选择白血病对象的治疗方案的分析和方法技术

用于鉴定适合用CPX‑351治疗的患有癌症的对象的诊断方法包括对来自候选对象的细胞进行遗传和离体测试。CPX‑351和FLT‑3抑制剂联合治疗可改善CPX‑351摄取和毒性。

Analysis and methods of treatment options for leukemia patients

Diagnostic methods for identifying cancerous patients suitable for CPX 351 treatment include genetic and in vitro testing of cells from candidates. Combination therapy of CPX 351 and FLT 3 inhibitor can improve CPX uptake and toxicity of CPX 351.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】选择白血病对象的治疗方案的分析和方法相关申请的交叉引用本申请要求2015年11月11日提交的美国临时申请62/254,109的优先权。该文献的内容通过引用纳入本文。
本专利技术涉及癌症诊断和治疗领域。更具体地说，本专利技术涉及鉴定最佳地受益于柔红霉素和阿糖胞苷的协同脂质体组合治疗的对象。
技术介绍
CPX-351是纳米级(100nm直径)低胆固醇脂质体制剂，其包含以5：1摩尔比率共包封的阿糖胞苷和柔红霉素(美国专利8,022,279和8,431,806)，其显示出离体和体内最佳协同作用。在几项临床前研究中观察到与常规游离药物组合相比的显著功效改善，更重要的是，与临床试验中的标准护理治疗相比，CPX-351提供了更高的完全缓解和存活率；一个在新诊断的老年急性骨髓性白血病(AML)中，另一个在成人第一次复发的AML患者中。目前治疗AML的方法是“标准护理”，或者称为“7+3”治疗。本专利技术聚焦于鉴别与目前的“标准护理”相比，用CPX-351治疗是有益的患者群体，并且提供考虑到个体患者中发生的癌症的异质性的分析。在CPX-351的临床试验中观察到的功效归因于1)以协同比率在循环中维持的升高的阿糖胞苷:柔红霉素浓度持续较长时间(因此避免拮抗比率)，2)CPX351在骨髓中的累积和持久性增加，以及3)与骨髓中正常细胞相比白血病细胞的完整CPX-351脂质体的选择性积累和细胞毒性。已显示CPX-351在高比例的高风险AML患者中从循环和骨髓快速清除白血病细胞是非常有效的，包括那些刚好在CPX-351治疗前对“标准治疗”7+3阿糖胞苷:柔红霉素治疗无效的患者，以及晚期成人急性淋巴细胞白血病(ALL)和骨髓增生异常综合征(MDS)患者。使用来自血液恶性肿瘤患者的新鲜分离的白血病细胞的短期离体细胞毒性测定有时可用于提供治疗剂对血液恶性肿瘤活性谱的指示。在此背景下，本专利技术人已经建立了从患有各种血液恶性肿瘤的患者中收集和纯化来自新鲜获得的血液样品的循环胚细胞的过程，所述血液恶性肿瘤包括：急性骨髓性白血病(AML)，ALL，慢性淋巴细胞性白血病(CLL)，慢性骨髓性白血病(CML)，骨髓增殖性肿瘤(MPN)和淋巴瘤，目的是评估个体患者中的抗肿瘤活性。申请人还为许多新的研究药物建立了抗增殖/细胞毒活性概况，根据血液恶性肿瘤的类型以及这些恶性肿瘤内患者亚型的特定表型概况分类。在这样的测定中，分别有50％和90％的生长抑制浓度(IC50和IC90)用于预测治疗敏感性是否反映可接受的药物浓度以及给定类别的患者对临床试验环境中的许可测试足够敏感的比例。因此，药物敏感性和亚群表型之间的相关性确定了通知患者选择的生物标志物。然而，历史上，纳米颗粒(例如，脂质体和纳米颗粒)药物制剂在离体针对癌细胞的细胞毒性的评估通常还没有进行，因为这样的制剂通常被设计为用作原位药物输注储库，载剂优先在癌症生长部位累积并且一旦到达缓慢释放游离药物，然后由癌细胞摄取。因为离体药物释放速率通常比体内观察到的慢得多，所以包封的抗癌药物的细胞毒性效力通常比它们的游离药物对应物观察到的低多个数量级，并且离体测试在体内预测中不太可靠。