用于治疗和诊断自身免疫性疾病的组合使用的组合物和方法技术

本申请提供多种自身免疫性疾病的新的基因靶标、诊断方法和治疗疗法方案，所述自身免疫性疾病包括共同遗传和基因共享的小儿自身免疫性疾病。本申请例如基于确定患者是否在特定的基因中具有遗传变异来提供诊断或确定一种或多种自身免疫性疾病的易患性和为患有一种或多种自身免疫性疾病的患者确定治疗方案的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于治疗和诊断自身免疫性疾病的组合使用的组合物和方法优先权申请本申请要求2015年8月21日提交的美国临时申请62/208,383、和2016年8月8日提交的美国临时申请62/320,400的优先权，它们都全部并入本申请以作参考。基金声明本专利技术在美国国立卫生研究院的资金下完成，其中基金项目编号为DP3DK085708、RC1AR058606、U01HG006830、CA127334、和R01-HG006849。因此，美国政府享有本专利技术的权利。
本专利技术涉及遗传学、自身免疫和个体化给药的
更特别地，本专利技术提供多种自身免疫性疾病的新的基因靶标、诊断方法、和治疗疗法方案，所述疾病包括小儿自身免疫性疾病。
技术介绍
本说明书通篇引用了多篇出版物和专利，以便于描述本专利技术所属
的现状。这些引文各自并入本申请以作参考，如同全文记载于本文。本申请包括的某些图和表的彩色版本也已经公开于Y.R.Lietal，NatureMedicineAugust24，2015，在线出版doi：10.1038“backslash”nm.3933，以及公开于该出版物的补充材料中，那些图和表并入本申请以作参考。自身免疫性疾病影响多达7–10％生活在西半球的个体1，成为慢性病发病率和残疾的重要原因。高比率的自身免疫性疾病共病和家族聚集性暗示出，强的遗传倾向性可能导致了自身免疫性疾病易感性。对以下疾病的全基因组关联研究(GWAS)和聚焦免疫的精细定位研究已经在整个基因组上识别出数百自身免疫性疾病相关的单核苷酸多态性(SNPs)：自身免疫性甲状腺炎(AITD)2，牛皮癣(PSOR)3，幼年特发性关节炎(JIA)4，原发性胆汁性肝硬化(PBC)5，原发性硬化性胆管炎(PSC)6，类风湿性关节炎(RA)7，乳糜泻(CEL)8，炎症性肠病(IBD，其包括克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)9)，和多发性硬化(MS)10。这些研究和随之的荟萃分析(meta-analyses)表明超过一半的全基因组显著(GWS)(PGWS<5×10-8)自身免疫性疾病关联由至少两种明显不同的自身免疫性疾病共享11,12。但是，当应用于异质性疾病时，经典的荟萃分析方法面临局限，因为它们：1)当疾病相关的变异随性状不同而显示可变的影响规模或甚至可变的影响方向时具有有限的效力，2)可能在整个研究中受表型异质性和受试者招募偏好的影响，3)通常检查候选人名单或之前发现的来自单一疾病研究的地区，由此错过了识别出新关联的机会，特别是由于较稀有或具有较小影响规模的变异出现的新关联，4)不能针对群体分层和隐藏关联进行充分调整，和5)可能包含通过使用多个基因分型平台或研究地点带来的伪像(artifacts)。虽然新的研究已经以有限的方式融入了来自多种疾病的病例基因型13–15、以及几个地点已经出现了跨越多种自身免疫性疾病的独立GWAS研究(例如CLEC16A，首先发现于T1D16，随后发现于MS17，RA18,19，CD20，PBC21，JIA19，和AA22)，但是基因变体与一种疾病相关的程度可能与未经系统检查的其它自身免疫性疾病的风险相关。显然，得益于本专利技术，将会提供用于治疗这些基本的新治疗手段。
技术实现思路
根据本专利技术，提供了用于诊断和治疗自身免疫性疾病(AID)的新的基因标记，所述疾病包括例如，小儿自身免疫性疾病(pAID)。本申请讨论的自身免疫性疾病包括，例如以下的一种或多种：强直性脊柱炎(AS)，牛皮癣(PS或PSOR)，乳糜泻(CEL)，系统性红斑狼疮(SLE)，普通变异型免疫缺陷病(CVID)，炎症性肠病(IBD)，溃疡性结肠炎(UC)，I型糖尿病(T1D)，幼年特发性关节炎(JIA)，克罗恩病(CD)，斑秃(AA)，多发性硬化(MS)，原发性胆汁性肝硬化(PBC)，原发性硬化性胆管炎(PSC)，类风湿性关节炎(RA)，干燥综合征(SJO)，系统性硬化病(SSC)，脊柱关节病(SPA)，白癫风(VIT)，哮喘，或甲状腺炎(AITD，THY或TH)，以及几种其它疾病。例如，本申请包括用于诊断患者的一种或多种自身免疫性疾病(AID)的方法，其包括：a)从患者获得生物样品；b)化验来自样品的核酸以确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2-3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异与患者存在一种或多种AID相关：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2-3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX；和c)如果以下基因的一个或多个中存在遗传变异，则诊断患者患有一种或多种AID：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2-3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX。