鲽形目鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1（ITS1）通用引物设计方法及应用技术
Heterosomata Soleidae fishes rDNA its 1 (ITS1) design method and application of universal primers
The present invention discloses heterosomata Soleidae fishes rDNA its 1 (ITS1) design method and application of universal primers. The beneficial effect of primer design method of this invention is based on rDNA its 1 (ITS1) 18S and rDNA two conserved 5.8S rDNA sequences, specific primers were obtained by ITS1 amplification of the rate of evolution is extremely strong, relatively fast, in which the basic tend to be similar, and in between it shows significant difference; the primers used for Soleidae fishes, high accuracy, overcomes the defect identification of shape features, solves the problem of confounding germplasm.
【技术实现步骤摘要】
鲽形目鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1（ITS1）通用引物设计方法及应用
本专利技术属于分子生物
，尤其是涉及鲽形目鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1（ITS1）通用引物设计方法及应用。
技术介绍
鳎科(Soleidae)体呈椭圆形，极为侧扁，两眼都位于身体的右侧，有些则位于左侧方，口小且不对称，上下颌不发达，有些鱼种的吻端下垂，盲侧的牙齿较为发达，有细齿带，腭骨则没有牙齿，前鳃盖骨缘外覆盖有皮膜或鳞片。鱼体外被有圆鳞、栉鳞或皮膜，侧线单一，背鳍起始于眼睛的上方，背鳍、臀鳍及尾鳍有些会相连，有些则分离。胸鳍小，或无胸鳍，腹鳍也很小，有些鱼的盲侧并无腹鳍，有时会与臀鳍相连。鳎科作为鲽形目鱼类最丰富的类群(约35属175种)，很多种类都具有非常重要的经济价值，但是迄今关于鳎科鱼类核糖体序列的报道极其罕见，其中关于其核糖体内转录间隔区1的研究更是空白。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供鲽形目鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1（ITS1）通用引物设计方法，该方法基于核糖体内转录间隔区1(ITS1)两端保守的18SrDNA和5.8SrDNA序列设计引物序列，所得的引物应用范围广，对...
【技术保护点】
鲽形目鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1（ITS1）通用引物设计方法，其特征在于：所述方法包括以下步骤：1)从Genbank获取鳎科鱼类18S rDNA和5.8S rDNA序列，利用ClustalXv1.83做序列的比对，分别在3’端和5’端找出保守序列，作为引物候选区；2)利用OLIGO v6软件对候选区序列进行分析，设定引物序列选择条件。
【技术特征摘要】
1.鲽形目鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1（ITS1）通用引物设计方法，其特征在于：所述方法包括以下步骤：1)从Genbank获取鳎科鱼类18SrDNA和5.8SrDNA序列，利用ClustalXv1.83做序列的比对，分别在3’端和5’端找出保守序列，作为引物候选区；2)利用OLIGOv6软件对候选区序列进行分析，设定引物序列选择条件。2.根据权利要求1所述的鲽形目鳎科鱼类核糖体内转录间隔区1（ITS1）通用引物设计方法，其特征在于：所述步骤2)中引物序列选择条件为：引物长度23-25bp左右，GC含量40％-65％，退火温度为55-60℃。3.权利要求2所述方法设计的通用引物，其特征在于：所述正向引物序列为：TCGCTACTACCGATTGGATGGTTTA，反向引物序列为：AAGCGACCCTCAGACAGGCGTAG。4.权利要求3所述通用引物在鉴别鳎科鱼类中的应用。5.根据...
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