独特的是，就CPX-351而言，申请人已经证明人类白血病细胞通过能量依赖性机制在离体和体内摄取脂质体包封形式的阿糖胞苷和柔红霉素。一旦被吸收到细胞质内的空泡中，脂质体就会产生生物可利用的药物，从而导致细胞杀伤活性。这不仅确保递送协同摩尔比为5:1的阿糖胞苷:柔红霉素，而且还导致CPX-351离体细胞毒性效力(基于IC50值)，这些效力与游离药物相当，并且在一些情况下更有效，如本文所示。CPX-351对来自各种白血病状态的新鲜白血病胚细胞的离体细胞毒性的试验研究产生的IC50值低至50nM阿糖胞苷:10nM柔红霉素，其中培养基中的脂质体的药物释放是不可检测的(Tyner，J.等，Blood(2010)116：Abstract2886)。这证实了先前用白血病细胞系记录的完整CPX351脂质体的直接抗白血病活性与新鲜获自患者的胚细胞相关。这也可以解释基因型/表型细胞特征如何影响胚泡对CPX-351的敏感性，而与PK贡献无关。因此，与通常纳米颗粒组合物的性能形成对比，检查针对新鲜患者样品的离体CPX-351细胞毒性和/或新鲜患者样品对CPX-351的摄取提供了预测个体患者和群体类型中CPX-351的抗肿瘤活性的方式。传统的白血病标准治疗方案在40多年以来一直保持不变，并以其游离形式依次使用蒽环类抗生素加阿糖胞苷作为“7+3”疗法。虽然这种治疗是“标准的”，但在一些患者中存在副作用和/或预后不利。CPX-351可能为这类患者提供了一个积极的选择。因此，需要将患有血癌的患者分层，以便他们可以接受CPX-351作为适当的治疗。由于CPX-351和/或常规治疗方案可能并非对每个个体都是有效的，因此需要确定诊断测试、药剂和/或标志物，其可以有助于为血源性癌症的对象选择适当的治疗方案。
技术实现思路
一方面，本专利技术基于以下离体评估：CPX-351细胞毒性和/或从血液恶性肿瘤患者新鲜收获的各种胚细胞类型的摄取，包括来自主要血液癌症组如AML和CLL以及不同的疾病亚型的细胞。结果与体内治疗后的患者结果相关。血液癌症包括：急性骨髓性白血病(AML)，急性淋巴细胞性白血病(ALL)，慢性淋巴细胞性白血病(CLL)，慢性粒细胞白血病(CML)，骨髓增殖性肿瘤(MPN)和淋巴瘤。因此，在这方面，本专利技术涉及一种预测向人对象给予CPX-351将有效治疗对象中的血液癌症的概率的方法，该方法包括：在离体细胞培养中使来自所述对象的癌细胞暴露于用CPX-351的处理；和测量所述细胞对所述处理的响应；其中，其细胞显示对所述治疗响应的对象被鉴定为用CPX-351治疗可能有效的对象。响应性可以被测量为细胞毒性，例如使用IC50或IC90测定或通过测量CPX-351摄取。如此鉴定的对象以有效量给予CPX-351。第二方面，本专利技术涉及鉴定将从用更昂贵的CPX-351治疗替换标准护理中受益最多的对象，因此可能导致对这些对象使用CPX-351的监管批准。这些对象通过以下描述的某些遗传和表型特征来鉴定。在具体的实施方案中，用于鉴定的方法包括确定所述对象中Fms样酪氨酸受体激酶3(FLT-3)基因中是否存在突变，由此在所述FLT-3基因中表现出突变的对象被鉴定为受益于用CPX-351治疗的对象，并且在一些实施方案中，进一步包括向所述对象给予有效量的CPX-351和/或确定所述对象中核磷蛋白1(NPM-1)基因中是否存在突变，由此在所述NPM-1基因中表现出突变的对象被鉴定为将受益于CPX-351治疗的对象，并且在一些实施方案中，进一步包括向所述对象给予有效量的CPX-351和/或确定所述对象中的CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPα)基因中是否存在突变，由此在所述CEBPα基因中表现出突变的对象被鉴定为将受益于用CPX-351治疗的对象，并且在一些实施方案中，还包括向所述对象给予有效量的CPX-351。在FLT-3突变的情况下，突变可能是该基因的激活突变，特别是FLT3-IDT损伤。