在一些实施方式中，所述方法包括确定在以下基因的至少5个中或以下基因的每一个中是否存在遗传变异，所述至少5个为例如至少10个、例如至少15个、例如至少20个、例如至少25个、例如至少30个、例如至少35个、例如至少40个：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于诊断患者的一种或多种自身免疫性疾病(AID)的方法，所述方法包括：a)从所述患者获得生物样品；b)化验来自所述样品的核酸，以确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2‑3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG和RBMX，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异与患者存在一种或多种AID相关：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2‑3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX；和c)如果以下基因的一个或多个中存在遗传变异，则诊断所述患者患有一种或多种AID：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2‑3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX。...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.08.21 US 62/208,383;2016.04.08 US 62/320,4001.用于诊断患者的一种或多种自身免疫性疾病(AID)的方法，所述方法包括：a)从所述患者获得生物样品；b)化验来自所述样品的核酸，以确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2-3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG和RBMX，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异与患者存在一种或多种AID相关：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2-3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX；和c)如果以下基因的一个或多个中存在遗传变异，则诊断所述患者患有一种或多种AID：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2-3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX。2.权利要求1的方法，其中所述方法包括确定在以下基因的至少5个、例如至少10个、例如至少15个、例如至少20个、例如至少25个、例如至少30个、例如至少35个、例如至少40个中或以下基因的每一个中是否存在遗传变异：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2-3，INS，LRRK2，SUOX，§EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX。3.权利要求1或2的方法，其中所述AID是以下疾病的一种或多种：强直性脊柱炎(AS)，牛皮癣(PS或PSOR)，乳糜泻(CEL)，系统性红斑狼疮(SLE)，普通变异型免疫缺陷病(CVID)，炎症性肠病(IBD)，溃疡性结肠炎(UC)，I型糖尿病(T1D)，幼年特发性关节炎(JIA)，克罗恩病(CD)，斑秃(AA)，多发性硬化(MS)，原发性胆汁性肝硬化(PBC)，原发性硬化性胆管炎(PSC)，类风湿性关节炎(RA)，干燥综合征(SJO)，系统性硬化病(SSC)，脊柱关节病(SPA)，白癫风(VIT)，哮喘，或甲状腺炎(AITD，THY或TH)。4.权利要求1、2或3的方法，其中所述患者是小儿患者。5.权利要求1、2或3的方法，其中所述患者是成人患者。6.权利要求1-5任一项的方法，其中所述遗传变异是单核苷酸变异(SNV)。7.权利要求1-6任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNM3，ANKRD30A，INS，NOD2，DAG1，SMAD3，ATG16L1，ZNF365，PTGER4，NKX2-3，ANKRD55，IL12B，LRRK2，IL5，SUOX，SBK1，ADCY7，IL2RA，TNFSF15，CD40LG，ZMIZ1，IL21，CARD9，和PSMG1。8.权利要求7的方法，其中所述方法包括确定在以下基因的至少5个、例如至少10个、例如至少15个、例如至少20个中或以下基因的每一个中是否存在遗传变异：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNM3，ANKRD30A，INS，NOD2，DAG1，SMAD3，ATG16L1，ZNF365，PTGER4，NKX2-3，ANKRD55，IL12B，LRRK2，IL5，SUOX，SBK1，ADCY7，IL2RA，TNFSF15，CD40LG，ZMIZ1，IL21，CARD9，和PSMG1。9.权利要求7或8的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：LPHN2，TNM3，ANKRD30A，ADCY7，和CD40LG。10.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL23R，TNM3，LRRK2，SBK1，IL2RA，ZMIZ1，IL21，和CARD9，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异表明所述患者罹患AS：IL23R，TNM3，LRRK2，SBK1，IL2RA，ZMIZ1，IL21，和CARD9。11.