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利用核糖体操纵子间区探针检测水生动物病原菌的方法技术

技术编号:2584929 阅读:302 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术公开了一种利用核糖体操纵子间区探针组成寡核苷酸微阵列检验多种能够导致水生动物传染病病原菌的方法,其技术原理为分子杂交-酶联免疫显色技术,属于细菌检测技术,其技术方案是用生物信息学方法设计特异性探针,包括设计筛选的34条用作探针的寡核苷酸序列以及与之配套的PCR和杂交反应条件。通过PCR扩增并用地高辛标记细菌16s-23srRNA基因间区序列,并用该PCR产物和一组特异性的寡核苷酸探针杂交,经酶联免疫显色显色后,可以从待测样品中,精确检测出是否存在水生动物传染病病原菌。该方法的优点是,省去了重复的细菌培养筛选环节,节约时间;分子杂交鉴定方法不受培养条件和细菌生理状态的影响,较生理生化鉴定方法更为准确。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种利用核糖体操纵子间区探针检测水生动物病原菌的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:(1)设计特异性寡核苷酸探针,用于寡核苷酸微阵列检测检测,所设计的特异性寡核苷酸探针序列如下:序列一:星状诺卡氏菌探针Nser2CGA AGAAGTCTAATTTCGGTA序列二:星状诺卡氏菌探针NSER1GGCAAACCATCAGAGCATG序列三:巴斯德菌属通用探针PFirc1TGTTCTTTAAAAAA(T/A)T(G/A)GAAACAAGCT G序列四:多杀巴斯德氏菌探针2Pmulii3AAGCGAAAGCAAAAGAGTGAAGCGA序列五:杀鱼巴斯德氏菌探针1Pmulii2CAATGAAGAGACAAAAAACCGAAATCC序列六:鮰鱼爱德华 氏菌探针Eict1ACCCCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGG序列七:鮰鱼爱德华氏菌探针2Eict2TTACAGCACGAAGTGAAACACCTTCG序列八:迟缓爱德华氏菌探针1Etar1GGTAATAA GGTATTGCAGTAAAGTC序列九:迟缓爱德华氏菌探针2Etar2ATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGA序列十:耶尔森氏菌属通用探针YerFip1TACAGCTGAAATTTACCCCGCC 序列十一:鲁氏耶尔森氏菌探针1YerFip2AGATGTACTGTCAGCAATGA(C/T)AAGACA序列十二:气单胞菌属通用探针1AF&Valgip1GCTGATTTAAAAAGTAGTTCTCAAACATTTGT 序列十三:杀鲑气单胞菌探针1AF&Valgip3AGCTACCCGGTTACCTGCGCGC序列十四:杀鲑气单胞菌探针2AsalValiprGCTCGCGCGCAGGTAACCGGGT序列十五:豚鼠气单胞菌探针1 AcavGlip1GCCGCTAGCCTCGCAGGCTCGG序列十六:豚鼠气单胞菌探针2AcavGlip2GCCTTTACGAAAATCATTGCGAA序列十七:温和气单胞菌探针1Asobculip1TAATG GCGCTCGGCCTCGCAG序列十八:温和气单胞菌探针2Asobculip2CGGCACTCGCCATTACCCAAAA序...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:黄熙泰侯艳梅刘寅张立怀郑泽军高旗利周浩董志珍李永君王玉玲魏晓娜霍蕾
申请(专利权)人:南开大学中华人民共和国天津出入境检验检疫局
类型:发明
国别省市:12[中国|天津]

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