适用于包含CPX-351的治疗方案的生物标志物之一或生物标志物的组合(例如可指示患者(例如，患有白血病或处于患白血病的风本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.FLT抑制剂和CPX‑351的组合，用于在表现出FLT‑3激活突变的患有血液癌症的患者中增强用CPX‑351治疗的有效性的方法，所述方法包括与CPX‑351组合给予有效量的FLT‑3抑制剂，其中CPX‑351和FLT‑3抑制剂同时给予或其中CPX‑351在用FLT‑3抑制剂治疗前给予。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.11.11 US 62/254,1091.FLT抑制剂和CPX-351的组合，用于在表现出FLT-3激活突变的患有血液癌症的患者中增强用CPX-351治疗的有效性的方法，所述方法包括与CPX-351组合给予有效量的FLT-3抑制剂，其中CPX-351和FLT-3抑制剂同时给予或其中CPX-351在用FLT-3抑制剂治疗前给予。2.如权利要求1所述的组合，其中，所述CPX-351和FLT-3抑制剂在同一组合物中给予。3.如权利要求1所述的组合，其中，所述血液癌症选自：急性骨髓性白血病(AML)，急性淋巴细胞性白血病(ALL)，慢性淋巴细胞性白血病(CLL)，慢性粒细胞白血病(CML)，骨髓增殖性肿瘤(MPN)和淋巴瘤。4.如权利要求1-3中任一项所述的组合，其中，所述FLT-3抑制剂是喹扎替尼，米哚妥林，坦度替尼，索拉非尼，舒尼替尼，来他替尼，可瑞拉尼布，吉列替尼，AST-487，多维替尼或利尼法尼。5.在表现出FLT-3激活突变的患有血液癌症的患者中增强用CPX-351治疗的有效性的方法，所述方法包括与CPX-351组合给予有效量的FLT-3抑制剂，其中CPX-351和FLT-3抑制剂同时给予或其中CPX-351在用FLT-3抑制剂治疗之前给予。6.如权利要求5所述的方法，其中，所述CPX-351和FLT-3抑制剂在同一组合物中给予。7.如权利要求5所述的方法，其中，所述血液癌症选自：急性骨髓性白血病(AML)，急性淋巴细胞性白血病(ALL)，慢性淋巴细胞性白血病(CLL)，慢性粒细胞白血病(CML)，骨髓增殖性肿瘤(MPN)和淋巴瘤。8.如权利要求5-7中任一项所述的方法，其中，所述FLT-3抑制剂是喹扎替尼，米哚妥林，坦度替尼，索拉非尼，舒尼替尼，来他替尼，可瑞拉尼布，吉列替尼，AST-487，多维替尼或利尼法尼。9.确定患有血液癌症的人对象对用CPX-351治疗的易感性的方法，所述方法包括测定所述对象的生物样品以确定：a)所述对象中Fms样酪氨酸受体激酶3(FLT-3)基因是否存在突变；和/或b)所述对象中核磷蛋白1(NPM-1)基因是否存在突变；和/或c)所述对象中CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPα)基因是否存在突变；和/或d)所述对象的基因型为有利风险，中间期I，中间期II或不利风险。10.如权利要求9所述的方法，其中，所述血液癌症选自：急性骨髓性白血病(AML)，急性淋巴细胞性白血病(ALL)，慢性淋巴细胞性白血病(CLL)，慢性粒细胞白血病(CML)，骨髓增殖性肿瘤(MPN)和淋巴瘤。11.如权利要求9所述的方法，其中，所述生物样品包括血液，血清，血浆，唾液或胚细胞。12.如权利要求9-11中任一项所述的方法，其包括确定所述对象中Fms样酪氨酸受体激酶3(FLT-3)基因是否存在突变。13.如权利要求12所述的方法，其中，所述突变是FLT-3激活突变。14.如权利要求12所述的方法，其中，所述突变是FLT-3-ITD或FLT-3-TKD。15.如权利要求9-11中任一项所述的方法，其包括确定所述对象中核磷蛋白1(NPM1)基因是否存在突变。16.如权利要求9-11中任一项所述的方法，其包括确定所述对象中CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPα)基因是否存在突变。17.如权利要求9-11中任一项所述的方法，其包括将所述对象的基因型确定为有利风险，中间期I，中间期II或不利风险。18.确定患...

【专利技术属性】
技术研发人员：M·高登，P·塔蒂，J·泰纳，L·梅耶，
申请(专利权)人：塞拉特药物股份有限公司，俄勒冈健康与科学大学，
类型：发明
国别省市：美国,US