权利要求10的方法，其中所述方法进一步包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：CRB1，GPR35，CYTL3，IL12B，8q24.23，JAK2，FNBP1，和SMAD3。12.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL23R，PTPN22，TNM3，DAG1，ATG16L1，SUOX，SBK1，ADCY7，IL2RA，和ZMIZ1，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异表明所述患者罹患PS：IL23R，PTPN22，TNM3，DAG1，ATG16L1，SUOX，SBK1，ADCY7，IL2RA，和ZMIZ1。13.权利要求12的方法，其中所述方法进一步包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL10，TSSC1，IL5，IL2RA，ADCY7，FUT2，和TNFRSF6B。14.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：TNM3，DAG1，SBK1，IL2RA，C40LG，ZMIZ1，和IL21，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异表明所述患者罹患CEL：TNM3，DAG1，SBK1，IL2RA，C40LG，ZMIZ1，和IL21。15.权利要求14的方法，其中所述方法进一步包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL18R1，CYTL1，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，IKZF3，CD40LG，和RBMX。16.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法进一步包括确定是否存在PTPN22和TNM3的之一或两者中的遗传变异，其中PTPN22和TNM3的之一或两者中的遗传变异表明所述患者罹患SLE。17.权利要求16的方法，其中所述方法进一步包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL10，TSSC1，GPR35，JAK2，ZNF365，TYK2，和TNFRSF6B。18.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：LPHN2，TNM3，和IL21，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异表明所述患者罹患CVID：LPHN2，TNM3，和IL21。19.权利要求18的方法，其中所述方法进一步包括确定是否存在EFNB2和IKZF3的之一或两者中的遗传变异。20.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL23R，LPHN2，DAG1，PTGER4，SBK1，TNFSF15，CD40LG，IL21，CARD9，和PSMG1，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异表明所述患者罹患UC：IL23R，LPHN2，DAG1，PTGER4，SBK1，TNFSF15，CD40LG，IL21，CARD9，和PSMG1。21.权利要求20的方法，其中所述方法进一步包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL10，TSSC1，IL18R1，GPR35，CYTL1，IL12B，JAK2，NKX2，SMAD3，ATXN2L，IKZF3，和TNFRSF6B。22.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：PTPN22，INS，SUOX，IL2RA，和IL21，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异表明所述患者罹患T1D：PTPN22，INS，SUOX，IL2RA，和IL21。23.权利要求22的方法，其中所述方法进一步包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：CYTL1，8q24.23，TYK2，和FUT2。24.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：LPHN2，PTPN22，TNM3，ANKRD30A，ANKRD55，IL2RA，CD40LG，和IL21，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异表明所述患者罹患JIA：LPHN2，PTPN22，TNM3，ANKRD30A，ANKRD55，IL2RA，CD40LG，和IL21。25.权利要求24的方法，其中所述方法进一步包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：CYTL1，ERAP2，8q24.23，LURAP1L，FNBP1，EFNB2，IKZF3，TYK2，和RBMX。26.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL23R，PTPN22，DAG1，ATG16L1，PTGER4，ANKRD55，LRRK2，SBK1，ADCY7，IL2RA，TNFSF15，CD40LG，ZMIZ1，IL21，CARD9，和PSMG1，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异表明所述患者罹患CD：IL23R，PTPN22，DAG1，ATG16L1，PTGER4，ANKRD55，LRRK2，SBK1，ADCY7，IL2RA，TNFSF15，CD40LG，ZMIZ1，IL21，CARD9，和PSMG1。