH2)mO(C=O_NH(CH2_CH2O)4)n(I)

【技术实现步骤摘要】
长链生物素标记物及其制备方法和用途
本专利技术涉及用于基因测序的生物标记物，具体涉及用于基因测序，特别是二代测序的长链生物素标记物及其制备方法和用途。
技术介绍
二代测序在分子生物学和临床医学中起到越来越重要的作用。其中，目标区域捕获测序是二代测序应用中性价比非常高的手段，在遗传性疾病和肿瘤科学研究及临床诊断领域有着广阔的应用空间。其原理是针对感兴趣的基因组区域设计特异性的互补探针，将其与基因组DNA进行杂交，富集目标基因组区域的DNA片段，然后进行高通量测序。捕获富集的关键步骤是把生物素修饰的单链DNA作为捕获试剂，抓到基因组中感兴趣的目标区域，然后利用链霉亲合素(streptavidin，SA)和生物素的天然特异性结合能力，与SA修饰的磁珠结合，在磁场中分离出来。根据杂交时的状态可将区域捕获分为固相杂交法和液相杂交法。固相杂交法所用的探针通常都是固定在固体支持物上，例如基因芯片。杂交后先洗脱未杂交上的DNA片段，再将与探针杂交的DNA洗脱下来。现在更加流行的是液相杂交。与固相杂交最大的差异的是液相杂交在溶液中使目标DNA片段和带有生物素标记的探针直接杂交。目前采用该技术公司包括主本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种长链生物素标记物，其包括生物素分子、间隔臂和反应基团，其中，所述生物素分子包括环状结构和戊酸侧链，所述间隔臂具有式(I)所示的结构，所述反应基团具有式(II)所示的结构，所述生物素分子中的戊酸侧链与间隔臂第一末端的NH连接，所述间隔臂的第二末端的氧与所述反应基团的磷结合形成O‑P键，从而将所述间隔臂与所述反应基团连接，‑NH(CH2)mO‑(‑C＝O‑NH‑(CH2‑CH2O‑)4)n    式(I)式(I)中m和n分别独立地表示1‑10的整数，

【技术特征摘要】
1.一种长链生物素标记物，其包括生物素分子、间隔臂和反应基团，其中，所述生物素分子包括环状结构和戊酸侧链，所述间隔臂具有式(I)所示的结构，所述反应基团具有式(II)所示的结构，所述生物素分子中的戊酸侧链与间隔臂第一末端的NH连接，所述间隔臂的第二末端的氧与所述反应基团的磷结合形成O-P键，从而将所述间隔臂与所述反应基团连接，-NH(CH2)mO-(-C＝O-NH-(CH2-CH2O-)4)n式(I)式(I)中m和n分别独立地表示1-10的整数，2.根据权利要求1所述的长链生物素标记物，其中所述生物素分子受DMT基团保护。3.根据权利要求2所述的长链生物素标记物，其中所述式(I)中的m为4-8的整数，且n为1-3的整数。4.一种根据权利要求3所述的长链生物素标记物的制备方法，其包括：(1)在吡啶溶液中，使生物素和DMT-Cl反应得到中间产物A；(2)在无水二甲基甲酰胺中，使中间产物A与氨基己醇反应得到中间产物B；(3)在无水乙腈中，用氯甲酸对硝基苯酚酯活化中间产物B，之后与氨基-PEG3-醇反应得到中间产物C1，以该中间产物C1代替...

【专利技术属性】
技术研发人员：郭诚，常燕强，卢亚明，张茂华，
申请(专利权)人：伯科生物医学科技北京有限公司，
类型：发明
国别省市：北京,11