凡纳滨对虾EST‑STR标记及其扩增引物、检测方法和应用技术

技术编号:17646309 阅读:77 留言:0更新日期:2018-04-08 02:38
本发明专利技术公开了一种凡纳滨对虾EST‑STR标记及其扩增引物、检测方法和应用。本发明专利技术利用从NCBI数据库获得的凡纳滨对虾EST序列,开发获得8个具有高度多态性的凡纳滨对虾EST‑STR标记,编号分别为Lv‑F2a、Lv‑F7a、Lv‑F8a、Lv‑F9a、Lv‑F30a、Lv‑F31a、Lv‑F36a和Lv‑F40a。本发明专利技术的凡纳滨对虾EST‑SSR标记可用于凡纳滨对虾遗传关系分析及分子标记辅助育种,为凡纳滨对虾遗传多样性研究及优良品种的辅助选育奠定基础。

Litopenaeus vannamei EST STR markers and primers, detection method and Application

【技术实现步骤摘要】
凡纳滨对虾EST-STR标记及其扩增引物、检测方法和应用
:本专利技术属于分子标记
,具体涉及凡纳滨对虾EST-STR标记及其扩增引物、检测方法和应用。
技术介绍
:凡纳滨对虾(Litopenaeusvannamei,俗称南美白对虾)养殖业是我国水产养殖的支柱性产业,目前我国凡纳滨对虾养殖年产量超过100万吨,占养殖对虾总产量的80%。但由于目前我国引进和繁育的凡纳滨对虾大多是人工繁育群体,容易引起遗传衰退。因此,良种选育是保障我国凡纳滨对虾养殖业可持续发展的重要举措。近年来,以分子标记为基础的分子标记辅助选育技术在水产育种中得到了广泛应用,加快了良种选育的进程。微卫星(microsatellite),又称为短串联重复序列(shorttandemrepeats,STRs)或简单重复序列(simplesequencerepeats,SSRs),是广泛分布于真核生物基因组,由2-6个核苷酸多次串联重复构成的长达十至几十个核苷酸的序列。由于微卫星标记具有杂合程度高、多态性丰富、重复性好、共显性遗传等优点,已广泛应用于群体遗传多样性研究、基因定位、遗传连锁图谱构建、种质鉴定和品种分类以本文档来自技高网...
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【技术保护点】
一种凡纳滨对虾EST‑STR标记,其特征在于,所述的EST‑STR标记编号为Lv‑F2a、Lv‑F7a、Lv‑F8a、Lv‑F9a、Lv‑F30a、Lv‑F31a、Lv‑F36a和Lv‑F40a;所述的Lv‑F2a的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述的Lv‑F7a的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述的Lv‑F8a的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;所述的Lv‑F9a的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;所述的Lv‑F30a的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;所述的Lv‑F31a的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;所述的Lv‑F36a的核苷酸序列如SEQ...

【技术特征摘要】
1.一种凡纳滨对虾EST-STR标记,其特征在于,所述的EST-STR标记编号为Lv-F2a、Lv-F7a、Lv-F8a、Lv-F9a、Lv-F30a、Lv-F31a、Lv-F36a和Lv-F40a;所述的Lv-F2a的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示;所述的Lv-F7a的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示;所述的Lv-F8a的核苷酸序列如SEQIDNO.3所示;所述的Lv-F9a的核苷酸序列如SEQIDNO.4所示;所述的Lv-F30a的核苷酸序列如SEQIDNO.5所示;所述的Lv-F31a的核苷酸序列如SEQIDNO.6所示;所述的Lv-F36a的核苷酸序列如SEQIDNO.7所示;所述的Lv-F40a的核苷酸序列如SEQIDNO.8所示。2.一种权利要求1所述的凡纳滨对虾EST-STR标记的扩增引物,其特征在于,所述的扩增引物包括:针对Lv-F2a位点:Lv-F2a-F:5’-CCCCAAAATCGTCTTTCCAA-3’;Lv-F2a-R:5’-GGTGGATTTAGGGAAGGCGTA-3’;针对Lv-F7a位点:Lv-F7a-F:5’-GAGGTGTTGAGGGAAGGTTGTG-3’;Lv-F7a-R:5’-GAGGCCAATTACGATTGTTTCA-3’;针对Lv-F8a位点:Lv-F8a-F:5’-TCGCACATAGTCAAAATGGCA-3’;Lv-F8a-R:5’-TGTGAGCCGTGCGAAAGTC-3’;针对Lv-F9a位点:Lv-F9a-F:5’-CTGCTGTTCGAGAAAGCTGTTC-3’;Lv-F9a-R:5’-TTTTGGGCGCTTTGAGATTC-3’;针对Lv-F30a位点:Lv-F30a-F:5’-GTCCCATCGCCGAGTTGA-3’;Lv-F30a-R:5’-TTTGAATCAGCGACACGACAG-3’;针对Lv-F31a位点:Lv-F31a-F:5’-CGCCAACGAATGTCTAAGAGC-3’;Lv-F31a-R:5’-GCAATATGCAAAATGCCTGTTC-3’;针对Lv-F36a位点:Lv-F36a-F:5’-G...

【专利技术属性】
技术研发人员:任春华江晓黄文陈廷胡超群
申请(专利权)人:中国科学院南海海洋研究所
类型:发明
国别省市:广东,44

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