27.权利要求26的方法，其中所述方法进一步包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，CYTL1，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，FNBP1，ZNF365，NKX2，SMAD3，ATXN2L，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，和RBMX。28.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在IL2RA和IL21的之一或两者中的遗传变异，其中IL2RA和IL21的之一或两者中的遗传变异表明所述患者罹患AA。29.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：PTGER4，ANKRD55，IL2RA，CD40LG，和ZMIZ1，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异表明所述患者罹患MS：PTGER4，ANKRD55，IL2RA，CD40LG，和ZMIZ1。30.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在IL2A和IL21的之一或两者中的遗传变异，其中IL2A或IL21的之一或两者中的遗传变异表明所述患者罹患PSC。31.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：PTPN22，ANKRD55，IL2RA，和IL21，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异表明所述患者罹患RA：PTPN22，ANKRD55，IL2RA，和IL21。32.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在PTPN22和IL2RA的之一或两者中的遗传变异，其中PTPN22和IL2RA的之一或两者中的遗传变异表明所述患者罹患VIT。33.权利要求1-9任一项的方法，其中所述方法包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：PTPN22，TNM3，SBK1，IL2RA，和IL21，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异表明所述患者罹患THY：PTPN22，TNM3，SBK1，IL2RA，和IL21。34.权利要求33的方法，其中所述方法进一步包括确定是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL18R1，CYTL1，FNBP1，IKZF3，TYK2，和TNFRSF6B。35.前述权利要求任一项的方法，其中所述方法进一步包括基于在所述方法中识别出的遗传变异提供包括针对AID建议的疗法的报告。36.前述权利要求任一项的方法，其中所述方法进一步包括在确认患者的遗传变异之后对确诊的患者施用有效量的疗法，例如用以包含所述遗传变异的基因的相互作用网络内的蛋白质为靶标的分子进行治疗。37.权利要求36的方法，其中为所述确诊的患者规定有效量的一种或多种表11和12中列出的药剂。38.前述权利要求任一项的方法，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异位于表2a、2b、2c、或2e中列出的对应的染色体区域和单核苷酸多态性(SNP)位置：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2-3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX。39.确定受试者是否易感于发病一种或多种自身免疫性疾病(AID)的方法，所述方法包括：a)从所述受试者获得生物样品；b)化验来自所述样品的核酸以确定所述核酸中是否存在以下基因的一个或多个中的遗传变异：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2-3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX，其中以下基因的一个或多个中的遗传变异与受试者存在一种或多种AID有关：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2-3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX；和c)如果以下基因的一个或多个中存在遗传变异，则确定所述受试者易感于发病一种或多种AID：IL23R，LPHN2，PTPN22，TNFSF18，CRB1，IL10，TSSC1，IL18R1，ATG16L1，GPR35，DAG1，CYTL1，IL21，TNM3，PTGER4，ANKRD55，ERAP2，IL5，IL12B，8q24.23，JAK2，LURAP1L，TNFSF15，FNBP1，CARD9，IL2RA，ANKRD30A，ZNF365，ZMIZ1，NKX2-3，INS，LRRK2，SUOX，EFNB2，SMAD3，SBK1，ATXN2L，ADCY7，NOD2，IKZF3，TYK2，FUT2，TNFRSF6B，PSMG1，CD40LG，和RBMX。40.权利要求39的方法，其中所述方法包括确定在以下基因的至少5个、例如至少10个、例如至少15个、例如至少20个、例如至少25个、例如至少30个、例如至少35个、例如至少40个中或以下基...

【专利技术属性】
技术研发人员：H·哈克纳森，Y·R·李，B·基婷，
申请(专利权)人：费城儿童医院，
类型：发明
国别省市：美国,US